MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Actinobacillus suis H91-0380 chromosome

Total Repeats: 1085

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018690	TAATTT	2	12	1108154	1108165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_018690	TCGAAA	2	12	1111278	1111289	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407692589
503	NC_018690	CAGCAA	2	12	1111867	1111878	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407692589
504	NC_018690	CTAAAT	2	12	1114015	1114026	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407692593
505	NC_018690	AAAGAT	2	12	1116141	1116152	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407692595
506	NC_018690	TGAATA	2	12	1116368	1116379	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407692595
507	NC_018690	TTTGTT	2	12	1116447	1116458	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407692595
508	NC_018690	CAATCA	2	12	1118277	1118288	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407692597
509	NC_018690	AATTTA	2	12	1119907	1119918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_018690	TGGTGC	2	12	1121071	1121082	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	407692599
511	NC_018690	CTCTTG	2	12	1125984	1125995	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407692605
512	NC_018690	TGTCAA	2	12	1126813	1126824	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
513	NC_018690	CAATAT	2	12	1127221	1127232	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407692606
514	NC_018690	TTTTTC	2	12	1127426	1127437	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407692606
515	NC_018690	TTCACA	2	12	1129721	1129732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407692608
516	NC_018690	ATTTTG	2	12	1130358	1130369	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407692608
517	NC_018690	CTTTAT	2	12	1133629	1133640	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407692610
518	NC_018690	AGGTAA	2	12	1137130	1137141	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407692612
519	NC_018690	ATTCAC	2	12	1137841	1137852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407692613
520	NC_018690	GCAGAT	2	12	1142255	1142266	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407692615
521	NC_018690	ACGTAA	2	12	1145632	1145643	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407692617
522	NC_018690	GTACTT	2	12	1145832	1145843	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407692618
523	NC_018690	CCGGTG	2	12	1146574	1146585	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	407692618
524	NC_018690	GAAGGT	2	12	1149191	1149202	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	407692621
525	NC_018690	ACAAGC	2	12	1150003	1150014	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407692622
526	NC_018690	CAATCG	2	12	1158989	1159000	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407692630
527	NC_018690	GCATCA	2	12	1161875	1161886	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407692634
528	NC_018690	CGATAA	2	12	1162199	1162210	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407692634
529	NC_018690	ATTGCG	2	12	1164722	1164733	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407692637
530	NC_018690	GGCTTA	2	12	1166148	1166159	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407692638
531	NC_018690	CACAAA	2	12	1170609	1170620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407692641
532	NC_018690	CTTCAA	2	12	1172821	1172832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407692643
533	NC_018690	TAACGA	2	12	1178526	1178537	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407692647
534	NC_018690	GGCTTA	2	12	1178644	1178655	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407692647
535	NC_018690	GAAAAA	2	12	1180870	1180881	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407692648
536	NC_018690	CCGCTT	2	12	1182834	1182845	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	407692652
537	NC_018690	CAGCTC	11	66	1186090	1186155	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	407692655
538	NC_018690	AATCGC	2	12	1189145	1189156	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407692659
539	NC_018690	TTCTTA	2	12	1189612	1189623	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
540	NC_018690	TATTGG	2	12	1189851	1189862	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407692661
541	NC_018690	TTGATA	2	12	1190692	1190703	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407692662
542	NC_018690	GCTAAA	2	12	1192564	1192575	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407692664
543	NC_018690	AAATCC	2	12	1198681	1198692	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407692670
544	NC_018690	CTTTGA	2	12	1200610	1200621	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
545	NC_018690	GCAACT	2	12	1204373	1204384	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407692675
546	NC_018690	TTCACG	2	12	1208945	1208956	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407692679
547	NC_018690	TACGAT	2	12	1210719	1210730	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407692680
548	NC_018690	TGCGTT	2	12	1223786	1223797	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407692692
549	NC_018690	TGAATA	2	12	1231420	1231431	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_018690	GAAACA	2	12	1232150	1232161	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407692702
551	NC_018690	GTTACC	2	12	1232549	1232560	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407692703
552	NC_018690	TCAAAT	2	12	1236568	1236579	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407692707
553	NC_018690	CTGTTG	2	12	1237335	1237346	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407692707
554	NC_018690	GCAAGG	2	12	1237544	1237555	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	407692708
555	NC_018690	TTCACT	2	12	1240523	1240534	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407692709
556	NC_018690	GATATT	2	12	1246296	1246307	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407692716
557	NC_018690	CCCTAA	2	12	1249637	1249648	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	407692718
558	NC_018690	TTTAAG	2	12	1251873	1251884	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407692720
559	NC_018690	ATAATC	2	12	1253301	1253312	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407692722
560	NC_018690	GTACAA	2	12	1254801	1254812	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407692723
561	NC_018690	TCGTCT	2	12	1255080	1255091	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407692724
562	NC_018690	TTAAAT	2	12	1255891	1255902	50 %	50 %	0 %	0 %	407692724
563	NC_018690	TAAAAT	2	12	1256007	1256018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_018690	AGGCGA	2	12	1258063	1258074	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	407692727
565	NC_018690	GCCTGC	2	12	1260108	1260119	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407692729
566	NC_018690	CCATCC	2	12	1277291	1277302	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	407692743
567	NC_018690	CACAAA	2	12	1279115	1279126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407692744
568	NC_018690	ACCTAA	2	12	1279996	1280007	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407692746
569	NC_018690	CTTACA	2	12	1282960	1282971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407692748
570	NC_018690	ATTAGG	2	12	1290551	1290562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407692756
571	NC_018690	AAGTTA	2	12	1293059	1293070	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407692758
572	NC_018690	AAAAAT	2	12	1293456	1293467	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407692758
573	NC_018690	ACCTAG	2	12	1294087	1294098	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407692759
574	NC_018690	CGGCTA	2	12	1296505	1296516	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407692760
575	NC_018690	CTGTTG	2	12	1296875	1296886	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407692760
576	NC_018690	CCTGAA	2	12	1297087	1297098	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407692760
577	NC_018690	TTTTCT	2	12	1305010	1305021	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407692764
578	NC_018690	GAACAA	2	12	1307627	1307638	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407692766
579	NC_018690	TTAGCA	2	12	1308114	1308125	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407692767
580	NC_018690	TTAATT	2	12	1308543	1308554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407692767
581	NC_018690	TCGTCC	2	12	1319628	1319639	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	407692779
582	NC_018690	GAAGTA	2	12	1321150	1321161	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407692781
583	NC_018690	CCCATT	2	12	1324659	1324670	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	407692784
584	NC_018690	TCGCTA	2	12	1325310	1325321	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_018690	CAACGC	2	12	1326140	1326151	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	407692785
586	NC_018690	ACTAAT	2	12	1326308	1326319	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407692785
587	NC_018690	GCCATT	2	12	1335575	1335586	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407692795
588	NC_018690	ATTAAA	2	12	1335839	1335850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_018690	GGTAAA	2	12	1340773	1340784	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407692800
590	NC_018690	ACCTTT	2	12	1344037	1344048	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407692804
591	NC_018690	TTTTCG	2	12	1345589	1345600	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407692805
592	NC_018690	TAAACA	2	12	1346818	1346829	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407692806
593	NC_018690	TAATTG	2	12	1351581	1351592	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407692813
594	NC_018690	CTTATA	2	12	1353322	1353333	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
595	NC_018690	CAATTA	2	12	1354820	1354831	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407692816
596	NC_018690	AGCACT	2	12	1355025	1355036	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407692816
597	NC_018690	TTGCCA	2	12	1356151	1356162	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_018690	TGTTTG	2	12	1359461	1359472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407692820
599	NC_018690	ACTAAT	2	12	1361304	1361315	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407692821
600	NC_018690	TTAATT	2	12	1362227	1362238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_018690	GAATAA	2	12	1362264	1362275	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_018690	CTTTTT	2	12	1366701	1366712	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407692828
603	NC_018690	CCCAAG	2	12	1368790	1368801	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	407692831
604	NC_018690	TGCAAT	2	12	1374983	1374994	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407692838
605	NC_018690	GTTGCA	2	12	1375999	1376010	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407692839
606	NC_018690	TCTTTT	2	12	1376416	1376427	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407692839
607	NC_018690	GCTCCG	2	12	1376708	1376719	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407692839
608	NC_018690	CACTAA	2	12	1378603	1378614	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407692841
609	NC_018690	GAACAA	2	12	1389117	1389128	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407692849
610	NC_018690	TAAATT	2	12	1394530	1394541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_018690	GCCACC	2	12	1395682	1395693	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	407692855
612	NC_018690	CCGTTT	2	12	1403821	1403832	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407692863
613	NC_018690	ATCTTT	2	12	1405026	1405037	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407692864
614	NC_018690	GCGATT	2	12	1409688	1409699	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407692867
615	NC_018690	GCAATT	2	12	1414351	1414362	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407692872
616	NC_018690	TTCGCA	2	12	1418737	1418748	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407692875
617	NC_018690	ACGGTG	2	12	1419742	1419753	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407692877
618	NC_018690	CTAAGT	2	12	1420932	1420943	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407692877
619	NC_018690	CGGTAA	2	12	1422256	1422267	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407692878
620	NC_018690	AAAGCA	2	12	1424408	1424419	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407692881
621	NC_018690	TTAAAA	2	12	1425845	1425856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_018690	GATAGT	2	12	1425912	1425923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_018690	TGAATT	2	12	1428832	1428843	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407692886
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625	NC_018690	AATTTA	2	12	1436083	1436094	50 %	50 %	0 %	0 %	407692893
626	NC_018690	GGTTTC	2	12	1437335	1437346	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407692895
627	NC_018690	TCCGGA	2	12	1442060	1442071	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407692901
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629	NC_018690	TATCGG	2	12	1446533	1446544	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407692906
630	NC_018690	CGGCTT	2	12	1450112	1450123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407692907
631	NC_018690	TTCGCT	2	12	1454698	1454709	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407692910
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633	NC_018690	GGCTAT	2	12	1460499	1460510	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407692915
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718	NC_018690	TTCAAC	2	12	1648559	1648570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407693069
719	NC_018690	AAACGC	2	12	1649209	1649220	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407693070
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834	NC_018690	AACTCA	2	12	1871100	1871111	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407693256
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