MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Actinobacillus suis H91-0380 chromosome

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018690	ATTTAA	2	12	3685	3696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018690	TTTTAG	2	12	4292	4303	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018690	AAATTT	2	12	36122	36133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018690	TAAATT	2	12	54270	54281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018690	ATTTAT	2	12	59451	59462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018690	ATTTCT	2	12	107499	107510	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018690	TTTTAT	2	12	186864	186875	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018690	AATTGA	2	12	205185	205196	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018690	TTCGTT	2	12	236431	236442	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018690	TTTTGA	2	12	283911	283922	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018690	CGAAGG	2	12	284736	284747	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018690	TGAAAT	2	12	287987	287998	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018690	ACAAAG	2	12	288942	288953	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018690	AACCTC	2	12	289191	289202	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018690	TGTTTA	2	12	359746	359757	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018690	TTTTTA	2	12	363092	363103	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018690	TAAAAA	2	12	378656	378667	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018690	TTTATT	2	12	386122	386133	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018690	AGTTTT	2	12	444510	444521	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018690	AGAAAA	2	12	446940	446951	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018690	TAAAAA	2	12	486805	486816	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018690	TACAAA	2	12	492726	492737	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018690	TAAAAA	2	12	524680	524691	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018690	GTTTTT	2	12	621624	621635	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018690	TTATAT	2	12	639172	639183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018690	TTTTTG	2	12	654645	654656	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018690	ATTTTA	2	12	719104	719115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018690	ATAAAA	2	12	748564	748575	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018690	TTTTAA	2	12	764994	765005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018690	AACAAG	2	12	772556	772567	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018690	TCATTA	2	12	774652	774663	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018690	CTTTTT	2	12	796425	796436	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018690	TTTTAT	2	12	804316	804327	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018690	TCATAA	2	12	810412	810423	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018690	TTAAAA	2	12	810928	810939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018690	TTTGTT	2	12	829563	829574	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018690	GATCGA	2	12	832754	832765	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018690	TAAAAA	2	12	846182	846193	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018690	TAGAAG	2	12	847488	847499	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018690	AAGAAA	2	12	847530	847541	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018690	CCTTTC	2	12	856208	856219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018690	CAACCG	2	12	879655	879666	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018690	TTTCAT	2	12	924155	924166	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018690	TAAATG	2	12	928616	928627	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018690	TTTATT	2	12	932892	932903	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018690	ATAAAA	2	12	974230	974241	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018690	ATCAAT	2	12	986963	986974	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018690	TCTTAT	2	12	999497	999508	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018690	TTTAAA	2	12	1006749	1006760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018690	TCCCCT	2	12	1017271	1017282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_018690	TTATTT	2	12	1043634	1043645	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018690	TTATAA	2	12	1072628	1072639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018690	TTATTT	2	12	1098421	1098432	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018690	ATATAA	2	12	1103589	1103600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018690	TAATTT	2	12	1108154	1108165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018690	AATTTA	2	12	1119907	1119918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018690	TGTCAA	2	12	1126813	1126824	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018690	TTCTTA	2	12	1189612	1189623	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018690	CTTTGA	2	12	1200610	1200621	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018690	TGAATA	2	12	1231420	1231431	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018690	TAAAAT	2	12	1256007	1256018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018690	TCGCTA	2	12	1325310	1325321	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018690	ATTAAA	2	12	1335839	1335850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018690	CTTATA	2	12	1353322	1353333	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_018690	TTGCCA	2	12	1356151	1356162	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018690	TTAATT	2	12	1362227	1362238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018690	GAATAA	2	12	1362264	1362275	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018690	TAAATT	2	12	1394530	1394541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018690	TTAAAA	2	12	1425845	1425856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018690	GATAGT	2	12	1425912	1425923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018690	AGATAA	2	12	1455000	1455011	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018690	TGAGGC	2	12	1521823	1521834	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_018690	TCTTTG	2	12	1522071	1522082	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_018690	ATTTCA	2	12	1523027	1523038	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_018690	GCCTTC	2	12	1526384	1526395	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018690	TCAAAA	2	12	1527210	1527221	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018690	TTATTT	2	12	1573001	1573012	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018690	TAAATA	2	12	1614226	1614237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018690	TTTAAC	2	12	1622752	1622763	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_018690	ACAGTC	2	12	1632798	1632809	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018690	TTTCTG	2	12	1639270	1639281	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_018690	AAAAAC	2	12	1647569	1647580	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018690	AATAAA	2	12	1678453	1678464	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018690	GCAAAA	2	12	1713673	1713684	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018690	TTATTT	2	12	1716743	1716754	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018690	TTGTAA	2	12	1727873	1727884	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018690	ATAGCT	2	12	1736651	1736662	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_018690	CTAAAG	2	12	1774654	1774665	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018690	ATGAAA	2	12	1798320	1798331	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018690	TCTTTG	2	12	1817618	1817629	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018690	ATTTCA	2	12	1818574	1818585	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018690	GCCTTC	2	12	1821931	1821942	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_018690	TCAAAA	2	12	1822758	1822769	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_018690	TATTTT	2	12	1832330	1832341	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018690	TCTTTA	2	12	1857501	1857512	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018690	ATTCGT	2	12	1862081	1862092	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_018690	TATTTT	2	12	1868080	1868091	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018690	TATTAA	2	12	1871039	1871050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018690	AAAAAC	2	12	1908609	1908620	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_018690	TTTGCA	2	12	1937098	1937109	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_018690	TTGTCC	2	12	1948246	1948257	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018690	CACAAA	2	12	2002235	2002246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018690	GCAAAG	2	12	2048260	2048271	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_018690	TTTTGA	2	12	2058537	2058548	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018690	CGAAGG	2	12	2059362	2059373	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_018690	TGAAAT	2	12	2062613	2062624	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018690	ACAAAG	2	12	2063568	2063579	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_018690	AACCTC	2	12	2063815	2063826	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018690	GGTAGT	2	12	2088900	2088911	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018690	TTTTGA	2	12	2171003	2171014	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018690	CGAAGG	2	12	2171828	2171839	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_018690	TGAAAT	2	12	2175079	2175090	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018690	TTTGCT	2	12	2237555	2237566	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_018690	TTTTAA	2	12	2256798	2256809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018690	TAAAAG	2	12	2285847	2285858	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018690	ATAAAA	2	12	2349202	2349213	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018690	AAATAT	2	12	2377511	2377522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018690	TAGGTA	2	12	2388027	2388038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018690	TTTTGA	2	12	2391183	2391194	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018690	CGAAGG	2	12	2392008	2392019	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_018690	TGAAAT	2	12	2395366	2395377	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018690	ACAAAG	2	12	2396321	2396332	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_018690	TCAGCC	2	12	2396567	2396578	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
124	NC_018690	ATCATA	2	12	2448051	2448062	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_018690	TTTTTA	2	12	2460152	2460163	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.