MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC319

Total Repeats: 315

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018688	AG	3	6	179	184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018688	CA	4	8	13146	13153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018688	CA	3	6	13349	13354	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018688	TC	3	6	22664	22669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018688	AT	4	8	26806	26813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018688	AT	4	8	26861	26868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018688	AT	3	6	28879	28884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018688	TA	3	6	29191	29196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018688	AT	4	8	29960	29967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018688	AT	3	6	31684	31689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018688	TC	3	6	33492	33497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018688	AT	3	6	33645	33650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018688	TA	3	6	33716	33721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018688	AT	3	6	34282	34287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018688	AC	3	6	34394	34399	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018688	TA	3	6	35087	35092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018688	CA	3	6	35451	35456	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018688	TA	4	8	36390	36397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018688	TA	3	6	36521	36526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018688	AT	3	6	36710	36715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018688	AT	3	6	36731	36736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018688	AT	3	6	36901	36906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018688	TG	3	6	37567	37572	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018688	AT	3	6	37699	37704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018688	AT	3	6	37765	37770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018688	AT	3	6	37791	37796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018688	AT	3	6	37820	37825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018688	AT	3	6	38665	38670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018688	AT	3	6	38679	38684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018688	AT	3	6	39233	39238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018688	TA	3	6	39328	39333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018688	AT	3	6	39440	39445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018688	AT	3	6	39711	39716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018688	TA	3	6	39880	39885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018688	AT	4	8	40103	40110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018688	TA	3	6	40337	40342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018688	CA	3	6	40496	40501	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018688	TA	3	6	40525	40530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018688	TC	3	6	40615	40620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018688	AT	3	6	40628	40633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018688	AT	3	6	40669	40674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018688	TA	3	6	40765	40770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018688	AT	3	6	40777	40782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018688	AT	3	6	40788	40793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018688	AT	3	6	40799	40804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018688	AT	3	6	40869	40874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018688	AT	3	6	40951	40956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018688	TA	3	6	44420	44425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018688	TA	3	6	44692	44697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018688	CT	3	6	47171	47176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_018688	TA	3	6	47251	47256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018688	GT	3	6	47575	47580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018688	AT	4	8	47871	47878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018688	AT	4	8	47882	47889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018688	TA	3	6	47891	47896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018688	AT	3	6	47943	47948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018688	AT	3	6	47975	47980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018688	TA	3	6	48225	48230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018688	AT	3	6	51493	51498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018688	AT	4	8	51521	51528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018688	TA	3	6	51787	51792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018688	AT	3	6	51821	51826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018688	TA	3	6	53159	53164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018688	TA	4	8	55580	55587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018688	TA	4	8	55612	55619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018688	TA	3	6	55652	55657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018688	TC	3	6	55999	56004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_018688	TA	3	6	56037	56042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018688	AG	3	6	57660	57665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018688	TA	3	6	57738	57743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018688	AT	3	6	60559	60564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018688	AT	3	6	60717	60722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018688	AT	3	6	61634	61639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018688	GT	3	6	61785	61790	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018688	AT	3	6	61804	61809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018688	TA	3	6	61861	61866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018688	AT	3	6	62717	62722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018688	AG	3	6	63646	63651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018688	AT	3	6	63857	63862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018688	TA	3	6	64195	64200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018688	AT	3	6	65320	65325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018688	AT	4	8	66845	66852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018688	TA	3	6	67057	67062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018688	AG	3	6	67168	67173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018688	AG	3	6	67226	67231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018688	TG	3	6	67239	67244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018688	AT	3	6	69982	69987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018688	CT	3	6	72772	72777	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018688	AT	3	6	74368	74373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018688	AT	3	6	74904	74909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018688	GT	3	6	81630	81635	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018688	TG	3	6	82615	82620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018688	AT	3	6	86735	86740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018688	GT	3	6	87421	87426	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018688	AT	4	8	88919	88926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018688	AT	3	6	91263	91268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018688	TA	4	8	101938	101945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018688	TA	3	6	105126	105131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018688	AT	3	6	105260	105265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018688	TA	3	6	105605	105610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018688	TG	3	6	109257	109262	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018688	TA	3	6	110673	110678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018688	TG	3	6	111218	111223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018688	AG	3	6	111363	111368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018688	TA	3	6	114451	114456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018688	AT	3	6	115279	115284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018688	TC	3	6	116373	116378	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_018688	AT	3	6	118029	118034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018688	AT	3	6	118530	118535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018688	AT	3	6	118551	118556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018688	TA	3	6	118581	118586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018688	TA	4	8	118819	118826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018688	GA	3	6	119209	119214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018688	AG	3	6	121564	121569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018688	AT	3	6	122528	122533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018688	TA	3	6	122673	122678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018688	TA	3	6	122777	122782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018688	TA	3	6	122917	122922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018688	AT	3	6	124781	124786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018688	TA	4	8	125408	125415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018688	AT	3	6	125770	125775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018688	AT	3	6	125932	125937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018688	AT	3	6	128086	128091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018688	AT	3	6	128264	128269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018688	AT	7	14	128303	128316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018688	TA	3	6	128784	128789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018688	TA	3	6	128801	128806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018688	AT	3	6	128814	128819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018688	AT	3	6	128877	128882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018688	TA	3	6	131091	131096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018688	AT	3	6	134495	134500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018688	AC	3	6	134941	134946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_018688	TG	3	6	136901	136906	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018688	CT	3	6	138525	138530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_018688	AT	4	8	138804	138811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018688	TC	3	6	138939	138944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_018688	AG	3	6	139082	139087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018688	TG	3	6	139207	139212	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018688	TA	3	6	139361	139366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018688	TA	3	6	139571	139576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018688	GT	4	8	143329	143336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018688	AT	3	6	143364	143369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018688	TA	3	6	143694	143699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018688	TA	3	6	143705	143710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018688	GT	3	6	143971	143976	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018688	TA	3	6	143994	143999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018688	AT	3	6	144086	144091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018688	TA	3	6	144101	144106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018688	AT	3	6	144159	144164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018688	TA	3	6	144182	144187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018688	TA	3	6	149150	149155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018688	GT	3	6	149323	149328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018688	GT	3	6	149350	149355	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018688	GT	3	6	150293	150298	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018688	TA	3	6	150380	150385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018688	TA	5	10	154165	154174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.