MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC429

Total Repeats: 529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018689	AATA	2	8	767	774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018689	CTTC	2	8	1099	1106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018689	TAAT	2	8	1125	1132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018689	TTTA	2	8	7423	7430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018689	TCTA	2	8	8842	8849	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018689	TTAC	2	8	9025	9032	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018689	GGTT	2	8	16061	16068	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018689	TTAG	2	8	16997	17004	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018689	ATTA	2	8	17035	17042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018689	AAAG	2	8	17855	17862	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018689	AGGC	2	8	17929	17936	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018689	ATGA	2	8	19818	19825	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018689	ATTT	2	8	19934	19941	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018689	AAAT	2	8	21573	21580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018689	TAAG	2	8	21706	21713	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018689	GATA	2	8	23202	23209	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018689	CAAA	2	8	24265	24272	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_018689	ATTT	2	8	24343	24350	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018689	AGGA	2	8	24739	24746	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018689	ATAA	2	8	24765	24772	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018689	GATA	2	8	24873	24880	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018689	GTTT	2	8	26994	27001	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018689	TTAT	2	8	28232	28239	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018689	TCTT	2	8	28371	28378	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018689	ATGA	2	8	28383	28390	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018689	ATTT	2	8	28413	28420	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018689	ACAT	2	8	30049	30056	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_018689	TGTA	2	8	30140	30147	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018689	TAAA	2	8	30338	30345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018689	ATTT	2	8	30423	30430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018689	AAAT	2	8	30740	30747	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018689	TAAA	2	8	30830	30837	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018689	TGCC	2	8	31082	31089	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018689	TTTG	2	8	31218	31225	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018689	GAAT	2	8	31295	31302	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018689	GACT	2	8	31317	31324	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018689	TACA	2	8	32440	32447	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018689	TAAA	2	8	32741	32748	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018689	GAAT	2	8	33013	33020	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018689	ACAT	2	8	33581	33588	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018689	AGGA	2	8	33699	33706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018689	TTAT	3	12	33742	33753	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018689	ATTT	2	8	33825	33832	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018689	TTTA	2	8	33857	33864	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018689	TAAA	2	8	34283	34290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018689	GTAT	2	8	36390	36397	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018689	TACA	2	8	36562	36569	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_018689	AATT	2	8	38037	38044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018689	TTTA	2	8	38105	38112	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018689	GTAA	2	8	38153	38160	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018689	CTTT	2	8	39578	39585	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_018689	ATAA	2	8	39691	39698	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018689	TATT	2	8	39763	39770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018689	TTCT	2	8	42257	42264	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_018689	GATT	2	8	42632	42639	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018689	AAGT	2	8	49486	49493	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018689	GTTT	2	8	50575	50582	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018689	GAAA	2	8	50667	50674	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018689	ATGA	2	8	50765	50772	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018689	ATAG	2	8	50891	50898	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018689	AAAT	2	8	53092	53099	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018689	CATT	2	8	53286	53293	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018689	AATT	2	8	54831	54838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018689	TAAA	2	8	57578	57585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018689	ATAG	2	8	57618	57625	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018689	GAAT	2	8	57739	57746	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018689	TAAT	2	8	57762	57769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018689	ATAC	2	8	57883	57890	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_018689	TACT	2	8	60034	60041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_018689	ATTT	2	8	61895	61902	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018689	GGAA	2	8	67085	67092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018689	CATC	2	8	69216	69223	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018689	GATG	2	8	70854	70861	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018689	ATCT	2	8	73546	73553	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018689	ACAT	2	8	75248	75255	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_018689	GATA	2	8	75258	75265	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018689	AGGA	2	8	75366	75373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018689	GATG	2	8	75500	75507	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018689	CTTA	2	8	76772	76779	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_018689	TATT	2	8	76790	76797	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018689	GACA	2	8	76855	76862	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_018689	GAAA	2	8	77075	77082	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018689	GAAA	2	8	79125	79132	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018689	ATTC	2	8	81018	81025	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_018689	TTAT	2	8	81083	81090	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018689	ATTT	2	8	81198	81205	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018689	ATTT	2	8	81244	81251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018689	TTTA	2	8	81253	81260	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018689	TAAG	2	8	82898	82905	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018689	ATCA	2	8	84434	84441	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_018689	AAAC	2	8	85100	85107	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_018689	GTAT	2	8	85220	85227	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018689	TATT	2	8	85271	85278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018689	TTAG	2	8	85508	85515	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018689	CTAC	2	8	85533	85540	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_018689	AAAT	2	8	89165	89172	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018689	ATTT	2	8	89187	89194	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018689	TTTA	2	8	91951	91958	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018689	CATT	2	8	91963	91970	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_018689	ATTT	2	8	92195	92202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018689	ATTA	2	8	93437	93444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018689	TCCT	2	8	94252	94259	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_018689	GGCA	2	8	94970	94977	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_018689	CAAA	2	8	96299	96306	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_018689	ATTA	2	8	96373	96380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018689	GTTG	2	8	96724	96731	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018689	ATTA	2	8	96753	96760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018689	CATT	2	8	97161	97168	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_018689	AAAT	2	8	97203	97210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018689	GTAT	2	8	101007	101014	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018689	GATT	2	8	101077	101084	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018689	TCTT	2	8	101090	101097	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_018689	TATT	2	8	102729	102736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018689	TAAT	2	8	102896	102903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018689	AATT	2	8	103190	103197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018689	AACC	2	8	103219	103226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_018689	TACT	2	8	103286	103293	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_018689	ACTT	2	8	103376	103383	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_018689	TATT	2	8	104563	104570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018689	TCTT	2	8	104891	104898	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_018689	ATTC	2	8	106060	106067	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_018689	ATTT	2	8	107203	107210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018689	TTAA	2	8	107283	107290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018689	TTTA	2	8	108322	108329	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018689	AAAC	2	8	108759	108766	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_018689	TAAA	2	8	108930	108937	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018689	ACTT	2	8	111068	111075	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_018689	CTAC	2	8	111145	111152	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_018689	AATT	2	8	111387	111394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018689	ATTT	2	8	112329	112336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018689	ATAA	2	8	112467	112474	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018689	TTTA	2	8	112640	112647	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018689	TAAT	2	8	112747	112754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018689	ATCA	2	8	112951	112958	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_018689	CGTC	2	8	114223	114230	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_018689	TCTA	2	8	114343	114350	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_018689	TGAT	2	8	114474	114481	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018689	TCAT	2	8	117080	117087	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_018689	CTAC	2	8	117237	117244	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_018689	TACT	2	8	117522	117529	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_018689	AGAA	2	8	117673	117680	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018689	CTTT	2	8	117764	117771	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_018689	TAGT	2	8	119067	119074	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018689	TGCT	2	8	119075	119082	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_018689	TAAA	2	8	122132	122139	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018689	TATT	2	8	122485	122492	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018689	CTTC	2	8	124305	124312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_018689	ATTG	2	8	124350	124357	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018689	ATAC	2	8	124674	124681	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_018689	TCAC	2	8	125567	125574	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_018689	ATTA	2	8	125579	125586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018689	CTTT	2	8	128521	128528	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_018689	CTAT	2	8	128688	128695	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_018689	AACT	2	8	130094	130101	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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