MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC189

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018687	CATAA	2	10	1837	1846	60 %	20 %	0 %	20 %	407702350
2	NC_018687	AGTAA	2	10	1893	1902	60 %	20 %	20 %	0 %	407702350
3	NC_018687	TCCCA	2	10	1994	2003	20 %	20 %	0 %	60 %	407702350
4	NC_018687	ATAAA	2	10	3992	4001	80 %	20 %	0 %	0 %	407702352
5	NC_018687	AATTA	2	10	5044	5053	60 %	40 %	0 %	0 %	407702352
6	NC_018687	TTATC	2	10	5602	5611	20 %	60 %	0 %	20 %	407702353
7	NC_018687	GATAT	2	10	5634	5643	40 %	40 %	20 %	0 %	407702353
8	NC_018687	AATAA	2	10	7283	7292	80 %	20 %	0 %	0 %	407702355
9	NC_018687	TTTCC	2	10	7609	7618	0 %	60 %	0 %	40 %	407702355
10	NC_018687	AAAAT	2	10	8214	8223	80 %	20 %	0 %	0 %	407702356
11	NC_018687	TGACT	2	10	9311	9320	20 %	40 %	20 %	20 %	407702359
12	NC_018687	TTTAG	2	10	10458	10467	20 %	60 %	20 %	0 %	407702360
13	NC_018687	TAACA	2	10	11555	11564	60 %	20 %	0 %	20 %	407702361
14	NC_018687	AAAAT	2	10	13051	13060	80 %	20 %	0 %	0 %	407702363
15	NC_018687	TATGA	2	10	20654	20663	40 %	40 %	20 %	0 %	407702372
16	NC_018687	ATTTA	2	10	20938	20947	40 %	60 %	0 %	0 %	407702372
17	NC_018687	GTAAT	2	10	21483	21492	40 %	40 %	20 %	0 %	407702373
18	NC_018687	TGTTT	2	10	22931	22940	0 %	80 %	20 %	0 %	407702376
19	NC_018687	ATCTT	2	10	23473	23482	20 %	60 %	0 %	20 %	407702376
20	NC_018687	TAAAT	2	10	26900	26909	60 %	40 %	0 %	0 %	407702378
21	NC_018687	TAAAT	2	10	26915	26924	60 %	40 %	0 %	0 %	407702378
22	NC_018687	TGGAA	2	10	26943	26952	40 %	20 %	40 %	0 %	407702378
23	NC_018687	AATAT	2	10	27562	27571	60 %	40 %	0 %	0 %	407702378
24	NC_018687	AGTTA	2	10	28042	28051	40 %	40 %	20 %	0 %	407702378
25	NC_018687	GAAGA	2	10	29149	29158	60 %	0 %	40 %	0 %	407702378
26	NC_018687	AATTT	2	10	30292	30301	40 %	60 %	0 %	0 %	407702380
27	NC_018687	TTTAA	2	10	34471	34480	40 %	60 %	0 %	0 %	407702386
28	NC_018687	GAATT	2	10	41412	41421	40 %	40 %	20 %	0 %	407702393
29	NC_018687	TATAA	2	10	45989	45998	60 %	40 %	0 %	0 %	407702399
30	NC_018687	AAAAT	2	10	48242	48251	80 %	20 %	0 %	0 %	407702401
31	NC_018687	ACATC	2	10	50060	50069	40 %	20 %	0 %	40 %	407702403
32	NC_018687	AACTT	2	10	50173	50182	40 %	40 %	0 %	20 %	407702403
33	NC_018687	AATTA	2	10	53427	53436	60 %	40 %	0 %	0 %	407702405
34	NC_018687	TTTCT	2	10	54915	54924	0 %	80 %	0 %	20 %	407702408
35	NC_018687	AAAAG	2	10	55294	55303	80 %	0 %	20 %	0 %	407702409
36	NC_018687	ATTTA	2	10	60171	60180	40 %	60 %	0 %	0 %	407702411
37	NC_018687	CGAAA	2	10	62191	62200	60 %	0 %	20 %	20 %	407702412
38	NC_018687	TGCAT	2	10	64903	64912	20 %	40 %	20 %	20 %	407702413
39	NC_018687	TAGGA	2	10	65615	65624	40 %	20 %	40 %	0 %	407702413
40	NC_018687	CATTC	2	10	67173	67182	20 %	40 %	0 %	40 %	407702416
41	NC_018687	GTACT	2	10	67968	67977	20 %	40 %	20 %	20 %	407702416
42	NC_018687	AAGAT	2	10	68038	68047	60 %	20 %	20 %	0 %	407702416
43	NC_018687	GCAAA	2	10	68428	68437	60 %	0 %	20 %	20 %	407702417
44	NC_018687	AGGTT	2	10	68697	68706	20 %	40 %	40 %	0 %	407702417
45	NC_018687	TTTTA	2	10	77302	77311	20 %	80 %	0 %	0 %	407702422
46	NC_018687	ATCAA	2	10	77420	77429	60 %	20 %	0 %	20 %	407702422
47	NC_018687	TGAAA	2	10	80816	80825	60 %	20 %	20 %	0 %	407702425
48	NC_018687	TAGGT	2	10	83661	83670	20 %	40 %	40 %	0 %	407702427
49	NC_018687	CTTAA	2	10	84916	84925	40 %	40 %	0 %	20 %	407702429
50	NC_018687	TTGTA	2	10	85110	85119	20 %	60 %	20 %	0 %	407702429
51	NC_018687	TTGGA	2	10	85254	85263	20 %	40 %	40 %	0 %	407702429
52	NC_018687	TCAAT	2	10	86175	86184	40 %	40 %	0 %	20 %	407702432
53	NC_018687	TTGTA	2	10	86943	86952	20 %	60 %	20 %	0 %	407702432
54	NC_018687	TTAAA	2	10	88453	88462	60 %	40 %	0 %	0 %	407702433
55	NC_018687	TATTT	2	10	91689	91698	20 %	80 %	0 %	0 %	407702434
56	NC_018687	GTTTT	2	10	93348	93357	0 %	80 %	20 %	0 %	407702436
57	NC_018687	TTTAC	2	10	97925	97934	20 %	60 %	0 %	20 %	407702439
58	NC_018687	TAAAT	2	10	103961	103970	60 %	40 %	0 %	0 %	407702443
59	NC_018687	TGATA	2	10	106295	106304	40 %	40 %	20 %	0 %	407702445
60	NC_018687	AAATT	2	10	107120	107129	60 %	40 %	0 %	0 %	407702446
61	NC_018687	GATTT	2	10	107529	107538	20 %	60 %	20 %	0 %	407702446
62	NC_018687	TCTTT	2	10	109260	109269	0 %	80 %	0 %	20 %	407702450
63	NC_018687	AAAAC	2	10	112039	112048	80 %	0 %	0 %	20 %	407702453
64	NC_018687	TTAAT	2	10	113324	113333	40 %	60 %	0 %	0 %	407702455
65	NC_018687	TGTCC	2	10	113821	113830	0 %	40 %	20 %	40 %	407702456
66	NC_018687	TAGCA	2	10	119290	119299	40 %	20 %	20 %	20 %	407702459
67	NC_018687	TACTG	2	10	120657	120666	20 %	40 %	20 %	20 %	407702460
68	NC_018687	AAAGT	2	10	122688	122697	60 %	20 %	20 %	0 %	407702463
69	NC_018687	TTTTA	2	10	123129	123138	20 %	80 %	0 %	0 %	407702465
70	NC_018687	GAATC	2	10	123139	123148	40 %	20 %	20 %	20 %	407702465
71	NC_018687	CTTCA	2	10	125415	125424	20 %	40 %	0 %	40 %	407702468
72	NC_018687	ATTAT	2	10	125773	125782	40 %	60 %	0 %	0 %	407702468
73	NC_018687	CGTGC	2	10	126873	126882	0 %	20 %	40 %	40 %	407702469
74	NC_018687	GATAG	2	10	128999	129008	40 %	20 %	40 %	0 %	407702470
75	NC_018687	ATGGA	2	10	129517	129526	40 %	20 %	40 %	0 %	407702471
76	NC_018687	AGAAA	2	10	130413	130422	80 %	0 %	20 %	0 %	407702471
77	NC_018687	TGAAC	2	10	130698	130707	40 %	20 %	20 %	20 %	407702471
78	NC_018687	ATGAA	2	10	139399	139408	60 %	20 %	20 %	0 %	407702483
79	NC_018687	GTTTC	2	10	142695	142704	0 %	60 %	20 %	20 %	407702486
80	NC_018687	TAAAT	2	10	144938	144947	60 %	40 %	0 %	0 %	407702487
81	NC_018687	AAATC	2	10	148797	148806	60 %	20 %	0 %	20 %	407702491
82	NC_018687	ATAAA	2	10	148877	148886	80 %	20 %	0 %	0 %	407702491
83	NC_018687	AAAAG	2	10	149511	149520	80 %	0 %	20 %	0 %	407702492
84	NC_018687	TAATA	2	10	151079	151088	60 %	40 %	0 %	0 %	407702493
85	NC_018687	ATGGA	2	10	151139	151148	40 %	20 %	40 %	0 %	407702493
86	NC_018687	AAATG	2	10	151879	151888	60 %	20 %	20 %	0 %	407702494
87	NC_018687	AAAAG	2	10	153549	153558	80 %	0 %	20 %	0 %	407702497
88	NC_018687	ATGAA	2	10	154611	154620	60 %	20 %	20 %	0 %	407702500
89	NC_018687	ATGTA	2	10	157637	157646	40 %	40 %	20 %	0 %	407702504
90	NC_018687	GTGTA	2	10	158929	158938	20 %	40 %	40 %	0 %	407702505
91	NC_018687	TGGAT	2	10	160787	160796	20 %	40 %	40 %	0 %	407702506
92	NC_018687	TTTTC	2	10	161058	161067	0 %	80 %	0 %	20 %	407702506
93	NC_018687	CTTTG	2	10	161149	161158	0 %	60 %	20 %	20 %	407702506
94	NC_018687	TAGAA	2	10	166241	166250	60 %	20 %	20 %	0 %	407702512
95	NC_018687	ACTAA	2	10	168818	168827	60 %	20 %	0 %	20 %	407702514
96	NC_018687	TATTT	2	10	169501	169510	20 %	80 %	0 %	0 %	407702516
97	NC_018687	TTACA	2	10	169650	169659	40 %	40 %	0 %	20 %	407702516
98	NC_018687	CTTGT	2	10	169680	169689	0 %	60 %	20 %	20 %	407702516
99	NC_018687	ATCTT	2	10	170308	170317	20 %	60 %	0 %	20 %	407702517
100	NC_018687	ATACT	2	10	170424	170433	40 %	40 %	0 %	20 %	407702517
101	NC_018687	GCAAT	2	10	170475	170484	40 %	20 %	20 %	20 %	407702517
102	NC_018687	TTGCT	2	10	171551	171560	0 %	60 %	20 %	20 %	407702517
103	NC_018687	ATGTC	2	10	173371	173380	20 %	40 %	20 %	20 %	407702518
104	NC_018687	TGATC	2	10	173783	173792	20 %	40 %	20 %	20 %	407702519
105	NC_018687	TTCAT	2	10	174610	174619	20 %	60 %	0 %	20 %	407702519
106	NC_018687	CTTTT	2	10	177055	177064	0 %	80 %	0 %	20 %	407702521
107	NC_018687	AAAAG	2	10	178918	178927	80 %	0 %	20 %	0 %	407702521
108	NC_018687	ATTGT	2	10	180328	180337	20 %	60 %	20 %	0 %	407702524
109	NC_018687	CTTCA	2	10	180957	180966	20 %	40 %	0 %	40 %	407702524
110	NC_018687	TTCAT	2	10	181777	181786	20 %	60 %	0 %	20 %	407702526
111	NC_018687	CTTTT	2	10	182814	182823	0 %	80 %	0 %	20 %	407702527
112	NC_018687	TTTTG	2	10	182956	182965	0 %	80 %	20 %	0 %	407702527
113	NC_018687	AAAAG	2	10	184176	184185	80 %	0 %	20 %	0 %	407702528
114	NC_018687	TGTCC	2	10	185970	185979	0 %	40 %	20 %	40 %	407702530
115	NC_018687	CGATC	2	10	188529	188538	20 %	20 %	20 %	40 %	407702532

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.