MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018686	CCAAA	2	10	29522	29531	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_018686	AAAAT	2	10	36603	36612	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018686	ATAAA	2	10	39701	39710	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018686	TTATT	2	10	44216	44225	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018686	TAATT	2	10	51574	51583	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018686	ATGCA	2	10	54212	54221	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_018686	TTTTC	2	10	59133	59142	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018686	ATTAG	2	10	65277	65286	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018686	TGTTT	2	10	75768	75777	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018686	TGTTT	2	10	79644	79653	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018686	CATTA	2	10	81266	81275	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018686	TGAAA	2	10	99260	99269	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018686	AAATA	2	10	107869	107878	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018686	GAAAA	2	10	108006	108015	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018686	AATTT	2	10	109473	109482	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018686	GTAAA	2	10	113895	113904	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018686	AAAAT	2	10	122625	122634	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018686	CAATT	2	10	145647	145656	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018686	GAAAA	2	10	146148	146157	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018686	TTTTA	2	10	147745	147754	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018686	ACATT	2	10	150452	150461	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_018686	CAAAA	2	10	152812	152821	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018686	TAAAA	2	10	154004	154013	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018686	ATTTT	2	10	154740	154749	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018686	TTATA	2	10	158757	158766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018686	TTTTA	2	10	166264	166273	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018686	GATTC	2	10	174372	174381	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018686	TGTTT	2	10	180263	180272	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018686	CATTA	2	10	181885	181894	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.