MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC319

Total Repeats: 3206

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018688	TCA	2	6	66	71	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702535
2	NC_018688	ATA	2	6	465	470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702536
3	NC_018688	GTG	2	6	528	533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407702536
4	NC_018688	TCT	2	6	544	549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702536
5	NC_018688	GTT	3	9	709	717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702536
6	NC_018688	CCA	2	6	768	773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407702536
7	NC_018688	ATA	2	6	792	797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702536
8	NC_018688	CCA	2	6	829	834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407702536
9	NC_018688	TTC	2	6	897	902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702536
10	NC_018688	CTT	2	6	986	991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702536
11	NC_018688	TTG	2	6	1035	1040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702536
12	NC_018688	ATT	2	6	1050	1055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702536
13	NC_018688	TTG	2	6	1179	1184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702536
14	NC_018688	ATT	2	6	1194	1199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702536
15	NC_018688	ATA	2	6	1257	1262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702536
16	NC_018688	GAA	2	6	1280	1285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702536
17	NC_018688	TTG	2	6	1323	1328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702536
18	NC_018688	ATT	2	6	1338	1343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702536
19	NC_018688	CTA	2	6	1378	1383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702536
20	NC_018688	CTT	2	6	1968	1973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702537
21	NC_018688	TTC	2	6	2071	2076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702537
22	NC_018688	TTC	2	6	2119	2124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702537
23	NC_018688	TTG	2	6	2209	2214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702537
24	NC_018688	CTT	2	6	2271	2276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702537
25	NC_018688	ACA	2	6	2384	2389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702537
26	NC_018688	AAT	2	6	2553	2558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702537
27	NC_018688	TCA	2	6	2727	2732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702537
28	NC_018688	TGC	2	6	3091	3096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702537
29	NC_018688	CAA	2	6	3262	3267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702537
30	NC_018688	CTT	2	6	3396	3401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702537
31	NC_018688	TAA	2	6	3403	3408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702537
32	NC_018688	TCC	2	6	3419	3424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702537
33	NC_018688	AAG	2	6	3492	3497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702537
34	NC_018688	CTG	2	6	3564	3569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702537
35	NC_018688	GAA	2	6	3597	3602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702537
36	NC_018688	AAT	2	6	3706	3711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702537
37	NC_018688	CTT	2	6	4227	4232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702537
38	NC_018688	TCT	2	6	4238	4243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702537
39	NC_018688	TCT	2	6	4287	4292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702538
40	NC_018688	TCC	2	6	4320	4325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702538
41	NC_018688	TCT	2	6	4329	4334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702538
42	NC_018688	TTC	2	6	4430	4435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702538
43	NC_018688	TTC	2	6	4466	4471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702538
44	NC_018688	TAA	2	6	4513	4518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702538
45	NC_018688	ATA	2	6	4543	4548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702538
46	NC_018688	CTT	2	6	4670	4675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702539
47	NC_018688	TAA	2	6	4715	4720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702539
48	NC_018688	TAA	2	6	4755	4760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702539
49	NC_018688	ATT	2	6	4950	4955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702539
50	NC_018688	GTA	2	6	5082	5087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702540
51	NC_018688	TTC	2	6	5095	5100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702540
52	NC_018688	TGA	2	6	5203	5208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702540
53	NC_018688	CTT	2	6	5313	5318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702540
54	NC_018688	CTT	2	6	5342	5347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702540
55	NC_018688	CTT	2	6	5360	5365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702540
56	NC_018688	ATG	3	9	5403	5411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702540
57	NC_018688	TCA	2	6	5434	5439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702540
58	NC_018688	ATT	2	6	5589	5594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702540
59	NC_018688	ATT	2	6	5643	5648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702540
60	NC_018688	TCA	2	6	5875	5880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702540
61	NC_018688	CTT	2	6	6107	6112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702540
62	NC_018688	ACA	2	6	6181	6186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702540
63	NC_018688	GAT	2	6	6199	6204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702540
64	NC_018688	CAT	3	9	6241	6249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702541
65	NC_018688	GCC	2	6	6365	6370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407702541
66	NC_018688	ATT	2	6	6377	6382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702541
67	NC_018688	TCA	2	6	6428	6433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702541
68	NC_018688	CCA	2	6	6553	6558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407702541
69	NC_018688	TTA	2	6	6747	6752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702542
70	NC_018688	TGA	2	6	6836	6841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702542
71	NC_018688	TCA	2	6	7071	7076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702542
72	NC_018688	TGC	2	6	7139	7144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702542
73	NC_018688	TCT	2	6	7149	7154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702542
74	NC_018688	ATG	2	6	7722	7727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702543
75	NC_018688	TCT	2	6	7752	7757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702543
76	NC_018688	CCT	2	6	7810	7815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702543
77	NC_018688	TTG	2	6	7910	7915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702543
78	NC_018688	TTC	2	6	7922	7927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702543
79	NC_018688	CTT	2	6	7969	7974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702543
80	NC_018688	TGT	2	6	8034	8039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702543
81	NC_018688	CTT	2	6	8271	8276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702544
82	NC_018688	ATT	2	6	8309	8314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702544
83	NC_018688	TCC	2	6	8588	8593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702544
84	NC_018688	TCC	3	9	8678	8686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702544
85	NC_018688	ATA	2	6	8711	8716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702544
86	NC_018688	TGT	3	9	8823	8831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702544
87	NC_018688	CCA	2	6	8865	8870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407702544
88	NC_018688	CAA	2	6	8878	8883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702544
89	NC_018688	TGA	2	6	9071	9076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702544
90	NC_018688	CAT	2	6	9113	9118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702544
91	NC_018688	TGC	2	6	9278	9283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702544
92	NC_018688	AGT	2	6	9336	9341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702544
93	NC_018688	TGA	2	6	9349	9354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702544
94	NC_018688	TTC	2	6	9423	9428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702545
95	NC_018688	TTA	2	6	9571	9576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702545
96	NC_018688	TGC	2	6	9580	9585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702545
97	NC_018688	TCA	2	6	9628	9633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702545
98	NC_018688	TCT	2	6	9715	9720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702545
99	NC_018688	TAA	2	6	9773	9778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702545
100	NC_018688	ATG	2	6	9780	9785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702545
101	NC_018688	AAT	3	9	9795	9803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702545
102	NC_018688	ATC	2	6	9877	9882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702545
103	NC_018688	GTA	2	6	10000	10005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702545
104	NC_018688	AAT	2	6	10015	10020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702545
105	NC_018688	CTA	2	6	10034	10039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702545
106	NC_018688	ATG	2	6	10101	10106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702545
107	NC_018688	AGA	2	6	10163	10168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702545
108	NC_018688	TTG	2	6	10190	10195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702545
109	NC_018688	TCG	2	6	10219	10224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702545
110	NC_018688	TCA	2	6	10282	10287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702545
111	NC_018688	CTG	2	6	10367	10372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702545
112	NC_018688	TCC	2	6	10431	10436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702545
113	NC_018688	ACA	2	6	10468	10473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702545
114	NC_018688	GTT	2	6	10636	10641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702545
115	NC_018688	ATA	2	6	10644	10649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702545
116	NC_018688	AAT	2	6	10676	10681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702545
117	NC_018688	CCA	2	6	10693	10698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407702545
118	NC_018688	TTC	2	6	10730	10735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702545
119	NC_018688	GAA	2	6	10938	10943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702546
120	NC_018688	TCT	2	6	10993	10998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702546
121	NC_018688	AAT	2	6	11003	11008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702546
122	NC_018688	ATC	2	6	11045	11050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702546
123	NC_018688	CTT	2	6	11323	11328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702546
124	NC_018688	GTA	2	6	11392	11397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702546
125	NC_018688	AAT	3	9	11575	11583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702546
126	NC_018688	TTG	2	6	11848	11853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702546
127	NC_018688	ATA	2	6	11890	11895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702546
128	NC_018688	CCA	2	6	12023	12028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407702546
129	NC_018688	CCT	2	6	12075	12080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702546
130	NC_018688	CAG	2	6	12128	12133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407702546
131	NC_018688	ATG	2	6	12203	12208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702546
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258	NC_018688	TGT	2	6	22296	22301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702554
259	NC_018688	TCT	2	6	22486	22491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702554
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277	NC_018688	CTC	2	6	23490	23495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702555
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