MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC319

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018688	TTTAT	2	10	26454	26463	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018688	AATAA	2	10	32879	32888	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018688	GTAAA	2	10	33515	33524	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018688	AGATT	2	10	35871	35880	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018688	AAAAG	2	10	35990	35999	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018688	CTCAT	2	10	36080	36089	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_018688	TATTT	2	10	37001	37010	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018688	TTATT	2	10	37874	37883	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018688	CATTC	2	10	38560	38569	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_018688	AAGAA	2	10	39241	39250	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018688	ATAAA	2	10	39397	39406	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018688	AAATT	2	10	39950	39959	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018688	TAAAT	2	10	40828	40837	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018688	TATTT	2	10	40883	40892	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018688	TAAGT	2	10	51437	51446	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018688	AAATA	2	10	51799	51808	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018688	TAAAA	2	10	55835	55844	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018688	AAATC	2	10	57754	57763	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018688	ATATT	2	10	60669	60678	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018688	TGAAA	2	10	63248	63257	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018688	ACATA	2	10	65842	65851	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_018688	ATCTA	2	10	66874	66883	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018688	TAAAT	2	10	70486	70495	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018688	AATTT	2	10	70557	70566	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018688	CCGCA	2	10	72025	72034	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_018688	TCTTT	2	10	74260	74269	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_018688	AATTT	3	15	74877	74891	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018688	GTGAA	2	10	74910	74919	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018688	ATATT	2	10	74995	75004	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018688	GGAAA	2	10	78209	78218	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018688	CCAAT	2	10	82630	82639	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_018688	TAAAA	2	10	83123	83132	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018688	ATGTG	2	10	83871	83880	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018688	TTTTA	2	10	83978	83987	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018688	AGATT	2	10	113643	113652	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018688	GCACA	2	10	113840	113849	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_018688	TAAAA	2	10	114316	114325	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018688	ATTTA	2	10	114378	114387	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018688	TTAAT	2	10	115647	115656	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018688	TATAT	2	10	118506	118515	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018688	AATGA	2	10	120891	120900	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018688	ATTTT	2	10	122554	122563	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018688	TTATT	2	10	128603	128612	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018688	GGGAA	2	10	135682	135691	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018688	TTGAT	2	10	136738	136747	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018688	ATTTC	2	10	139271	139280	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018688	AAATG	2	10	142837	142846	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018688	CCTTT	2	10	150109	150118	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_018688	AATTA	2	10	150264	150273	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018688	TAAAA	2	10	151003	151012	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018688	TAGAA	2	10	159309	159318	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018688	TTTTC	2	10	171778	171787	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018688	AAAAG	2	10	172944	172953	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018688	CTTTT	2	10	172970	172979	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018688	TTAAA	2	10	173920	173929	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018688	TTAAT	2	10	174100	174109	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018688	AAGGA	2	10	177984	177993	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018688	TTAAT	2	10	178971	178980	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018688	GAAAA	2	10	182763	182772	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018688	TTATT	2	10	183373	183382	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018688	AACAA	2	10	183500	183509	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018688	TCTTT	2	10	186270	186279	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018688	TAATT	2	10	187163	187172	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018688	TAATT	2	10	187653	187662	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018688	TAATT	2	10	188143	188152	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018688	TCTTT	2	10	188213	188222	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_018688	TAATT	2	10	189106	189115	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018688	TAATT	2	10	189596	189605	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018688	TCTTT	2	10	189666	189675	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_018688	GAAAA	2	10	189827	189836	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018688	CAAAG	2	10	190162	190171	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_018688	AATTA	2	10	194452	194461	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018688	CTTCT	2	10	194975	194984	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_018688	TTCTA	2	10	200319	200328	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_018688	TAATT	2	10	202287	202296	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018688	ATGCT	2	10	203431	203440	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018688	TATAA	2	10	204760	204769	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018688	TTTGA	2	10	210322	210331	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018688	ATTTA	2	10	222483	222492	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018688	AAAGT	2	10	224343	224352	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018688	CAAAA	2	10	224459	224468	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_018688	TTAAG	2	10	227016	227025	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018688	ATTTG	2	10	227132	227141	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018688	AAATG	2	10	227526	227535	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018688	ATTAA	2	10	228044	228053	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018688	TTAAT	2	10	228106	228115	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018688	AAAAT	2	10	231868	231877	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018688	TAAAA	2	10	232354	232363	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018688	TAATA	2	10	239858	239867	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018688	ATTAA	2	10	239903	239912	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018688	AAAAG	2	10	240376	240385	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018688	AATTT	2	10	241149	241158	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018688	CTAAA	2	10	241346	241355	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_018688	TTTTA	2	10	245644	245653	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018688	TAAAT	2	10	245681	245690	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018688	ATTAA	2	10	245725	245734	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018688	TAAAA	2	10	250116	250125	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018688	ATTTA	2	10	255281	255290	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018688	ACATT	2	10	255318	255327	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_018688	TGGGA	2	10	255455	255464	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018688	AAATC	2	10	255799	255808	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_018688	TATAT	2	10	262394	262403	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018688	AAGAT	2	10	266598	266607	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018688	ACTAA	2	10	274335	274344	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_018688	ATTTT	2	10	276464	276473	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018688	AATGT	2	10	277721	277730	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018688	TTCTC	2	10	287220	287229	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_018688	AAAAT	2	10	287560	287569	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018688	AAGCA	2	10	287865	287874	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_018688	AATAA	2	10	288190	288199	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018688	TAAAA	2	10	290817	290826	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018688	TTTAA	2	10	296324	296333	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018688	ATTAT	2	10	297237	297246	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018688	AATGA	2	10	297756	297765	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018688	ATTTA	2	10	298046	298055	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018688	TAATT	2	10	298162	298171	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018688	TAAAC	2	10	298201	298210	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_018688	AAGAT	2	10	308289	308298	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018688	TTCTT	2	10	309583	309592	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018688	AGTTT	2	10	309639	309648	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018688	TTATT	2	10	310572	310581	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018688	ATTAG	2	10	311039	311048	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018688	AATTT	2	10	311312	311321	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018688	TAATC	2	10	315443	315452	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018688	CAACC	2	10	315595	315604	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
126	NC_018688	CATTT	2	10	317043	317052	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.