MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC95

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018685	TGAAAT	2	12	85	96	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407702036
2	NC_018685	CGTATA	2	12	1787	1798	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407702036
3	NC_018685	TTTGAT	2	12	4447	4458	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407702037
4	NC_018685	ATTAAT	2	12	6747	6758	50 %	50 %	0 %	0 %	407702041
5	NC_018685	TTTATT	2	12	11777	11788	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407702046
6	NC_018685	AAAAGA	2	12	11997	12008	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407702046
7	NC_018685	CTACAT	2	12	12264	12275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702047
8	NC_018685	ATACCA	2	12	14653	14664	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407702051
9	NC_018685	GGAATG	2	12	16373	16384	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018685	TTATGC	2	12	16538	16549	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018685	ATTTCA	2	12	20604	20615	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407702058
12	NC_018685	TTTATA	2	12	21423	21434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018685	ACAACC	2	12	23869	23880	50 %	0 %	0 %	50 %	407702060
14	NC_018685	AGGAAA	2	12	24460	24471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702062
15	NC_018685	TGGGGT	2	12	28684	28695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407702066
16	NC_018685	ATGGAA	2	12	28739	28750	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407702066
17	NC_018685	TAGAAG	2	12	32313	32324	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407702072
18	NC_018685	TTATGG	2	12	39371	39382	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407702077
19	NC_018685	CTTTAT	2	12	44305	44316	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407702084
20	NC_018685	AAAATT	2	12	45204	45215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018685	TGAAAA	2	12	48301	48312	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407702088
22	NC_018685	GTTATA	2	12	55389	55400	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702099
23	NC_018685	GTTATA	2	12	55539	55550	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407702099
24	NC_018685	ATTTCT	2	12	56137	56148	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407702100
25	NC_018685	TAAAGA	2	12	60822	60833	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407702102
26	NC_018685	TGTGAT	2	12	65882	65893	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018685	GATATA	2	12	66353	66364	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018685	TCTGGA	2	12	70115	70126	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407702108
29	NC_018685	TTTAAC	2	12	70148	70159	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407702108
30	NC_018685	CCCAAT	2	12	71038	71049	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018685	ACATCA	2	12	71080	71091	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018685	TTTGAT	2	12	72143	72154	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407702110
33	NC_018685	TATGAA	2	12	76304	76315	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407702114
34	NC_018685	TCTTTT	2	12	77565	77576	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407702115
35	NC_018685	CGTATT	2	12	78649	78660	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407702117
36	NC_018685	TTCATA	2	12	78785	78796	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407702117
37	NC_018685	ATTTTT	2	12	82190	82201	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407702119
38	NC_018685	TAAAAT	2	12	83501	83512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702120
39	NC_018685	TTACTT	2	12	86479	86490	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407702122
40	NC_018685	ACCTGC	2	12	86511	86522	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	407702122
41	NC_018685	TTTTCA	2	12	86584	86595	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407702122
42	NC_018685	TTATAG	2	12	87631	87642	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018685	AAGGGC	2	12	90084	90095	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	407702128
44	NC_018685	GAAAAT	2	12	91854	91865	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407702132
45	NC_018685	CAAATT	2	12	92624	92635	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018685	TTTGAT	2	12	94137	94148	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407702135
47	NC_018685	TGAAAT	2	12	95061	95072	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407702136

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.