MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC189

Total Repeats: 380

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018687	CTTC	2	8	906	913	0 %	50 %	0 %	50 %	407702350
2	NC_018687	CTTC	2	8	1032	1039	0 %	50 %	0 %	50 %	407702350
3	NC_018687	CTTC	2	8	1074	1081	0 %	50 %	0 %	50 %	407702350
4	NC_018687	TTCC	2	8	1435	1442	0 %	50 %	0 %	50 %	407702350
5	NC_018687	AAAG	2	8	1707	1714	75 %	0 %	25 %	0 %	407702350
6	NC_018687	GAAA	2	8	1948	1955	75 %	0 %	25 %	0 %	407702350
7	NC_018687	ATCT	2	8	2099	2106	25 %	50 %	0 %	25 %	407702350
8	NC_018687	TTTG	2	8	2359	2366	0 %	75 %	25 %	0 %	407702350
9	NC_018687	ACAA	2	8	2418	2425	75 %	0 %	0 %	25 %	407702350
10	NC_018687	GGTT	2	8	3271	3278	0 %	50 %	50 %	0 %	407702352
11	NC_018687	AGGT	2	8	3688	3695	25 %	25 %	50 %	0 %	407702352
12	NC_018687	GTTA	2	8	3748	3755	25 %	50 %	25 %	0 %	407702352
13	NC_018687	TTTG	2	8	4187	4194	0 %	75 %	25 %	0 %	407702352
14	NC_018687	CATT	2	8	4440	4447	25 %	50 %	0 %	25 %	407702352
15	NC_018687	CTTG	2	8	4469	4476	0 %	50 %	25 %	25 %	407702352
16	NC_018687	TTTC	2	8	4590	4597	0 %	75 %	0 %	25 %	407702352
17	NC_018687	AATA	2	8	5071	5078	75 %	25 %	0 %	0 %	407702352
18	NC_018687	TGAT	2	8	5490	5497	25 %	50 %	25 %	0 %	407702352
19	NC_018687	ATAA	2	8	5755	5762	75 %	25 %	0 %	0 %	407702353
20	NC_018687	AACA	2	8	6059	6066	75 %	0 %	0 %	25 %	407702353
21	NC_018687	TTTA	2	8	6142	6149	25 %	75 %	0 %	0 %	407702354
22	NC_018687	TTAC	2	8	6633	6640	25 %	50 %	0 %	25 %	407702354
23	NC_018687	AATT	2	8	6658	6665	50 %	50 %	0 %	0 %	407702354
24	NC_018687	TGTT	2	8	6750	6757	0 %	75 %	25 %	0 %	407702354
25	NC_018687	CTTT	2	8	6991	6998	0 %	75 %	0 %	25 %	407702355
26	NC_018687	TAAA	2	8	7363	7370	75 %	25 %	0 %	0 %	407702355
27	NC_018687	CATT	2	8	7795	7802	25 %	50 %	0 %	25 %	407702355
28	NC_018687	GCTC	2	8	8187	8194	0 %	25 %	25 %	50 %	407702356
29	NC_018687	AACA	2	8	8224	8231	75 %	0 %	0 %	25 %	407702356
30	NC_018687	TTTA	2	8	8397	8404	25 %	75 %	0 %	0 %	407702357
31	NC_018687	TTTA	2	8	8524	8531	25 %	75 %	0 %	0 %	407702357
32	NC_018687	CATT	2	8	8739	8746	25 %	50 %	0 %	25 %	407702357
33	NC_018687	ATTA	2	8	9204	9211	50 %	50 %	0 %	0 %	407702358
34	NC_018687	CCAT	2	8	9214	9221	25 %	25 %	0 %	50 %	407702358
35	NC_018687	CGTT	2	8	10244	10251	0 %	50 %	25 %	25 %	407702360
36	NC_018687	GAAA	2	8	10346	10353	75 %	0 %	25 %	0 %	407702360
37	NC_018687	ATCC	2	8	10559	10566	25 %	25 %	0 %	50 %	407702360
38	NC_018687	TTCA	2	8	11465	11472	25 %	50 %	0 %	25 %	407702361
39	NC_018687	CTCA	2	8	11579	11586	25 %	25 %	0 %	50 %	407702361
40	NC_018687	CATG	2	8	11717	11724	25 %	25 %	25 %	25 %	407702361
41	NC_018687	CTTT	2	8	12748	12755	0 %	75 %	0 %	25 %	407702363
42	NC_018687	TTCA	2	8	13143	13150	25 %	50 %	0 %	25 %	407702363
43	NC_018687	TTGC	2	8	13599	13606	0 %	50 %	25 %	25 %	407702364
44	NC_018687	TATG	2	8	13929	13936	25 %	50 %	25 %	0 %	407702366
45	NC_018687	TTCA	2	8	14256	14263	25 %	50 %	0 %	25 %	407702366
46	NC_018687	TGCT	2	8	14553	14560	0 %	50 %	25 %	25 %	407702366
47	NC_018687	TCAA	2	8	14602	14609	50 %	25 %	0 %	25 %	407702366
48	NC_018687	CTGC	2	8	15371	15378	0 %	25 %	25 %	50 %	407702366
49	NC_018687	TGAT	2	8	16024	16031	25 %	50 %	25 %	0 %	407702366
50	NC_018687	AGCG	2	8	16685	16692	25 %	0 %	50 %	25 %	407702368
51	NC_018687	AAAG	2	8	16801	16808	75 %	0 %	25 %	0 %	407702368
52	NC_018687	TAAT	2	8	16947	16954	50 %	50 %	0 %	0 %	407702368
53	NC_018687	CTGA	2	8	17081	17088	25 %	25 %	25 %	25 %	407702368
54	NC_018687	ATCA	2	8	17657	17664	50 %	25 %	0 %	25 %	407702370
55	NC_018687	ACAA	2	8	19733	19740	75 %	0 %	0 %	25 %	407702371
56	NC_018687	AAAT	2	8	19782	19789	75 %	25 %	0 %	0 %	407702371
57	NC_018687	AATG	2	8	21130	21137	50 %	25 %	25 %	0 %	407702372
58	NC_018687	TTTG	2	8	21269	21276	0 %	75 %	25 %	0 %	407702373
59	NC_018687	ACAA	2	8	21465	21472	75 %	0 %	0 %	25 %	407702373
60	NC_018687	GAAA	2	8	21565	21572	75 %	0 %	25 %	0 %	407702373
61	NC_018687	GAAA	2	8	22876	22883	75 %	0 %	25 %	0 %	407702376
62	NC_018687	CATT	2	8	23530	23537	25 %	50 %	0 %	25 %	407702376
63	NC_018687	TCTT	2	8	24418	24425	0 %	75 %	0 %	25 %	407702377
64	NC_018687	CCTA	2	8	24465	24472	25 %	25 %	0 %	50 %	407702377
65	NC_018687	TGAA	2	8	27193	27200	50 %	25 %	25 %	0 %	407702378
66	NC_018687	TTAA	2	8	27312	27319	50 %	50 %	0 %	0 %	407702378
67	NC_018687	TGAA	2	8	27418	27425	50 %	25 %	25 %	0 %	407702378
68	NC_018687	ACTA	2	8	27593	27600	50 %	25 %	0 %	25 %	407702378
69	NC_018687	GAAA	2	8	28298	28305	75 %	0 %	25 %	0 %	407702378
70	NC_018687	AGAA	2	8	28339	28346	75 %	0 %	25 %	0 %	407702378
71	NC_018687	AGAA	2	8	28564	28571	75 %	0 %	25 %	0 %	407702378
72	NC_018687	TAAA	2	8	28645	28652	75 %	25 %	0 %	0 %	407702378
73	NC_018687	GAAA	2	8	28745	28752	75 %	0 %	25 %	0 %	407702378
74	NC_018687	ATAA	2	8	29238	29245	75 %	25 %	0 %	0 %	407702378
75	NC_018687	ACAA	2	8	29895	29902	75 %	0 %	0 %	25 %	407702380
76	NC_018687	TGTT	2	8	30167	30174	0 %	75 %	25 %	0 %	407702380
77	NC_018687	TTTA	2	8	30856	30863	25 %	75 %	0 %	0 %	407702381
78	NC_018687	AAAG	2	8	31098	31105	75 %	0 %	25 %	0 %	407702382
79	NC_018687	GGTT	2	8	31120	31127	0 %	50 %	50 %	0 %	407702382
80	NC_018687	GAAT	2	8	34020	34027	50 %	25 %	25 %	0 %	407702386
81	NC_018687	ATTA	2	8	34306	34313	50 %	50 %	0 %	0 %	407702386
82	NC_018687	CCCA	2	8	34578	34585	25 %	0 %	0 %	75 %	407702386
83	NC_018687	TGTT	2	8	34668	34675	0 %	75 %	25 %	0 %	407702386
84	NC_018687	TTGG	2	8	34676	34683	0 %	50 %	50 %	0 %	407702386
85	NC_018687	AGTA	2	8	34947	34954	50 %	25 %	25 %	0 %	407702386
86	NC_018687	CCAG	2	8	36022	36029	25 %	0 %	25 %	50 %	407702387
87	NC_018687	TTGC	2	8	36267	36274	0 %	50 %	25 %	25 %	407702387
88	NC_018687	TAAA	2	8	36385	36392	75 %	25 %	0 %	0 %	407702388
89	NC_018687	TTTC	2	8	36467	36474	0 %	75 %	0 %	25 %	407702388
90	NC_018687	CATT	2	8	36532	36539	25 %	50 %	0 %	25 %	407702388
91	NC_018687	TATG	2	8	37114	37121	25 %	50 %	25 %	0 %	407702389
92	NC_018687	CAAA	2	8	37658	37665	75 %	0 %	0 %	25 %	407702390
93	NC_018687	TCAA	2	8	37834	37841	50 %	25 %	0 %	25 %	407702390
94	NC_018687	TTTG	2	8	38134	38141	0 %	75 %	25 %	0 %	407702390
95	NC_018687	TATT	2	8	39771	39778	25 %	75 %	0 %	0 %	407702391
96	NC_018687	CCAG	2	8	39918	39925	25 %	0 %	25 %	50 %	407702391
97	NC_018687	GAAA	2	8	39999	40006	75 %	0 %	25 %	0 %	407702391
98	NC_018687	ATTA	2	8	40410	40417	50 %	50 %	0 %	0 %	407702392
99	NC_018687	TCCC	2	8	40460	40467	0 %	25 %	0 %	75 %	407702392
100	NC_018687	TACT	2	8	40515	40522	25 %	50 %	0 %	25 %	407702392
101	NC_018687	TAAA	2	8	41012	41019	75 %	25 %	0 %	0 %	407702393
102	NC_018687	GGTA	2	8	41208	41215	25 %	25 %	50 %	0 %	407702393
103	NC_018687	AAAT	2	8	41296	41303	75 %	25 %	0 %	0 %	407702393
104	NC_018687	GTTC	2	8	44956	44963	0 %	50 %	25 %	25 %	407702398
105	NC_018687	ACTT	2	8	45045	45052	25 %	50 %	0 %	25 %	407702398
106	NC_018687	TTCA	2	8	45085	45092	25 %	50 %	0 %	25 %	407702398
107	NC_018687	CAAA	2	8	45767	45774	75 %	0 %	0 %	25 %	407702399
108	NC_018687	TAAT	2	8	45954	45961	50 %	50 %	0 %	0 %	407702399
109	NC_018687	TTTA	2	8	46263	46270	25 %	75 %	0 %	0 %	407702399
110	NC_018687	ACCT	2	8	46430	46437	25 %	25 %	0 %	50 %	407702399
111	NC_018687	AGTA	2	8	46717	46724	50 %	25 %	25 %	0 %	407702399
112	NC_018687	TGGA	2	8	48650	48657	25 %	25 %	50 %	0 %	407702401
113	NC_018687	AAAC	2	8	49777	49784	75 %	0 %	0 %	25 %	407702403
114	NC_018687	GCTA	2	8	49823	49830	25 %	25 %	25 %	25 %	407702403
115	NC_018687	GCAA	2	8	51046	51053	50 %	0 %	25 %	25 %	407702404
116	NC_018687	TGTA	2	8	51182	51189	25 %	50 %	25 %	0 %	407702404
117	NC_018687	TTTA	2	8	51217	51224	25 %	75 %	0 %	0 %	407702404
118	NC_018687	ACAA	2	8	51241	51248	75 %	0 %	0 %	25 %	407702404
119	NC_018687	AATA	2	8	51449	51456	75 %	25 %	0 %	0 %	407702404
120	NC_018687	ATAG	2	8	51527	51534	50 %	25 %	25 %	0 %	407702404
121	NC_018687	GAAA	2	8	51959	51966	75 %	0 %	25 %	0 %	407702404
122	NC_018687	CTAT	2	8	52041	52048	25 %	50 %	0 %	25 %	407702404
123	NC_018687	ATTT	2	8	53132	53139	25 %	75 %	0 %	0 %	407702405
124	NC_018687	ACCA	2	8	53145	53152	50 %	0 %	0 %	50 %	407702405
125	NC_018687	AATA	2	8	54149	54156	75 %	25 %	0 %	0 %	407702407
126	NC_018687	AATA	2	8	54896	54903	75 %	25 %	0 %	0 %	407702408
127	NC_018687	AATA	2	8	56614	56621	75 %	25 %	0 %	0 %	407702410
128	NC_018687	CCAA	2	8	62531	62538	50 %	0 %	0 %	50 %	407702412
129	NC_018687	CCAA	2	8	63250	63257	50 %	0 %	0 %	50 %	407702412
130	NC_018687	ATAC	2	8	63329	63336	50 %	25 %	0 %	25 %	407702412
131	NC_018687	TAAA	2	8	64147	64154	75 %	25 %	0 %	0 %	407702413
132	NC_018687	GATT	2	8	65554	65561	25 %	50 %	25 %	0 %	407702413
133	NC_018687	TCTA	2	8	65577	65584	25 %	50 %	0 %	25 %	407702413
134	NC_018687	ATGA	2	8	65968	65975	50 %	25 %	25 %	0 %	407702414
135	NC_018687	AATT	2	8	66011	66018	50 %	50 %	0 %	0 %	407702414
136	NC_018687	ATTC	2	8	67018	67025	25 %	50 %	0 %	25 %	407702416
137	NC_018687	AATA	2	8	67189	67196	75 %	25 %	0 %	0 %	407702416
138	NC_018687	TGCA	2	8	67204	67211	25 %	25 %	25 %	25 %	407702416
139	NC_018687	AATG	2	8	67322	67329	50 %	25 %	25 %	0 %	407702416
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.