MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018686	CTAAC	2	10	2359	2368	40 %	20 %	0 %	40 %	407702142
2	NC_018686	GACTG	2	10	3411	3420	20 %	20 %	40 %	20 %	407702142
3	NC_018686	TTGAA	2	10	3700	3709	40 %	40 %	20 %	0 %	407702142
4	NC_018686	ACGAA	2	10	3841	3850	60 %	0 %	20 %	20 %	407702142
5	NC_018686	TTTTC	2	10	6915	6924	0 %	80 %	0 %	20 %	407702147
6	NC_018686	AAATT	2	10	9212	9221	60 %	40 %	0 %	0 %	407702152
7	NC_018686	AAGAA	2	10	11609	11618	80 %	0 %	20 %	0 %	407702154
8	NC_018686	TGCAT	2	10	13665	13674	20 %	40 %	20 %	20 %	407702154
9	NC_018686	AGAAA	2	10	13982	13991	80 %	0 %	20 %	0 %	407702154
10	NC_018686	AATGG	2	10	14896	14905	40 %	20 %	40 %	0 %	407702155
11	NC_018686	GAAAA	2	10	15827	15836	80 %	0 %	20 %	0 %	407702155
12	NC_018686	GAAGA	2	10	16139	16148	60 %	0 %	40 %	0 %	407702155
13	NC_018686	GAAGA	2	10	16229	16238	60 %	0 %	40 %	0 %	407702155
14	NC_018686	ACAAA	2	10	16296	16305	80 %	0 %	0 %	20 %	407702155
15	NC_018686	GAAGA	2	10	16319	16328	60 %	0 %	40 %	0 %	407702155
16	NC_018686	GAAGA	2	10	16409	16418	60 %	0 %	40 %	0 %	407702155
17	NC_018686	GAAGA	2	10	16499	16508	60 %	0 %	40 %	0 %	407702155
18	NC_018686	ACAAA	2	10	16566	16575	80 %	0 %	0 %	20 %	407702155
19	NC_018686	GAAGA	2	10	16589	16598	60 %	0 %	40 %	0 %	407702155
20	NC_018686	GAAGC	2	10	17657	17666	40 %	0 %	40 %	20 %	407702155
21	NC_018686	GAAAA	2	10	18641	18650	80 %	0 %	20 %	0 %	407702158
22	NC_018686	GAAAG	2	10	19429	19438	60 %	0 %	40 %	0 %	407702160
23	NC_018686	GGAGC	2	10	27295	27304	20 %	0 %	60 %	20 %	407702168
24	NC_018686	AGAGA	2	10	27433	27442	60 %	0 %	40 %	0 %	407702168
25	NC_018686	GAAAA	2	10	27650	27659	80 %	0 %	20 %	0 %	407702168
26	NC_018686	AGAAA	2	10	27950	27959	80 %	0 %	20 %	0 %	407702169
27	NC_018686	TAGGA	2	10	29383	29392	40 %	20 %	40 %	0 %	407702171
28	NC_018686	CCAAA	2	10	29522	29531	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_018686	ATCTA	2	10	30406	30415	40 %	40 %	0 %	20 %	407702172
30	NC_018686	AAAAG	2	10	30460	30469	80 %	0 %	20 %	0 %	407702172
31	NC_018686	ACGTT	2	10	31788	31797	20 %	40 %	20 %	20 %	407702173
32	NC_018686	GCGAA	2	10	33361	33370	40 %	0 %	40 %	20 %	407702175
33	NC_018686	ATGGA	2	10	35129	35138	40 %	20 %	40 %	0 %	407702178
34	NC_018686	AAAAT	2	10	36603	36612	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018686	TATTT	2	10	37356	37365	20 %	80 %	0 %	0 %	407702181
36	NC_018686	GTCAG	2	10	39214	39223	20 %	20 %	40 %	20 %	407702183
37	NC_018686	ATAAA	2	10	39701	39710	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018686	GATTT	2	10	40118	40127	20 %	60 %	20 %	0 %	407702184
39	NC_018686	ATTAC	2	10	41273	41282	40 %	40 %	0 %	20 %	407702185
40	NC_018686	AAAGG	2	10	41587	41596	60 %	0 %	40 %	0 %	407702185
41	NC_018686	GAAAT	2	10	42148	42157	60 %	20 %	20 %	0 %	407702185
42	NC_018686	AGAGG	2	10	42590	42599	40 %	0 %	60 %	0 %	407702186
43	NC_018686	CTATT	2	10	43588	43597	20 %	60 %	0 %	20 %	407702188
44	NC_018686	TTATT	2	10	44216	44225	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018686	ATAAA	2	10	45273	45282	80 %	20 %	0 %	0 %	407702189
46	NC_018686	TAGAT	2	10	48015	48024	40 %	40 %	20 %	0 %	407702193
47	NC_018686	ATAGT	2	10	48162	48171	40 %	40 %	20 %	0 %	407702193
48	NC_018686	GAAAT	2	10	49638	49647	60 %	20 %	20 %	0 %	407702196
49	NC_018686	TGTAT	2	10	49962	49971	20 %	60 %	20 %	0 %	407702196
50	NC_018686	AAAAT	2	10	50214	50223	80 %	20 %	0 %	0 %	407702197
51	NC_018686	TAATT	2	10	51574	51583	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018686	ATTCA	2	10	52075	52084	40 %	40 %	0 %	20 %	407702199
53	NC_018686	ATGCA	2	10	54212	54221	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_018686	TAATG	2	10	56224	56233	40 %	40 %	20 %	0 %	407702202
55	NC_018686	TTGTT	2	10	57135	57144	0 %	80 %	20 %	0 %	407702204
56	NC_018686	GTTAG	2	10	57524	57533	20 %	40 %	40 %	0 %	407702205
57	NC_018686	TTTTC	2	10	59133	59142	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_018686	AGTTA	2	10	62148	62157	40 %	40 %	20 %	0 %	407702209
59	NC_018686	GAAAA	2	10	62486	62495	80 %	0 %	20 %	0 %	407702209
60	NC_018686	AGCAA	2	10	62547	62556	60 %	0 %	20 %	20 %	407702209
61	NC_018686	CTTTC	2	10	64588	64597	0 %	60 %	0 %	40 %	407702212
62	NC_018686	ATTAG	2	10	65277	65286	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018686	GATAA	2	10	66863	66872	60 %	20 %	20 %	0 %	407702215
64	NC_018686	GTGTT	2	10	70186	70195	0 %	60 %	40 %	0 %	407702217
65	NC_018686	AGTTA	2	10	70743	70752	40 %	40 %	20 %	0 %	407702218
66	NC_018686	TCATG	2	10	71404	71413	20 %	40 %	20 %	20 %	407702218
67	NC_018686	AATGA	2	10	73848	73857	60 %	20 %	20 %	0 %	407702221
68	NC_018686	TGTTT	2	10	75768	75777	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018686	TCCAA	2	10	76486	76495	40 %	20 %	0 %	40 %	407702227
70	NC_018686	AAGTT	2	10	77147	77156	40 %	40 %	20 %	0 %	407702228
71	NC_018686	ATAAG	2	10	78893	78902	60 %	20 %	20 %	0 %	407702233
72	NC_018686	AAACA	2	10	79324	79333	80 %	0 %	0 %	20 %	407702233
73	NC_018686	TGTTT	2	10	79644	79653	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018686	AAAAG	2	10	79718	79727	80 %	0 %	20 %	0 %	407702234
75	NC_018686	CATTA	2	10	81266	81275	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018686	TTGTT	3	15	82093	82107	0 %	80 %	20 %	0 %	407702239
77	NC_018686	CTAAC	2	10	83952	83961	40 %	20 %	0 %	40 %	407702243
78	NC_018686	GATTT	2	10	85314	85323	20 %	60 %	20 %	0 %	407702243
79	NC_018686	GTAAA	2	10	86957	86966	60 %	20 %	20 %	0 %	407702246
80	NC_018686	AATGA	2	10	88929	88938	60 %	20 %	20 %	0 %	407702248
81	NC_018686	TGGAC	2	10	90935	90944	20 %	20 %	40 %	20 %	407702253
82	NC_018686	CAAAA	2	10	92099	92108	80 %	0 %	0 %	20 %	407702254
83	NC_018686	AAGAA	2	10	93337	93346	80 %	0 %	20 %	0 %	407702255
84	NC_018686	ATTTT	2	10	95587	95596	20 %	80 %	0 %	0 %	407702255
85	NC_018686	TGTTT	2	10	97139	97148	0 %	80 %	20 %	0 %	407702256
86	NC_018686	GAAAA	2	10	97559	97568	80 %	0 %	20 %	0 %	407702256
87	NC_018686	AATAG	2	10	97687	97696	60 %	20 %	20 %	0 %	407702256
88	NC_018686	TGAAA	2	10	99260	99269	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018686	AAGGA	2	10	100173	100182	60 %	0 %	40 %	0 %	407702258
90	NC_018686	ATTTG	2	10	101448	101457	20 %	60 %	20 %	0 %	407702260
91	NC_018686	TTTTA	2	10	102239	102248	20 %	80 %	0 %	0 %	407702261
92	NC_018686	AAATA	2	10	107869	107878	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018686	GAAAA	2	10	108006	108015	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018686	AATTT	2	10	109473	109482	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018686	TAAAG	2	10	112763	112772	60 %	20 %	20 %	0 %	407702271
96	NC_018686	GTAAA	2	10	113895	113904	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018686	AAAAG	2	10	114444	114453	80 %	0 %	20 %	0 %	407702275
98	NC_018686	ATGAA	2	10	115517	115526	60 %	20 %	20 %	0 %	407702275
99	NC_018686	GAATT	2	10	115745	115754	40 %	40 %	20 %	0 %	407702275
100	NC_018686	TGTAT	2	10	115986	115995	20 %	60 %	20 %	0 %	407702275
101	NC_018686	ATTCT	2	10	116773	116782	20 %	60 %	0 %	20 %	407702275
102	NC_018686	AAAGT	2	10	118117	118126	60 %	20 %	20 %	0 %	407702275
103	NC_018686	TTCAA	2	10	118295	118304	40 %	40 %	0 %	20 %	407702275
104	NC_018686	TGAAT	2	10	120684	120693	40 %	40 %	20 %	0 %	407702275
105	NC_018686	AAAAT	2	10	122625	122634	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018686	TATTT	2	10	123378	123387	20 %	80 %	0 %	0 %	407702278
107	NC_018686	TGCAT	2	10	124277	124286	20 %	40 %	20 %	20 %	407702279
108	NC_018686	GTTTT	2	10	124323	124332	0 %	80 %	20 %	0 %	407702279
109	NC_018686	AGAAA	2	10	126739	126748	80 %	0 %	20 %	0 %	407702282
110	NC_018686	GATTT	2	10	128095	128104	20 %	60 %	20 %	0 %	407702284
111	NC_018686	ATTAC	2	10	129266	129275	40 %	40 %	0 %	20 %	407702285
112	NC_018686	AAAGG	2	10	129580	129589	60 %	0 %	40 %	0 %	407702285
113	NC_018686	TTGTA	2	10	133985	133994	20 %	60 %	20 %	0 %	407702291
114	NC_018686	TTTGT	2	10	138881	138890	0 %	80 %	20 %	0 %	407702299
115	NC_018686	GAAAT	2	10	145285	145294	60 %	20 %	20 %	0 %	407702302
116	NC_018686	CAATT	2	10	145647	145656	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_018686	GAAAA	2	10	146148	146157	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018686	ATTTT	2	10	147151	147160	20 %	80 %	0 %	0 %	407702303
119	NC_018686	TTTTC	2	10	147249	147258	0 %	80 %	0 %	20 %	407702303
120	NC_018686	ATATT	2	10	147289	147298	40 %	60 %	0 %	0 %	407702303
121	NC_018686	TTTTA	2	10	147745	147754	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018686	CATTT	2	10	150254	150263	20 %	60 %	0 %	20 %	407702307
123	NC_018686	ACATT	2	10	150452	150461	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_018686	AAACT	2	10	150713	150722	60 %	20 %	0 %	20 %	407702308
125	NC_018686	CAAAA	2	10	152812	152821	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_018686	TAAAA	2	10	154004	154013	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018686	AGTAT	2	10	154606	154615	40 %	40 %	20 %	0 %	407702311
128	NC_018686	ATTTT	2	10	154740	154749	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018686	AAAAC	2	10	157293	157302	80 %	0 %	0 %	20 %	407702313
130	NC_018686	GAAAA	2	10	157491	157500	80 %	0 %	20 %	0 %	407702313
131	NC_018686	TTTGT	2	10	158619	158628	0 %	80 %	20 %	0 %	407702315
132	NC_018686	TTATA	2	10	158757	158766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018686	GAAAA	2	10	161319	161328	80 %	0 %	20 %	0 %	407702317
134	NC_018686	TGAAG	2	10	161878	161887	40 %	20 %	40 %	0 %	407702317
135	NC_018686	TCTTT	2	10	165061	165070	0 %	80 %	0 %	20 %	407702322
136	NC_018686	AGATA	2	10	165662	165671	60 %	20 %	20 %	0 %	407702322
137	NC_018686	TTTTA	2	10	166264	166273	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018686	TAAAT	2	10	167241	167250	60 %	40 %	0 %	0 %	407702324
139	NC_018686	GTGTT	2	10	172418	172427	0 %	60 %	40 %	0 %	407702328
140	NC_018686	ATAAA	2	10	172887	172896	80 %	20 %	0 %	0 %	407702329
141	NC_018686	TCAAT	2	10	173044	173053	40 %	40 %	0 %	20 %	407702329
142	NC_018686	GATTC	2	10	174372	174381	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_018686	AAATG	2	10	176715	176724	60 %	20 %	20 %	0 %	407702333
144	NC_018686	ATGAA	2	10	178446	178455	60 %	20 %	20 %	0 %	407702336
145	NC_018686	ATAAG	2	10	179716	179725	60 %	20 %	20 %	0 %	407702339
146	NC_018686	TGTTT	2	10	180263	180272	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018686	AAAAG	2	10	180337	180346	80 %	0 %	20 %	0 %	407702340
148	NC_018686	CATTA	2	10	181885	181894	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_018686	TTGTT	3	15	182712	182726	0 %	80 %	20 %	0 %	407702345

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.