MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018686	GTATTC	2	12	3068	3079	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407702142
2	NC_018686	CCAGTT	2	12	3120	3131	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407702142
3	NC_018686	TAAAGA	2	12	3953	3964	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407702142
4	NC_018686	ACAAAA	2	12	4710	4721	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018686	ACAGGG	2	12	6060	6071	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	407702146
6	NC_018686	AAAGAA	2	12	6794	6805	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407702147
7	NC_018686	TTCATG	2	12	9365	9376	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407702152
8	NC_018686	TGAATT	2	12	9778	9789	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702153
9	NC_018686	GATACA	2	12	12052	12063	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407702154
10	NC_018686	TGATAT	2	12	13794	13805	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702154
11	NC_018686	GGAACA	2	12	16771	16782	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407702155
12	NC_018686	TATGAA	2	12	18846	18857	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407702158
13	NC_018686	TACAAG	2	12	20852	20863	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407702161
14	NC_018686	GATTAT	2	12	23894	23905	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702163
15	NC_018686	AATTTT	2	12	26816	26827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702167
16	NC_018686	TAGAAG	2	12	29919	29930	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407702172
17	NC_018686	ACATTC	2	12	30228	30239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702172
18	NC_018686	AAAGAA	2	12	30769	30780	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407702172
19	NC_018686	AGAAAA	2	12	34860	34871	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407702178
20	NC_018686	GGATAT	2	12	36105	36116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702179
21	NC_018686	ACAAAT	2	12	37672	37683	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018686	ATTGCT	2	12	40082	40093	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407702184
23	NC_018686	AAGCAC	2	12	40781	40792	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407702185
24	NC_018686	GAAAAA	2	12	43782	43793	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407702188
25	NC_018686	TGGATT	2	12	45499	45510	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018686	ATTTGA	2	12	48805	48816	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702195
27	NC_018686	GGTTGC	2	12	50919	50930	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	407702198
28	NC_018686	AAAAAG	2	12	56156	56167	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407702202
29	NC_018686	TTATTT	2	12	65705	65716	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407702214
30	NC_018686	TGTACA	2	12	67183	67194	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018686	TATTGA	2	12	68215	68226	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702216
32	NC_018686	TAATAG	2	12	75982	75993	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407702227
33	NC_018686	TTTCAA	2	12	77561	77572	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407702229
34	NC_018686	AATTAA	2	12	78644	78655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702231
35	NC_018686	TTTTTA	2	12	81579	81590	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018686	CCAGTT	2	12	84713	84724	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407702243
37	NC_018686	GATTTT	2	12	86417	86428	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407702245
38	NC_018686	TTTTGG	2	12	88036	88047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702247
39	NC_018686	AGCTGA	2	12	88240	88251	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407702247
40	NC_018686	AGAAAA	2	12	91905	91916	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407702254
41	NC_018686	ATGTAT	2	12	93034	93045	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702254
42	NC_018686	TGTAAT	2	12	96387	96398	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702256
43	NC_018686	TTTGTA	2	12	96913	96924	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407702256
44	NC_018686	GATTAT	2	12	105305	105316	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702263
45	NC_018686	AGCAGT	2	12	106732	106743	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407702264
46	NC_018686	GGAAAA	2	12	108157	108168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702266
47	NC_018686	TAAGGA	2	12	108988	108999	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407702267
48	NC_018686	TCATAT	2	12	111214	111225	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407702270
49	NC_018686	AGAAAA	2	12	112310	112321	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407702271
50	NC_018686	GAAAAA	2	12	114309	114320	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407702274
51	NC_018686	ATTGAG	2	12	114853	114864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702275
52	NC_018686	GAAAAA	2	12	114943	114954	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407702275
53	NC_018686	GAAAAA	2	12	115864	115875	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407702275
54	NC_018686	ATTATA	2	12	134032	134043	50 %	50 %	0 %	0 %	407702291
55	NC_018686	GTTCTA	2	12	138336	138347	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407702298
56	NC_018686	AATTTG	2	12	138622	138633	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018686	TTTGAT	2	12	140800	140811	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407702301
58	NC_018686	TGAAAT	2	12	141749	141760	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407702302
59	NC_018686	CGTATA	2	12	143451	143462	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407702302
60	NC_018686	ATTTCT	2	12	150588	150599	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407702308
61	NC_018686	CATGTA	2	12	151226	151237	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407702308
62	NC_018686	TTGAAA	2	12	155356	155367	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018686	AGCAAG	2	12	156115	156126	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407702312
64	NC_018686	TTTTCA	2	12	163247	163258	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407702319
65	NC_018686	AAAACG	2	12	164876	164887	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407702322
66	NC_018686	GTTAAA	2	12	165431	165442	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407702322
67	NC_018686	GAAAAA	2	12	165675	165686	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407702322
68	NC_018686	AATAAG	2	12	166471	166482	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018686	TATTGA	2	12	170455	170466	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702327
70	NC_018686	TTGCAT	2	12	171468	171479	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407702327
71	NC_018686	GGAAAA	2	12	178367	178378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702336
72	NC_018686	AATTAA	2	12	179467	179478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702337
73	NC_018686	TTTTTA	2	12	182198	182209	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.