MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183

Total Repeats: 305

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018686	TA	3	6	2977	2982	50 %	50 %	0 %	0 %	407702142
2	NC_018686	AT	3	6	4121	4126	50 %	50 %	0 %	0 %	407702142
3	NC_018686	AG	3	6	5057	5062	50 %	0 %	50 %	0 %	407702145
4	NC_018686	AT	3	6	5701	5706	50 %	50 %	0 %	0 %	407702146
5	NC_018686	TA	3	6	5790	5795	50 %	50 %	0 %	0 %	407702146
6	NC_018686	AT	3	6	6101	6106	50 %	50 %	0 %	0 %	407702146
7	NC_018686	TA	3	6	6933	6938	50 %	50 %	0 %	0 %	407702147
8	NC_018686	TA	3	6	8122	8127	50 %	50 %	0 %	0 %	407702148
9	NC_018686	GA	3	6	8523	8528	50 %	0 %	50 %	0 %	407702149
10	NC_018686	AG	3	6	8746	8751	50 %	0 %	50 %	0 %	407702149
11	NC_018686	TC	3	6	8887	8892	0 %	50 %	0 %	50 %	407702150
12	NC_018686	AG	3	6	9579	9584	50 %	0 %	50 %	0 %	407702153
13	NC_018686	AT	3	6	9706	9711	50 %	50 %	0 %	0 %	407702153
14	NC_018686	TA	3	6	9889	9894	50 %	50 %	0 %	0 %	407702153
15	NC_018686	GA	3	6	10594	10599	50 %	0 %	50 %	0 %	407702153
16	NC_018686	TA	3	6	11382	11387	50 %	50 %	0 %	0 %	407702153
17	NC_018686	TC	3	6	12359	12364	0 %	50 %	0 %	50 %	407702154
18	NC_018686	TG	3	6	12457	12462	0 %	50 %	50 %	0 %	407702154
19	NC_018686	TC	3	6	13613	13618	0 %	50 %	0 %	50 %	407702154
20	NC_018686	AT	3	6	13890	13895	50 %	50 %	0 %	0 %	407702154
21	NC_018686	TA	3	6	15392	15397	50 %	50 %	0 %	0 %	407702155
22	NC_018686	GA	3	6	16643	16648	50 %	0 %	50 %	0 %	407702155
23	NC_018686	TC	3	6	18015	18020	0 %	50 %	0 %	50 %	407702156
24	NC_018686	AG	3	6	18054	18059	50 %	0 %	50 %	0 %	407702156
25	NC_018686	TA	3	6	18337	18342	50 %	50 %	0 %	0 %	407702158
26	NC_018686	GA	3	6	18377	18382	50 %	0 %	50 %	0 %	407702158
27	NC_018686	AT	3	6	18471	18476	50 %	50 %	0 %	0 %	407702158
28	NC_018686	AG	3	6	18996	19001	50 %	0 %	50 %	0 %	407702158
29	NC_018686	AT	3	6	19287	19292	50 %	50 %	0 %	0 %	407702159
30	NC_018686	GT	3	6	19734	19739	0 %	50 %	50 %	0 %	407702160
31	NC_018686	AT	3	6	20553	20558	50 %	50 %	0 %	0 %	407702161
32	NC_018686	AT	3	6	21722	21727	50 %	50 %	0 %	0 %	407702161
33	NC_018686	GA	3	6	21922	21927	50 %	0 %	50 %	0 %	407702161
34	NC_018686	AG	3	6	22389	22394	50 %	0 %	50 %	0 %	407702162
35	NC_018686	TA	3	6	24273	24278	50 %	50 %	0 %	0 %	407702163
36	NC_018686	TG	3	6	25495	25500	0 %	50 %	50 %	0 %	407702164
37	NC_018686	AT	3	6	27253	27258	50 %	50 %	0 %	0 %	407702168
38	NC_018686	GA	3	6	28322	28327	50 %	0 %	50 %	0 %	407702169
39	NC_018686	TA	3	6	28782	28787	50 %	50 %	0 %	0 %	407702170
40	NC_018686	GA	3	6	28990	28995	50 %	0 %	50 %	0 %	407702171
41	NC_018686	AT	3	6	30105	30110	50 %	50 %	0 %	0 %	407702172
42	NC_018686	CT	3	6	30370	30375	0 %	50 %	0 %	50 %	407702172
43	NC_018686	GC	3	6	30967	30972	0 %	0 %	50 %	50 %	407702172
44	NC_018686	AT	3	6	31563	31568	50 %	50 %	0 %	0 %	407702173
45	NC_018686	TA	3	6	32790	32795	50 %	50 %	0 %	0 %	407702174
46	NC_018686	AG	3	6	33222	33227	50 %	0 %	50 %	0 %	407702175
47	NC_018686	TA	3	6	34113	34118	50 %	50 %	0 %	0 %	407702177
48	NC_018686	GA	3	6	34611	34616	50 %	0 %	50 %	0 %	407702178
49	NC_018686	TG	3	6	35115	35120	0 %	50 %	50 %	0 %	407702178
50	NC_018686	AG	4	8	35284	35291	50 %	0 %	50 %	0 %	407702178
51	NC_018686	GA	3	6	35467	35472	50 %	0 %	50 %	0 %	407702178
52	NC_018686	TA	3	6	36787	36792	50 %	50 %	0 %	0 %	407702180
53	NC_018686	AG	3	6	36883	36888	50 %	0 %	50 %	0 %	407702180
54	NC_018686	AG	4	8	38759	38766	50 %	0 %	50 %	0 %	407702182
55	NC_018686	AT	3	6	39065	39070	50 %	50 %	0 %	0 %	407702183
56	NC_018686	TA	3	6	39424	39429	50 %	50 %	0 %	0 %	407702183
57	NC_018686	AT	3	6	39575	39580	50 %	50 %	0 %	0 %	407702183
58	NC_018686	GA	3	6	39597	39602	50 %	0 %	50 %	0 %	407702183
59	NC_018686	TA	3	6	39901	39906	50 %	50 %	0 %	0 %	407702184
60	NC_018686	AT	3	6	39924	39929	50 %	50 %	0 %	0 %	407702184
61	NC_018686	TA	3	6	40162	40167	50 %	50 %	0 %	0 %	407702184
62	NC_018686	AG	4	8	40364	40371	50 %	0 %	50 %	0 %	407702185
63	NC_018686	TA	3	6	40835	40840	50 %	50 %	0 %	0 %	407702185
64	NC_018686	AG	3	6	41019	41024	50 %	0 %	50 %	0 %	407702185
65	NC_018686	CT	3	6	41151	41156	0 %	50 %	0 %	50 %	407702185
66	NC_018686	AG	3	6	41283	41288	50 %	0 %	50 %	0 %	407702185
67	NC_018686	TA	4	8	41483	41490	50 %	50 %	0 %	0 %	407702185
68	NC_018686	TA	3	6	41902	41907	50 %	50 %	0 %	0 %	407702185
69	NC_018686	TA	3	6	42811	42816	50 %	50 %	0 %	0 %	407702186
70	NC_018686	TA	3	6	42828	42833	50 %	50 %	0 %	0 %	407702186
71	NC_018686	AT	3	6	43062	43067	50 %	50 %	0 %	0 %	407702187
72	NC_018686	AT	3	6	43844	43849	50 %	50 %	0 %	0 %	407702188
73	NC_018686	GA	3	6	44582	44587	50 %	0 %	50 %	0 %	407702189
74	NC_018686	TA	3	6	45027	45032	50 %	50 %	0 %	0 %	407702189
75	NC_018686	TA	3	6	46081	46086	50 %	50 %	0 %	0 %	407702190
76	NC_018686	TA	3	6	46790	46795	50 %	50 %	0 %	0 %	407702191
77	NC_018686	AT	3	6	47947	47952	50 %	50 %	0 %	0 %	407702193
78	NC_018686	AT	3	6	48140	48145	50 %	50 %	0 %	0 %	407702193
79	NC_018686	TA	3	6	48474	48479	50 %	50 %	0 %	0 %	407702194
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82	NC_018686	AT	4	8	49743	49750	50 %	50 %	0 %	0 %	407702196
83	NC_018686	AT	4	8	49898	49905	50 %	50 %	0 %	0 %	407702196
84	NC_018686	TA	3	6	50530	50535	50 %	50 %	0 %	0 %	407702197
85	NC_018686	GA	3	6	50911	50916	50 %	0 %	50 %	0 %	407702198
86	NC_018686	TA	3	6	52148	52153	50 %	50 %	0 %	0 %	407702199
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90	NC_018686	TA	3	6	53914	53919	50 %	50 %	0 %	0 %	407702200
91	NC_018686	AT	3	6	53922	53927	50 %	50 %	0 %	0 %	407702200
92	NC_018686	AT	3	6	54454	54459	50 %	50 %	0 %	0 %	407702201
93	NC_018686	TC	4	8	54666	54673	0 %	50 %	0 %	50 %	407702201
94	NC_018686	TA	3	6	54691	54696	50 %	50 %	0 %	0 %	407702201
95	NC_018686	AT	4	8	54730	54737	50 %	50 %	0 %	0 %	407702201
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102	NC_018686	AT	3	6	59534	59539	50 %	50 %	0 %	0 %	407702207
103	NC_018686	TA	3	6	60252	60257	50 %	50 %	0 %	0 %	407702208
104	NC_018686	AG	3	6	60776	60781	50 %	0 %	50 %	0 %	407702208
105	NC_018686	TA	3	6	61561	61566	50 %	50 %	0 %	0 %	407702209
106	NC_018686	AG	3	6	63235	63240	50 %	0 %	50 %	0 %	407702210
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108	NC_018686	GA	3	6	63920	63925	50 %	0 %	50 %	0 %	407702210
109	NC_018686	TG	3	6	64797	64802	0 %	50 %	50 %	0 %	407702213
110	NC_018686	AT	3	6	65814	65819	50 %	50 %	0 %	0 %	407702214
111	NC_018686	CT	3	6	66054	66059	0 %	50 %	0 %	50 %	407702214
112	NC_018686	TA	3	6	68127	68132	50 %	50 %	0 %	0 %	407702216
113	NC_018686	TC	3	6	68400	68405	0 %	50 %	0 %	50 %	407702216
114	NC_018686	AG	3	6	68602	68607	50 %	0 %	50 %	0 %	407702216
115	NC_018686	CA	3	6	68831	68836	50 %	0 %	0 %	50 %	407702216
116	NC_018686	TA	3	6	68897	68902	50 %	50 %	0 %	0 %	407702216
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118	NC_018686	AT	3	6	69809	69814	50 %	50 %	0 %	0 %	407702217
119	NC_018686	TA	3	6	70796	70801	50 %	50 %	0 %	0 %	407702218
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121	NC_018686	AT	3	6	71503	71508	50 %	50 %	0 %	0 %	407702218
122	NC_018686	TG	3	6	71511	71516	0 %	50 %	50 %	0 %	407702218
123	NC_018686	TG	3	6	71753	71758	0 %	50 %	50 %	0 %	407702218
124	NC_018686	AT	3	6	72999	73004	50 %	50 %	0 %	0 %	407702220
125	NC_018686	AT	3	6	74135	74140	50 %	50 %	0 %	0 %	407702221
126	NC_018686	TA	3	6	74215	74220	50 %	50 %	0 %	0 %	407702221
127	NC_018686	TA	3	6	76664	76669	50 %	50 %	0 %	0 %	407702227
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136	NC_018686	TA	3	6	82141	82146	50 %	50 %	0 %	0 %	407702239
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139	NC_018686	AG	4	8	86232	86239	50 %	0 %	50 %	0 %	407702244
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141	NC_018686	AT	3	6	87291	87296	50 %	50 %	0 %	0 %	407702247
142	NC_018686	AT	3	6	87379	87384	50 %	50 %	0 %	0 %	407702247
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.