MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018686	TTGG	2	8	507	514	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018686	GAAT	2	8	782	789	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018686	GATA	2	8	1092	1099	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018686	AGGA	2	8	1125	1132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018686	GAAT	2	8	1133	1140	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018686	GAAA	2	8	1537	1544	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018686	ATTT	2	8	22492	22499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018686	CATG	2	8	22578	22585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_018686	GTCA	2	8	25689	25696	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018686	ACTA	2	8	26483	26490	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_018686	AAAT	2	8	26512	26519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018686	AGGA	2	8	26525	26532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018686	TATT	2	8	28528	28535	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018686	AAAG	2	8	37095	37102	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018686	ATAA	2	8	37684	37691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018686	TTAA	2	8	39625	39632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018686	TAGT	2	8	42902	42909	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018686	TTAA	2	8	43516	43523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018686	ATAC	2	8	44126	44133	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018686	ATGG	2	8	44207	44214	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018686	TTGG	2	8	45525	45532	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018686	ATTG	2	8	47357	47364	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018686	TGAT	2	8	47428	47435	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018686	GGTT	2	8	47468	47475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018686	TTTA	2	8	50007	50014	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018686	TTTA	2	8	51823	51830	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018686	ATAA	2	8	51850	51857	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018686	ATAA	2	8	58810	58817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018686	AATT	2	8	58940	58947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018686	ATAA	2	8	58981	58988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018686	GTTG	2	8	58991	58998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018686	TAAA	2	8	60066	60073	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018686	CATT	2	8	60872	60879	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018686	TGTA	2	8	61167	61174	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018686	CGTA	2	8	61397	61404	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018686	TGTA	2	8	65434	65441	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018686	TAAT	2	8	67228	67235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018686	ACAA	2	8	67329	67336	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018686	TTTA	2	8	67776	67783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018686	AGCT	2	8	69451	69458	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018686	TGAA	2	8	72054	72061	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018686	GATT	2	8	73494	73501	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018686	CATT	2	8	73505	73512	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018686	TAAT	2	8	75779	75786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018686	AATT	2	8	75788	75795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018686	TAAT	2	8	79655	79662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018686	AAAG	2	8	79669	79676	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018686	ATAA	2	8	81647	81654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018686	TTTA	2	8	81701	81708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018686	GAAT	2	8	82375	82382	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018686	GATA	2	8	82685	82692	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018686	AGGA	2	8	82718	82725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018686	GAAT	2	8	82726	82733	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018686	GAAA	2	8	83130	83137	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018686	GTAT	2	8	86515	86522	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018686	AAAG	2	8	88336	88343	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018686	GGTG	2	8	89974	89981	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018686	ATAA	2	8	95896	95903	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018686	CAGA	2	8	99238	99245	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018686	ATTT	2	8	99399	99406	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018686	ATTT	2	8	103903	103910	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018686	CATG	2	8	103989	103996	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018686	AAAG	2	8	108067	108074	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018686	AAAG	2	8	123117	123124	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018686	AAAT	2	8	123791	123798	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018686	AGAA	2	8	134069	134076	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018686	CATA	2	8	134096	134103	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018686	ATAC	2	8	135311	135318	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_018686	GTTT	2	8	135385	135392	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018686	GCAA	2	8	135461	135468	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018686	TTCT	2	8	138179	138186	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_018686	TATT	2	8	139063	139070	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018686	AAAT	2	8	139251	139258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018686	TATT	2	8	139292	139299	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018686	CATT	2	8	140040	140047	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_018686	ATAA	2	8	140096	140103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018686	ATTT	2	8	141388	141395	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018686	TTTA	2	8	141470	141477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018686	ATAA	2	8	145531	145538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018686	ACTC	2	8	145929	145936	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_018686	TTTC	2	8	146369	146376	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_018686	ACAA	2	8	146535	146542	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_018686	TAAT	2	8	147859	147866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018686	GTTT	2	8	149393	149400	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018686	AAGT	2	8	149488	149495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018686	AAAT	2	8	152236	152243	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018686	ATTT	2	8	152786	152793	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018686	AACG	2	8	153304	153311	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_018686	ATTA	2	8	153357	153364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018686	TTTA	2	8	154668	154675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018686	TCTT	2	8	155449	155456	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_018686	CATC	2	8	156492	156499	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_018686	TATT	2	8	158797	158804	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018686	AAAT	2	8	158983	158990	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018686	TATT	2	8	159024	159031	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018686	CATT	2	8	159772	159779	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_018686	TTTA	2	8	159929	159936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018686	ATTA	2	8	159988	159995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018686	CGTA	2	8	160230	160237	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_018686	TTCA	2	8	163574	163581	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_018686	TTAT	2	8	163598	163605	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018686	TTCT	2	8	164731	164738	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_018686	TAAA	2	8	166356	166363	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018686	ATGA	2	8	166507	166514	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018686	AAAT	2	8	166657	166664	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018686	CAGA	2	8	169745	169752	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_018686	TATT	2	8	170018	170025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018686	AGCT	2	8	171691	171698	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_018686	CCGA	2	8	175847	175854	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_018686	TTTG	2	8	176501	176508	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018686	AATG	2	8	176561	176568	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018686	ATAA	2	8	177235	177242	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018686	TCAT	2	8	177403	177410	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_018686	AATT	2	8	178281	178288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018686	TAAT	2	8	180274	180281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018686	AAAG	2	8	180288	180295	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018686	ATAA	2	8	182266	182273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018686	TTTA	2	8	182320	182327	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.