MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC429

Total Repeats: 427

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018689	TA	3	6	5059	5064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018689	GT	3	6	5853	5858	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018689	TA	3	6	6087	6092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018689	GT	3	6	9100	9105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018689	AG	3	6	12882	12887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018689	AG	3	6	14973	14978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018689	CT	3	6	15010	15015	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018689	GA	3	6	15070	15075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018689	GT	3	6	19715	19720	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018689	TA	3	6	19857	19862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018689	AG	3	6	21505	21510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018689	AT	3	6	21536	21541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018689	TA	3	6	22262	22267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018689	CA	3	6	23326	23331	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018689	AT	4	8	23401	23408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018689	AG	3	6	24254	24259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018689	TA	3	6	24506	24511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018689	TA	3	6	27061	27066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018689	AT	3	6	27797	27802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018689	AT	3	6	30076	30081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018689	TA	3	6	30209	30214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018689	AT	3	6	30254	30259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018689	GT	3	6	30306	30311	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018689	TA	3	6	30583	30588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018689	TA	3	6	31727	31732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018689	GA	3	6	31893	31898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018689	TA	3	6	32545	32550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018689	TA	3	6	32580	32585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018689	CA	3	6	32732	32737	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018689	CA	3	6	32882	32887	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018689	GA	3	6	32888	32893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018689	AT	3	6	33766	33771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018689	TA	4	8	33795	33802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018689	TA	3	6	33841	33846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018689	AT	3	6	34252	34257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018689	TA	3	6	39739	39744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018689	TC	3	6	42099	42104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018689	AC	3	6	42129	42134	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018689	AG	3	6	42142	42147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018689	TA	3	6	42185	42190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018689	GA	3	6	43208	43213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018689	AG	3	6	49150	49155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018689	AT	3	6	50519	50524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018689	AT	3	6	53758	53763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018689	TA	3	6	53999	54004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018689	AT	3	6	54059	54064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018689	AG	3	6	56065	56070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018689	TA	3	6	59299	59304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018689	TC	3	6	59959	59964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018689	AT	3	6	61563	61568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018689	TA	3	6	61719	61724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018689	TA	3	6	61976	61981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018689	TA	3	6	62044	62049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018689	GA	3	6	62169	62174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018689	TG	3	6	70860	70865	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018689	AG	3	6	70988	70993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018689	TG	3	6	73555	73560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018689	TG	3	6	73987	73992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018689	TA	3	6	75280	75285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018689	TG	3	6	75506	75511	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018689	TG	3	6	77111	77116	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018689	TA	4	8	77192	77199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018689	GT	3	6	77243	77248	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018689	AT	3	6	77273	77278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018689	CA	3	6	77319	77324	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018689	TA	3	6	77503	77508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018689	TA	3	6	81259	81264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018689	AT	3	6	82983	82988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018689	AT	3	6	85001	85006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018689	TA	3	6	85229	85234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018689	TA	3	6	85245	85250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018689	AT	3	6	85307	85312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018689	AT	3	6	85404	85409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018689	TA	3	6	85426	85431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018689	TA	3	6	85449	85454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018689	TA	3	6	85657	85662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018689	TA	4	8	87645	87652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018689	CT	3	6	88980	88985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018689	TA	6	12	89068	89079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018689	TA	4	8	92081	92088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018689	TA	3	6	92128	92133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018689	AC	3	6	93735	93740	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_018689	TA	3	6	93841	93846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018689	TC	3	6	93858	93863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018689	GT	3	6	94265	94270	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018689	GA	3	6	94294	94299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018689	AG	3	6	94444	94449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018689	AG	3	6	94498	94503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018689	AT	3	6	96413	96418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018689	AT	3	6	96623	96628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018689	CT	3	6	96780	96785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018689	TA	4	8	96808	96815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018689	AT	3	6	101184	101189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018689	CT	3	6	103113	103118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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96	NC_018689	AT	3	6	104124	104129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018689	AT	3	6	104817	104822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018689	AT	4	8	105760	105767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018689	TA	4	8	107120	107127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018689	TA	3	6	109084	109089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018689	TA	3	6	109759	109764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018689	TA	3	6	112364	112369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018689	TA	4	8	112843	112850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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105	NC_018689	AT	4	8	124368	124375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018689	TA	3	6	124714	124719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018689	TA	3	6	125585	125590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018689	TA	3	6	126575	126580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018689	AT	3	6	126591	126596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018689	AT	3	6	126653	126658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018689	TA	3	6	127198	127203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018689	TA	3	6	127209	127214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018689	TA	3	6	127234	127239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018689	AT	3	6	128593	128598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018689	TA	3	6	128769	128774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018689	TA	3	6	130010	130015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018689	CT	3	6	130189	130194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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119	NC_018689	TA	3	6	130826	130831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018689	AT	3	6	131421	131426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018689	TA	3	6	131955	131960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018689	AT	3	6	132610	132615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018689	AT	5	10	132945	132954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018689	CT	3	6	133353	133358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_018689	TA	3	6	133570	133575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018689	AT	3	6	135162	135167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018689	AT	4	8	135458	135465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018689	TC	3	6	135835	135840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_018689	AT	3	6	135883	135888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018689	TA	4	8	136577	136584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018689	GA	3	6	136606	136611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018689	TC	3	6	136617	136622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_018689	AT	3	6	136848	136853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018689	TG	3	6	136921	136926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018689	AT	3	6	137013	137018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018689	TA	3	6	137255	137260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018689	AC	3	6	138272	138277	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_018689	TA	3	6	139559	139564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018689	TA	3	6	139585	139590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018689	AT	5	10	139603	139612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018689	AT	3	6	139637	139642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018689	AT	3	6	139756	139761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_018689	AC	3	6	143927	143932	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_018689	AT	3	6	146456	146461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_018689	AT	3	6	146898	146903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018689	CT	4	8	148823	148830	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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151	NC_018689	TA	3	6	148916	148921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018689	CG	4	8	149112	149119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_018689	AT	3	6	149274	149279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018689	AT	4	8	149590	149597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018689	AT	3	6	151774	151779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018689	AT	3	6	151786	151791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.