MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC189

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018687	CTTTTT	2	12	1249	1260	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407702350
2	NC_018687	GTTCTG	2	12	3327	3338	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407702352
3	NC_018687	ATATCT	2	12	3428	3439	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407702352
4	NC_018687	TTTTAT	2	12	3648	3659	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407702352
5	NC_018687	AATAGA	2	12	4171	4182	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407702352
6	NC_018687	CTTCGT	2	12	5905	5916	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407702353
7	NC_018687	ATATTC	2	12	7694	7705	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407702355
8	NC_018687	AAATCA	2	12	7893	7904	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407702355
9	NC_018687	TCAAAT	2	12	8344	8355	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407702356
10	NC_018687	CTAACA	2	12	9230	9241	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407702358
11	NC_018687	CTGTTG	2	12	9357	9368	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407702359
12	NC_018687	TCTTTT	2	12	9491	9502	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407702359
13	NC_018687	ACCAAT	2	12	11657	11668	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407702361
14	NC_018687	CGTTTC	2	12	12891	12902	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407702363
15	NC_018687	TTATGA	2	12	20752	20763	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702372
16	NC_018687	TTTCTT	2	12	23963	23974	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407702377
17	NC_018687	AGCTTC	2	12	23982	23993	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407702377
18	NC_018687	AAAAGG	2	12	27035	27046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702378
19	NC_018687	GAAAAA	2	12	27075	27086	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407702378
20	NC_018687	AATTAT	2	12	30363	30374	50 %	50 %	0 %	0 %	407702380
21	NC_018687	CCTGGT	2	12	34807	34818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702386
22	NC_018687	TTTGAT	2	12	38094	38105	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407702390
23	NC_018687	ACAAAA	2	12	40697	40708	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	407702392
24	NC_018687	TAATCA	2	12	46105	46116	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407702399
25	NC_018687	CTTCGT	2	12	47082	47093	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407702400
26	NC_018687	TAAATT	2	12	47991	48002	50 %	50 %	0 %	0 %	407702401
27	NC_018687	CATTTC	2	12	54128	54139	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407702407
28	NC_018687	CATTTC	2	12	56593	56604	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407702410
29	NC_018687	TGGAAT	2	12	57299	57310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702411
30	NC_018687	AATTGT	2	12	57398	57409	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
31	NC_018687	AATTGT	2	12	57494	57505	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
32	NC_018687	AATTGT	2	12	57542	57553	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
33	NC_018687	AATTGT	2	12	57638	57649	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
34	NC_018687	AATTGT	2	12	57830	57841	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
35	NC_018687	AATTGT	2	12	57926	57937	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
36	NC_018687	AATTGT	2	12	58022	58033	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
37	NC_018687	AATTGT	2	12	58070	58081	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
38	NC_018687	AATTGT	2	12	58214	58225	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
39	NC_018687	AATTGT	2	12	58262	58273	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
40	NC_018687	AATTGT	2	12	58310	58321	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
41	NC_018687	AATTGT	2	12	58358	58369	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
42	NC_018687	AATTGT	2	12	58406	58417	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
43	NC_018687	AATTGT	2	12	58454	58465	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
44	NC_018687	AATTGT	2	12	58502	58513	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
45	NC_018687	AATTGT	2	12	58550	58561	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
46	NC_018687	AATTGT	2	12	58598	58609	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
47	NC_018687	AATTGT	2	12	58646	58657	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
48	NC_018687	AATTGT	2	12	58694	58705	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
49	NC_018687	AATTGT	2	12	58742	58753	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
50	NC_018687	AATTGT	2	12	58790	58801	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
51	NC_018687	AATTGT	2	12	58838	58849	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
52	NC_018687	AATTGT	2	12	58886	58897	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
53	NC_018687	AATTGT	2	12	58934	58945	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
54	NC_018687	AATTGT	2	12	58982	58993	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
55	NC_018687	AATTGT	2	12	59030	59041	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
56	NC_018687	AATTGT	2	12	59078	59089	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
57	NC_018687	AATTGT	2	12	59126	59137	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
58	NC_018687	AATTGT	2	12	59174	59185	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
59	NC_018687	AATTGT	2	12	59222	59233	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
60	NC_018687	AATTGT	2	12	59270	59281	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
61	NC_018687	AATTGT	2	12	59318	59329	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
62	NC_018687	AATTGT	2	12	59366	59377	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
63	NC_018687	AATTGT	2	12	59414	59425	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
64	NC_018687	AATTGT	2	12	59462	59473	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
65	NC_018687	AATTGT	2	12	59510	59521	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
66	NC_018687	AATTGT	2	12	59558	59569	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
67	NC_018687	AATTGT	2	12	59606	59617	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
68	NC_018687	AATTGT	2	12	59654	59665	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
69	NC_018687	AATTGT	2	12	59702	59713	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
70	NC_018687	AATTGT	2	12	59750	59761	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
71	NC_018687	AATTGT	2	12	59798	59809	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
72	NC_018687	AATTGT	2	12	59846	59857	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
73	NC_018687	AATTGT	2	12	59894	59905	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
74	NC_018687	AATTGT	2	12	59942	59953	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702411
75	NC_018687	TATAGG	3	18	65424	65441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702413
76	NC_018687	TATGAT	2	12	69991	70002	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702418
77	NC_018687	TCAAAT	2	12	71925	71936	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407702419
78	NC_018687	TTCATT	2	12	78031	78042	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407702422
79	NC_018687	TTTTGT	2	12	80088	80099	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407702424
80	NC_018687	TCCTTT	2	12	83682	83693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702427
81	NC_018687	AAAAAC	2	12	97502	97513	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	407702439
82	NC_018687	GAAAAA	2	12	106866	106877	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407702446
83	NC_018687	CTTTTC	2	12	108825	108836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702449
84	NC_018687	AACAGT	2	12	113385	113396	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407702455
85	NC_018687	TTTGGT	2	12	115161	115172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702456
86	NC_018687	TTTTAA	2	12	122245	122256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702462
87	NC_018687	GAAAAA	2	12	122651	122662	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407702463
88	NC_018687	TTTTCA	2	12	123907	123918	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407702467
89	NC_018687	TAAAAA	2	12	124420	124431	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407702467
90	NC_018687	GAAAAA	2	12	146888	146899	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407702489
91	NC_018687	GCACAA	2	12	148249	148260	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407702491
92	NC_018687	AGATAA	2	12	148887	148898	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407702491
93	NC_018687	TAGATT	2	12	149417	149428	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702492
94	NC_018687	TTTGTA	2	12	153858	153869	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407702498
95	NC_018687	TTTCAT	2	12	155744	155755	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407702502
96	NC_018687	GTATAT	2	12	155876	155887	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702502
97	NC_018687	ATTTTT	2	12	157745	157756	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407702504
98	NC_018687	TGATAT	2	12	158073	158084	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702504
99	NC_018687	TTATGG	2	12	159138	159149	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407702505
100	NC_018687	ATTTTC	2	12	176217	176228	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407702519
101	NC_018687	TTCCAT	2	12	176644	176655	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407702521
102	NC_018687	TCCTTT	2	12	176720	176731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702521
103	NC_018687	TCTTTT	2	12	176732	176743	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407702521
104	NC_018687	TTGAAG	2	12	176805	176816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702521
105	NC_018687	TTTTCG	2	12	177899	177910	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407702521
106	NC_018687	TTTCAT	2	12	179912	179923	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407702524
107	NC_018687	TTTGTT	2	12	180479	180490	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407702524
108	NC_018687	ATGAAT	2	12	180600	180611	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407702524
109	NC_018687	TGTTTT	2	12	180729	180740	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407702524
110	NC_018687	TTTCAC	2	12	184385	184396	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407702529
111	NC_018687	TTTGGT	2	12	187310	187321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702530
112	NC_018687	TTTTTC	2	12	189470	189481	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407702533

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.