MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183

Total Repeats: 395

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018686	TA	3	6	768	773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018686	TA	3	6	2977	2982	50 %	50 %	0 %	0 %	407702142
3	NC_018686	AT	3	6	4121	4126	50 %	50 %	0 %	0 %	407702142
4	NC_018686	AG	3	6	5057	5062	50 %	0 %	50 %	0 %	407702145
5	NC_018686	AT	3	6	5701	5706	50 %	50 %	0 %	0 %	407702146
6	NC_018686	TA	3	6	5790	5795	50 %	50 %	0 %	0 %	407702146
7	NC_018686	AT	3	6	6101	6106	50 %	50 %	0 %	0 %	407702146
8	NC_018686	TA	3	6	6933	6938	50 %	50 %	0 %	0 %	407702147
9	NC_018686	TA	3	6	8122	8127	50 %	50 %	0 %	0 %	407702148
10	NC_018686	AG	3	6	8351	8356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018686	GA	3	6	8523	8528	50 %	0 %	50 %	0 %	407702149
12	NC_018686	AG	3	6	8746	8751	50 %	0 %	50 %	0 %	407702149
13	NC_018686	TC	3	6	8887	8892	0 %	50 %	0 %	50 %	407702150
14	NC_018686	AC	3	6	9503	9508	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018686	AG	3	6	9579	9584	50 %	0 %	50 %	0 %	407702153
16	NC_018686	AT	3	6	9706	9711	50 %	50 %	0 %	0 %	407702153
17	NC_018686	TA	3	6	9889	9894	50 %	50 %	0 %	0 %	407702153
18	NC_018686	GA	3	6	10594	10599	50 %	0 %	50 %	0 %	407702153
19	NC_018686	TA	3	6	11382	11387	50 %	50 %	0 %	0 %	407702153
20	NC_018686	TC	3	6	12359	12364	0 %	50 %	0 %	50 %	407702154
21	NC_018686	TG	3	6	12457	12462	0 %	50 %	50 %	0 %	407702154
22	NC_018686	TC	3	6	13613	13618	0 %	50 %	0 %	50 %	407702154
23	NC_018686	AT	3	6	13890	13895	50 %	50 %	0 %	0 %	407702154
24	NC_018686	TA	3	6	15392	15397	50 %	50 %	0 %	0 %	407702155
25	NC_018686	GA	3	6	16643	16648	50 %	0 %	50 %	0 %	407702155
26	NC_018686	TC	3	6	18015	18020	0 %	50 %	0 %	50 %	407702156
27	NC_018686	AG	3	6	18054	18059	50 %	0 %	50 %	0 %	407702156
28	NC_018686	TA	3	6	18337	18342	50 %	50 %	0 %	0 %	407702158
29	NC_018686	GA	3	6	18377	18382	50 %	0 %	50 %	0 %	407702158
30	NC_018686	AT	3	6	18471	18476	50 %	50 %	0 %	0 %	407702158
31	NC_018686	AG	3	6	18996	19001	50 %	0 %	50 %	0 %	407702158
32	NC_018686	AT	3	6	19287	19292	50 %	50 %	0 %	0 %	407702159
33	NC_018686	GT	3	6	19734	19739	0 %	50 %	50 %	0 %	407702160
34	NC_018686	AT	3	6	20553	20558	50 %	50 %	0 %	0 %	407702161
35	NC_018686	AT	3	6	21722	21727	50 %	50 %	0 %	0 %	407702161
36	NC_018686	GA	3	6	21922	21927	50 %	0 %	50 %	0 %	407702161
37	NC_018686	AG	3	6	22389	22394	50 %	0 %	50 %	0 %	407702162
38	NC_018686	AT	3	6	22515	22520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018686	TG	3	6	22606	22611	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018686	CA	3	6	22776	22781	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018686	AT	3	6	22901	22906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018686	TA	3	6	24273	24278	50 %	50 %	0 %	0 %	407702163
43	NC_018686	TG	3	6	25495	25500	0 %	50 %	50 %	0 %	407702164
44	NC_018686	AT	3	6	27253	27258	50 %	50 %	0 %	0 %	407702168
45	NC_018686	GA	3	6	28322	28327	50 %	0 %	50 %	0 %	407702169
46	NC_018686	TA	3	6	28782	28787	50 %	50 %	0 %	0 %	407702170
47	NC_018686	GA	3	6	28990	28995	50 %	0 %	50 %	0 %	407702171
48	NC_018686	AT	3	6	30105	30110	50 %	50 %	0 %	0 %	407702172
49	NC_018686	CT	3	6	30370	30375	0 %	50 %	0 %	50 %	407702172
50	NC_018686	GC	3	6	30967	30972	0 %	0 %	50 %	50 %	407702172
51	NC_018686	AT	3	6	31563	31568	50 %	50 %	0 %	0 %	407702173
52	NC_018686	TA	3	6	32790	32795	50 %	50 %	0 %	0 %	407702174
53	NC_018686	AG	3	6	33222	33227	50 %	0 %	50 %	0 %	407702175
54	NC_018686	TA	3	6	34113	34118	50 %	50 %	0 %	0 %	407702177
55	NC_018686	GA	3	6	34611	34616	50 %	0 %	50 %	0 %	407702178
56	NC_018686	TG	3	6	35115	35120	0 %	50 %	50 %	0 %	407702178
57	NC_018686	AG	4	8	35284	35291	50 %	0 %	50 %	0 %	407702178
58	NC_018686	GA	3	6	35467	35472	50 %	0 %	50 %	0 %	407702178
59	NC_018686	GA	3	6	35528	35533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018686	TA	3	6	36787	36792	50 %	50 %	0 %	0 %	407702180
61	NC_018686	AG	3	6	36883	36888	50 %	0 %	50 %	0 %	407702180
62	NC_018686	AG	4	8	38759	38766	50 %	0 %	50 %	0 %	407702182
63	NC_018686	TG	3	6	38794	38799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018686	AT	3	6	39065	39070	50 %	50 %	0 %	0 %	407702183
65	NC_018686	TA	3	6	39424	39429	50 %	50 %	0 %	0 %	407702183
66	NC_018686	AT	3	6	39575	39580	50 %	50 %	0 %	0 %	407702183
67	NC_018686	GA	3	6	39597	39602	50 %	0 %	50 %	0 %	407702183
68	NC_018686	TA	3	6	39643	39648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018686	TA	3	6	39901	39906	50 %	50 %	0 %	0 %	407702184
70	NC_018686	AT	3	6	39924	39929	50 %	50 %	0 %	0 %	407702184
71	NC_018686	TA	3	6	40162	40167	50 %	50 %	0 %	0 %	407702184
72	NC_018686	AG	3	6	40273	40278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018686	AG	4	8	40364	40371	50 %	0 %	50 %	0 %	407702185
74	NC_018686	TA	3	6	40835	40840	50 %	50 %	0 %	0 %	407702185
75	NC_018686	AG	3	6	41019	41024	50 %	0 %	50 %	0 %	407702185
76	NC_018686	CT	3	6	41151	41156	0 %	50 %	0 %	50 %	407702185
77	NC_018686	AG	3	6	41283	41288	50 %	0 %	50 %	0 %	407702185
78	NC_018686	TA	4	8	41483	41490	50 %	50 %	0 %	0 %	407702185
79	NC_018686	TA	3	6	41902	41907	50 %	50 %	0 %	0 %	407702185
80	NC_018686	TA	3	6	42811	42816	50 %	50 %	0 %	0 %	407702186
81	NC_018686	TA	3	6	42828	42833	50 %	50 %	0 %	0 %	407702186
82	NC_018686	AT	3	6	43062	43067	50 %	50 %	0 %	0 %	407702187
83	NC_018686	AT	3	6	43844	43849	50 %	50 %	0 %	0 %	407702188
84	NC_018686	CA	3	6	44148	44153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018686	TA	3	6	44355	44360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018686	GA	3	6	44582	44587	50 %	0 %	50 %	0 %	407702189
87	NC_018686	TA	3	6	45027	45032	50 %	50 %	0 %	0 %	407702189
88	NC_018686	TA	3	6	45448	45453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018686	TA	3	6	46081	46086	50 %	50 %	0 %	0 %	407702190
90	NC_018686	TA	3	6	46790	46795	50 %	50 %	0 %	0 %	407702191
91	NC_018686	AT	4	8	47548	47555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018686	TA	3	6	47627	47632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018686	AT	3	6	47947	47952	50 %	50 %	0 %	0 %	407702193
94	NC_018686	AT	3	6	48140	48145	50 %	50 %	0 %	0 %	407702193
95	NC_018686	TA	3	6	48177	48182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018686	TA	3	6	48474	48479	50 %	50 %	0 %	0 %	407702194
97	NC_018686	TA	3	6	49008	49013	50 %	50 %	0 %	0 %	407702196
98	NC_018686	TC	3	6	49544	49549	0 %	50 %	0 %	50 %	407702196
99	NC_018686	AT	4	8	49743	49750	50 %	50 %	0 %	0 %	407702196
100	NC_018686	AT	4	8	49898	49905	50 %	50 %	0 %	0 %	407702196
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102	NC_018686	GA	3	6	50911	50916	50 %	0 %	50 %	0 %	407702198
103	NC_018686	AC	3	6	51358	51363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_018686	GT	3	6	51420	51425	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018686	GT	3	6	51635	51640	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018686	AG	3	6	51728	51733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018686	TA	3	6	52148	52153	50 %	50 %	0 %	0 %	407702199
108	NC_018686	TC	3	6	52786	52791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018686	AG	3	6	53482	53487	50 %	0 %	50 %	0 %	407702200
110	NC_018686	TG	3	6	53663	53668	0 %	50 %	50 %	0 %	407702200
111	NC_018686	GA	3	6	53896	53901	50 %	0 %	50 %	0 %	407702200
112	NC_018686	TA	3	6	53914	53919	50 %	50 %	0 %	0 %	407702200
113	NC_018686	AT	3	6	53922	53927	50 %	50 %	0 %	0 %	407702200
114	NC_018686	AT	3	6	54454	54459	50 %	50 %	0 %	0 %	407702201
115	NC_018686	TC	4	8	54666	54673	0 %	50 %	0 %	50 %	407702201
116	NC_018686	TA	3	6	54691	54696	50 %	50 %	0 %	0 %	407702201
117	NC_018686	AT	4	8	54730	54737	50 %	50 %	0 %	0 %	407702201
118	NC_018686	TA	3	6	54779	54784	50 %	50 %	0 %	0 %	407702201
119	NC_018686	TA	3	6	54856	54861	50 %	50 %	0 %	0 %	407702201
120	NC_018686	AT	3	6	55184	55189	50 %	50 %	0 %	0 %	407702201
121	NC_018686	AG	3	6	57014	57019	50 %	0 %	50 %	0 %	407702204
122	NC_018686	AT	3	6	58078	58083	50 %	50 %	0 %	0 %	407702205
123	NC_018686	TG	3	6	58399	58404	0 %	50 %	50 %	0 %	407702205
124	NC_018686	TA	3	6	59117	59122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018686	TA	3	6	59183	59188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018686	GT	3	6	59193	59198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018686	TA	3	6	59291	59296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018686	AT	3	6	59534	59539	50 %	50 %	0 %	0 %	407702207
129	NC_018686	TA	3	6	60252	60257	50 %	50 %	0 %	0 %	407702208
130	NC_018686	AG	3	6	60776	60781	50 %	0 %	50 %	0 %	407702208
131	NC_018686	AT	3	6	61032	61037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018686	AT	3	6	61239	61244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018686	TA	3	6	61561	61566	50 %	50 %	0 %	0 %	407702209
134	NC_018686	AG	3	6	63235	63240	50 %	0 %	50 %	0 %	407702210
135	NC_018686	TG	4	8	63677	63684	0 %	50 %	50 %	0 %	407702210
136	NC_018686	GA	3	6	63920	63925	50 %	0 %	50 %	0 %	407702210
137	NC_018686	TA	3	6	64081	64086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018686	TG	3	6	64797	64802	0 %	50 %	50 %	0 %	407702213
139	NC_018686	AT	3	6	65039	65044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018686	AT	3	6	65136	65141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018686	TA	3	6	65362	65367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018686	AG	3	6	65391	65396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018686	GA	3	6	65416	65421	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018686	AT	3	6	65814	65819	50 %	50 %	0 %	0 %	407702214
145	NC_018686	CT	3	6	66054	66059	0 %	50 %	0 %	50 %	407702214
146	NC_018686	AT	3	6	67127	67132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.