MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC429

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018689	ATAATT	2	12	727	738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018689	GATAGA	2	12	13000	13011	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018689	TAATTT	2	12	18386	18397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018689	TTTAAT	2	12	24527	24538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018689	GGAACA	2	12	42232	42243	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018689	AATAGT	2	12	50981	50992	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018689	TATATT	2	12	61815	61826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018689	AAATAC	2	12	69103	69114	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018689	GTTTTT	2	12	71130	71141	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018689	TACAAA	2	12	82938	82949	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018689	TTTTAA	2	12	96681	96692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018689	TGATAA	2	12	103391	103402	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018689	TATCAT	2	12	103433	103444	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018689	AAATAC	2	12	112445	112456	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018689	GAATAT	2	12	122389	122400	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018689	TATTAA	2	12	125596	125607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018689	AGCTAG	2	12	126617	126628	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018689	TTCAAT	2	12	126786	126797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018689	ATTTTT	2	12	130152	130163	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018689	ACATTA	2	12	139482	139493	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018689	CTTTTA	2	12	143883	143894	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018689	ACCAGA	2	12	149448	149459	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018689	TCATAC	2	12	152025	152036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018689	ACTTAA	2	12	156539	156550	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018689	TAAAAA	2	12	164693	164704	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018689	TGTATT	2	12	181702	181713	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018689	GGTAAT	2	12	194342	194353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018689	ATTTTA	2	12	198821	198832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018689	TAATTA	2	12	203746	203757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018689	ATTTAA	2	12	210341	210352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018689	TATATC	2	12	214056	214067	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018689	TTAAGT	2	12	214593	214604	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018689	TAATTA	2	12	214788	214799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018689	CTTGTG	2	12	216848	216859	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018689	TAAATT	2	12	217436	217447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018689	TAAAAA	2	12	225960	225971	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018689	CCATCA	2	12	227552	227563	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018689	ATATAA	2	12	231747	231758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018689	TCTCAC	2	12	232973	232984	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018689	CGAGAC	2	12	233133	233144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018689	TTTAAT	2	12	233201	233212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018689	ATTATG	2	12	235725	235736	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018689	TTTAAT	2	12	235889	235900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018689	TTTAAT	2	12	237404	237415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018689	CTTCCT	2	12	241181	241192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018689	CTTCCT	2	12	242269	242280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_018689	TTTAAT	2	12	243842	243853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018689	CAAGGA	2	12	245044	245055	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018689	TGACAT	2	12	268782	268793	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018689	ATTAAC	2	12	268852	268863	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018689	ATTGAT	2	12	269656	269667	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018689	ACCAAA	2	12	302727	302738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018689	AAGAAA	2	12	307069	307080	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018689	ATGTAT	2	12	313962	313973	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018689	AAAGAT	2	12	314471	314482	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018689	AGATTA	2	12	320915	320926	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018689	ATTTAA	2	12	342847	342858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018689	AATAGA	2	12	351301	351312	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018689	CAATGA	2	12	351808	351819	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018689	GCATAT	2	12	351928	351939	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018689	TTACTA	2	12	355205	355216	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_018689	AATTTT	2	12	358024	358035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018689	ATTTGA	2	12	361395	361406	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018689	AAATGT	2	12	411411	411422	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018689	TGTTGA	2	12	418492	418503	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018689	TTATTT	2	12	426861	426872	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.