MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC319

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018688	ACTTTT	2	12	1657	1668	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018688	CTAACA	2	12	23881	23892	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018688	AATTAT	2	12	32916	32927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018688	ATACTA	2	12	33774	33785	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018688	CTAACT	2	12	35103	35114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018688	ATTTCT	2	12	38590	38601	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018688	TATAGA	2	12	55723	55734	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018688	CGTTTT	2	12	63759	63770	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018688	AAATTT	2	12	65555	65566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018688	GCAAAA	2	12	81806	81817	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018688	AATAAA	2	12	82441	82452	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018688	AAATTA	2	12	96294	96305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018688	ACTTCT	2	12	116584	116595	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018688	TTAATT	2	12	121449	121460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018688	ATGAAA	2	12	123425	123436	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018688	TTTATT	2	12	124665	124676	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018688	ATTTAG	2	12	125541	125552	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018688	GGTACA	2	12	149119	149130	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018688	ATCCAT	2	12	191760	191771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018688	TTGTTA	2	12	224272	224283	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018688	AAAATG	2	12	239996	240007	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018688	GAATGG	3	18	240284	240301	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018688	AATTTA	2	12	240528	240539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018688	AAAATA	2	12	241573	241584	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018688	TATTTT	2	12	241606	241617	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018688	TGTTCT	2	12	244601	244612	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018688	TTCTCT	2	12	245695	245706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018688	TGATGG	2	12	249962	249973	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018688	CTTTTA	2	12	250155	250166	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018688	ATAAAA	2	12	276562	276573	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018688	TCTAAT	2	12	278704	278715	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018688	ATTAAT	2	12	279090	279101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018688	ATCTTT	2	12	286051	286062	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018688	TGTTCT	2	12	289224	289235	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018688	GAAATA	2	12	292091	292102	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018688	CACATA	2	12	312662	312673	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.