MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC429

Total Repeats: 5981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018689	AGG	2	6	11	16	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018689	TTA	2	6	50	55	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702825
3	NC_018689	GAT	3	9	113	121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702825
4	NC_018689	TGA	2	6	172	177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702825
5	NC_018689	AGA	2	6	208	213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702825
6	NC_018689	TTG	2	6	266	271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702825
7	NC_018689	ATA	2	6	309	314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702825
8	NC_018689	TAA	2	6	321	326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702825
9	NC_018689	ACG	2	6	402	407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018689	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018689	TAA	2	6	507	512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702826
12	NC_018689	TAT	2	6	546	551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702826
13	NC_018689	AAG	2	6	574	579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702826
14	NC_018689	ATT	2	6	819	824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018689	GTA	2	6	851	856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018689	AAC	2	6	861	866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018689	TAA	2	6	920	925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018689	CTT	2	6	1019	1024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018689	ACT	2	6	1043	1048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018689	AGA	2	6	1294	1299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702827
21	NC_018689	GGC	2	6	1361	1366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407702827
22	NC_018689	AAG	2	6	1473	1478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702827
23	NC_018689	TAC	2	6	1581	1586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702827
24	NC_018689	CAC	2	6	1635	1640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407702827
25	NC_018689	CTC	2	6	1692	1697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702827
26	NC_018689	ATC	2	6	1939	1944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702827
27	NC_018689	AGA	3	9	1951	1959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702827
28	NC_018689	AGA	2	6	1987	1992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702827
29	NC_018689	CAG	2	6	1998	2003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407702827
30	NC_018689	AAG	2	6	2037	2042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702827
31	NC_018689	CAT	2	6	2064	2069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702827
32	NC_018689	GGA	2	6	2231	2236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407702827
33	NC_018689	GTA	2	6	2241	2246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702827
34	NC_018689	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702827
35	NC_018689	CAA	2	6	2477	2482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702827
36	NC_018689	AAG	2	6	2502	2507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702827
37	NC_018689	GAA	2	6	2725	2730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702827
38	NC_018689	TTG	2	6	2799	2804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702827
39	NC_018689	GAA	2	6	2896	2901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702827
40	NC_018689	TGG	2	6	2929	2934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407702827
41	NC_018689	AGA	2	6	2998	3003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702827
42	NC_018689	GAA	2	6	3005	3010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702827
43	NC_018689	ATT	2	6	3044	3049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702827
44	NC_018689	ATT	2	6	3081	3086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702827
45	NC_018689	TGT	2	6	3103	3108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702827
46	NC_018689	ATT	2	6	3110	3115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702827
47	NC_018689	CGC	2	6	3323	3328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407702827
48	NC_018689	GAA	2	6	3338	3343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702827
49	NC_018689	TCT	2	6	3361	3366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702827
50	NC_018689	TGA	2	6	3379	3384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702827
51	NC_018689	TTA	2	6	3411	3416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702827
52	NC_018689	ATG	2	6	3549	3554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702827
53	NC_018689	AGA	2	6	3625	3630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702827
54	NC_018689	ACG	2	6	3781	3786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407702828
55	NC_018689	TGA	2	6	3803	3808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702828
56	NC_018689	GAA	2	6	3825	3830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702828
57	NC_018689	ATT	2	6	3927	3932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702828
58	NC_018689	TGA	2	6	4229	4234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702828
59	NC_018689	GTA	2	6	4362	4367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702828
60	NC_018689	TAT	2	6	4394	4399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702828
61	NC_018689	GCT	2	6	4431	4436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702828
62	NC_018689	TTG	2	6	4453	4458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702828
63	NC_018689	CAT	2	6	4492	4497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702828
64	NC_018689	TAA	3	9	4571	4579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702828
65	NC_018689	AAT	2	6	4580	4585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702828
66	NC_018689	TAA	2	6	4616	4621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702828
67	NC_018689	TTA	2	6	4644	4649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702828
68	NC_018689	CAA	2	6	4705	4710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702828
69	NC_018689	GAA	2	6	4717	4722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702828
70	NC_018689	ATC	2	6	4828	4833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702828
71	NC_018689	TGA	2	6	4889	4894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702828
72	NC_018689	AAT	2	6	4945	4950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702828
73	NC_018689	TAT	2	6	4986	4991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018689	TTA	2	6	5055	5060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018689	ATT	2	6	5093	5098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018689	TAA	2	6	5272	5277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018689	AAG	2	6	5309	5314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018689	GAG	2	6	5329	5334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018689	ATT	2	6	5553	5558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702829
80	NC_018689	GTA	2	6	5563	5568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702829
81	NC_018689	ATT	3	9	5739	5747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702829
82	NC_018689	TAA	2	6	5830	5835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018689	AAT	2	6	5836	5841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018689	TCT	3	9	5900	5908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018689	ATA	2	6	5946	5951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018689	ATA	2	6	6083	6088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018689	GAA	2	6	6223	6228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018689	AAG	2	6	6284	6289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018689	AAG	2	6	6328	6333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018689	CAA	2	6	6352	6357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702830
91	NC_018689	ATG	2	6	6361	6366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702830
92	NC_018689	AGT	2	6	6489	6494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702830
93	NC_018689	AGC	3	9	6497	6505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407702830
94	NC_018689	GTA	2	6	6631	6636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702830
95	NC_018689	TAT	2	6	6676	6681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702830
96	NC_018689	ATT	3	9	6702	6710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702830
97	NC_018689	ATC	2	6	6787	6792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702830
98	NC_018689	TGT	2	6	6809	6814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702830
99	NC_018689	TGA	2	6	6821	6826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702830
100	NC_018689	ATG	2	6	6891	6896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702830
101	NC_018689	GAT	3	9	6972	6980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702830
102	NC_018689	GCT	2	6	6991	6996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702830
103	NC_018689	ATT	2	6	7149	7154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702830
104	NC_018689	ATA	2	6	7162	7167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702830
105	NC_018689	AAC	2	6	7199	7204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702830
106	NC_018689	AAC	2	6	7246	7251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702830
107	NC_018689	ATT	2	6	7299	7304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702830
108	NC_018689	TAG	2	6	7312	7317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702830
109	NC_018689	AAG	2	6	7381	7386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018689	ATG	2	6	7409	7414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018689	CTT	2	6	7417	7422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018689	AAG	2	6	7529	7534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702831
113	NC_018689	TAC	2	6	7594	7599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702831
114	NC_018689	TGC	2	6	7651	7656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702831
115	NC_018689	CAA	2	6	7737	7742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702831
116	NC_018689	ATA	2	6	7743	7748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702831
117	NC_018689	AAT	2	6	7755	7760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702831
118	NC_018689	ATA	2	6	7783	7788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702831
119	NC_018689	CTC	2	6	7818	7823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702831
120	NC_018689	CAA	2	6	7863	7868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702831
121	NC_018689	ATA	2	6	7877	7882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702831
122	NC_018689	TCA	2	6	7953	7958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702831
123	NC_018689	ACA	2	6	7976	7981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702831
124	NC_018689	ACC	2	6	8020	8025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407702831
125	NC_018689	ACA	2	6	8126	8131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702831
126	NC_018689	AAT	2	6	8138	8143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702831
127	NC_018689	CGA	2	6	8148	8153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407702831
128	NC_018689	TGC	2	6	8291	8296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702831
129	NC_018689	ATT	2	6	8372	8377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702831
130	NC_018689	AAG	3	9	8505	8513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702831
131	NC_018689	AGC	2	6	8548	8553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407702831
132	NC_018689	AAT	2	6	8632	8637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702831
133	NC_018689	CAC	2	6	8721	8726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_018689	GTC	2	6	8792	8797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018689	ATT	2	6	8960	8965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018689	ATT	2	6	8995	9000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018689	GTA	2	6	9016	9021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_018689	ATA	2	6	16976	16981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_018689	TAA	2	6	17493	17498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702838
259	NC_018689	GCA	2	6	17500	17505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407702838
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261	NC_018689	TAT	3	9	17593	17601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702838
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