MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC95

Total Repeats: 220

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018685	TCAA	2	8	124	131	50 %	25 %	0 %	25 %	407702036
2	NC_018685	GCTA	2	8	202	209	25 %	25 %	25 %	25 %	407702036
3	NC_018685	TGAT	2	8	780	787	25 %	50 %	25 %	0 %	407702036
4	NC_018685	CAGA	2	8	1377	1384	50 %	0 %	25 %	25 %	407702036
5	NC_018685	ATGG	2	8	1572	1579	25 %	25 %	50 %	0 %	407702036
6	NC_018685	AAAG	2	8	2095	2102	75 %	0 %	25 %	0 %	407702036
7	NC_018685	GGAT	2	8	2656	2663	25 %	25 %	50 %	0 %	407702036
8	NC_018685	ATAA	2	8	2795	2802	75 %	25 %	0 %	0 %	407702036
9	NC_018685	CAAA	2	8	2966	2973	75 %	0 %	0 %	25 %	407702036
10	NC_018685	TTTA	2	8	3010	3017	25 %	75 %	0 %	0 %	407702036
11	NC_018685	AAGG	2	8	3386	3393	50 %	0 %	50 %	0 %	407702036
12	NC_018685	ATGA	2	8	3524	3531	50 %	25 %	25 %	0 %	407702036
13	NC_018685	AATA	2	8	3693	3700	75 %	25 %	0 %	0 %	407702036
14	NC_018685	AATC	2	8	4413	4420	50 %	25 %	0 %	25 %	407702037
15	NC_018685	CAAA	2	8	6436	6443	75 %	0 %	0 %	25 %	407702040
16	NC_018685	AAAG	2	8	6678	6685	75 %	0 %	25 %	0 %	407702041
17	NC_018685	ACAA	2	8	7272	7279	75 %	0 %	0 %	25 %	407702042
18	NC_018685	GGCG	2	8	7590	7597	0 %	0 %	75 %	25 %	407702043
19	NC_018685	AGAA	2	8	7642	7649	75 %	0 %	25 %	0 %	407702043
20	NC_018685	AAAT	2	8	8148	8155	75 %	25 %	0 %	0 %	407702043
21	NC_018685	CAAG	2	8	8490	8497	50 %	0 %	25 %	25 %	407702043
22	NC_018685	TGAT	2	8	9018	9025	25 %	50 %	25 %	0 %	407702043
23	NC_018685	TTAT	2	8	9659	9666	25 %	75 %	0 %	0 %	407702043
24	NC_018685	TGGG	2	8	10589	10596	0 %	25 %	75 %	0 %	407702045
25	NC_018685	TTTA	2	8	10669	10676	25 %	75 %	0 %	0 %	407702045
26	NC_018685	AGTT	2	8	10786	10793	25 %	50 %	25 %	0 %	407702045
27	NC_018685	TCAT	2	8	11084	11091	25 %	50 %	0 %	25 %	407702045
28	NC_018685	TATT	2	8	11328	11335	25 %	75 %	0 %	0 %	407702046
29	NC_018685	TATT	2	8	11473	11480	25 %	75 %	0 %	0 %	407702046
30	NC_018685	ATTC	2	8	11518	11525	25 %	50 %	0 %	25 %	407702046
31	NC_018685	GTTT	2	8	11660	11667	0 %	75 %	25 %	0 %	407702046
32	NC_018685	GAAG	2	8	11721	11728	50 %	0 %	50 %	0 %	407702046
33	NC_018685	CTTT	2	8	12032	12039	0 %	75 %	0 %	25 %	407702046
34	NC_018685	TTTG	2	8	12333	12340	0 %	75 %	25 %	0 %	407702047
35	NC_018685	TCTT	2	8	12371	12378	0 %	75 %	0 %	25 %	407702047
36	NC_018685	CTTT	2	8	12583	12590	0 %	75 %	0 %	25 %	407702048
37	NC_018685	ATAC	2	8	12620	12627	50 %	25 %	0 %	25 %	407702048
38	NC_018685	TTTC	2	8	12833	12840	0 %	75 %	0 %	25 %	407702048
39	NC_018685	AGGT	2	8	13394	13401	25 %	25 %	50 %	0 %	407702048
40	NC_018685	TGTT	2	8	13466	13473	0 %	75 %	25 %	0 %	407702048
41	NC_018685	AATA	2	8	13493	13500	75 %	25 %	0 %	0 %	407702048
42	NC_018685	CGAG	2	8	14610	14617	25 %	0 %	50 %	25 %	407702051
43	NC_018685	CTTT	2	8	14868	14875	0 %	75 %	0 %	25 %	407702051
44	NC_018685	TACT	2	8	17657	17664	25 %	50 %	0 %	25 %	407702054
45	NC_018685	GAAA	2	8	19177	19184	75 %	0 %	25 %	0 %	407702055
46	NC_018685	TACT	2	8	19438	19445	25 %	50 %	0 %	25 %	407702055
47	NC_018685	AAAT	2	8	19764	19771	75 %	25 %	0 %	0 %	407702055
48	NC_018685	AAAG	2	8	19896	19903	75 %	0 %	25 %	0 %	407702055
49	NC_018685	AATT	2	8	20474	20481	50 %	50 %	0 %	0 %	407702057
50	NC_018685	TCAA	2	8	20694	20701	50 %	25 %	0 %	25 %	407702058
51	NC_018685	AATC	2	8	21598	21605	50 %	25 %	0 %	25 %	407702060
52	NC_018685	AATG	2	8	21784	21791	50 %	25 %	25 %	0 %	407702060
53	NC_018685	CAAA	2	8	22064	22071	75 %	0 %	0 %	25 %	407702060
54	NC_018685	GAAA	2	8	22150	22157	75 %	0 %	25 %	0 %	407702060
55	NC_018685	CAAA	2	8	22823	22830	75 %	0 %	0 %	25 %	407702060
56	NC_018685	AGAC	2	8	23001	23008	50 %	0 %	25 %	25 %	407702060
57	NC_018685	AAAC	2	8	23277	23284	75 %	0 %	0 %	25 %	407702060
58	NC_018685	AAAC	2	8	23553	23560	75 %	0 %	0 %	25 %	407702060
59	NC_018685	TTCT	2	8	24214	24221	0 %	75 %	0 %	25 %	407702061
60	NC_018685	TAAA	2	8	26182	26189	75 %	25 %	0 %	0 %	407702065
61	NC_018685	TGGA	2	8	27228	27235	25 %	25 %	50 %	0 %	407702065
62	NC_018685	GGGA	2	8	27515	27522	25 %	0 %	75 %	0 %	407702065
63	NC_018685	TGTA	2	8	27530	27537	25 %	50 %	25 %	0 %	407702065
64	NC_018685	TACC	2	8	27708	27715	25 %	25 %	0 %	50 %	407702065
65	NC_018685	AATG	2	8	27765	27772	50 %	25 %	25 %	0 %	407702065
66	NC_018685	AAGC	2	8	28035	28042	50 %	0 %	25 %	25 %	407702065
67	NC_018685	AAAG	2	8	28061	28068	75 %	0 %	25 %	0 %	407702065
68	NC_018685	AACA	2	8	28111	28118	75 %	0 %	0 %	25 %	407702065
69	NC_018685	AATC	2	8	28120	28127	50 %	25 %	0 %	25 %	407702065
70	NC_018685	AAGC	2	8	28503	28510	50 %	0 %	25 %	25 %	407702066
71	NC_018685	GACG	2	8	29523	29530	25 %	0 %	50 %	25 %	407702068
72	NC_018685	ACGA	2	8	29971	29978	50 %	0 %	25 %	25 %	407702069
73	NC_018685	TCAG	2	8	30573	30580	25 %	25 %	25 %	25 %	407702069
74	NC_018685	TGAA	2	8	30626	30633	50 %	25 %	25 %	0 %	407702069
75	NC_018685	AGAA	2	8	30657	30664	75 %	0 %	25 %	0 %	407702069
76	NC_018685	TGAT	2	8	30893	30900	25 %	50 %	25 %	0 %	407702069
77	NC_018685	ACAA	2	8	30981	30988	75 %	0 %	0 %	25 %	407702069
78	NC_018685	CTTC	2	8	31446	31453	0 %	50 %	0 %	50 %	407702071
79	NC_018685	GATC	2	8	31482	31489	25 %	25 %	25 %	25 %	407702071
80	NC_018685	ACGG	2	8	31853	31860	25 %	0 %	50 %	25 %	407702072
81	NC_018685	ACTT	2	8	31980	31987	25 %	50 %	0 %	25 %	407702072
82	NC_018685	CTTT	2	8	32071	32078	0 %	75 %	0 %	25 %	407702072
83	NC_018685	AGAA	2	8	32172	32179	75 %	0 %	25 %	0 %	407702072
84	NC_018685	TGAT	2	8	32550	32557	25 %	50 %	25 %	0 %	407702072
85	NC_018685	CATT	2	8	32702	32709	25 %	50 %	0 %	25 %	407702072
86	NC_018685	TTGT	2	8	33098	33105	0 %	75 %	25 %	0 %	407702072
87	NC_018685	AGAA	2	8	34534	34541	75 %	0 %	25 %	0 %	407702073
88	NC_018685	GAAA	2	8	34688	34695	75 %	0 %	25 %	0 %	407702073
89	NC_018685	ATTT	2	8	35709	35716	25 %	75 %	0 %	0 %	407702074
90	NC_018685	GTAT	2	8	36157	36164	25 %	50 %	25 %	0 %	407702074
91	NC_018685	GCAA	2	8	36451	36458	50 %	0 %	25 %	25 %	407702074
92	NC_018685	AAAG	2	8	36514	36521	75 %	0 %	25 %	0 %	407702074
93	NC_018685	AGGA	2	8	36579	36586	50 %	0 %	50 %	0 %	407702074
94	NC_018685	AGTG	2	8	37381	37388	25 %	25 %	50 %	0 %	407702074
95	NC_018685	CGAT	2	8	37560	37567	25 %	25 %	25 %	25 %	407702074
96	NC_018685	TTCA	2	8	37835	37842	25 %	50 %	0 %	25 %	407702075
97	NC_018685	CCGA	2	8	37853	37860	25 %	0 %	25 %	50 %	407702075
98	NC_018685	GGAT	2	8	37868	37875	25 %	25 %	50 %	0 %	407702075
99	NC_018685	TTTA	2	8	38323	38330	25 %	75 %	0 %	0 %	407702076
100	NC_018685	ACTT	2	8	38833	38840	25 %	50 %	0 %	25 %	407702076
101	NC_018685	GGTA	2	8	39358	39365	25 %	25 %	50 %	0 %	407702077
102	NC_018685	TTTA	2	8	40311	40318	25 %	75 %	0 %	0 %	407702079
103	NC_018685	GTAT	2	8	40517	40524	25 %	50 %	25 %	0 %	407702079
104	NC_018685	TATG	2	8	41755	41762	25 %	50 %	25 %	0 %	407702082
105	NC_018685	TGCG	2	8	41805	41812	0 %	25 %	50 %	25 %	407702082
106	NC_018685	GAAA	2	8	41834	41841	75 %	0 %	25 %	0 %	407702082
107	NC_018685	CCAA	2	8	41877	41884	50 %	0 %	0 %	50 %	407702082
108	NC_018685	GTTG	2	8	42417	42424	0 %	50 %	50 %	0 %	407702082
109	NC_018685	GATG	2	8	42583	42590	25 %	25 %	50 %	0 %	407702082
110	NC_018685	GATA	2	8	43709	43716	50 %	25 %	25 %	0 %	407702084
111	NC_018685	TAGA	2	8	43904	43911	50 %	25 %	25 %	0 %	407702084
112	NC_018685	ATAA	2	8	44034	44041	75 %	25 %	0 %	0 %	407702084
113	NC_018685	CGAA	2	8	44162	44169	50 %	0 %	25 %	25 %	407702084
114	NC_018685	ATTT	2	8	44365	44372	25 %	75 %	0 %	0 %	407702084
115	NC_018685	AATT	2	8	44435	44442	50 %	50 %	0 %	0 %	407702084
116	NC_018685	GTAA	2	8	44832	44839	50 %	25 %	25 %	0 %	407702084
117	NC_018685	GATT	2	8	45332	45339	25 %	50 %	25 %	0 %	407702085
118	NC_018685	AAAG	2	8	45407	45414	75 %	0 %	25 %	0 %	407702085
119	NC_018685	TGAA	2	8	46890	46897	50 %	25 %	25 %	0 %	407702086
120	NC_018685	TGTT	2	8	47442	47449	0 %	75 %	25 %	0 %	407702086
121	NC_018685	TTTG	2	8	48148	48155	0 %	75 %	25 %	0 %	407702088
122	NC_018685	AGGA	2	8	49291	49298	50 %	0 %	50 %	0 %	407702090
123	NC_018685	AGAA	2	8	50477	50484	75 %	0 %	25 %	0 %	407702093
124	NC_018685	GCAT	2	8	51788	51795	25 %	25 %	25 %	25 %	407702094
125	NC_018685	TTTG	2	8	52510	52517	0 %	75 %	25 %	0 %	407702096
126	NC_018685	CTGA	2	8	52819	52826	25 %	25 %	25 %	25 %	407702097
127	NC_018685	GTTT	2	8	52886	52893	0 %	75 %	25 %	0 %	407702097
128	NC_018685	TTCT	2	8	54423	54430	0 %	75 %	0 %	25 %	407702098
129	NC_018685	AAAG	2	8	54443	54450	75 %	0 %	25 %	0 %	407702098
130	NC_018685	ATGA	2	8	54687	54694	50 %	25 %	25 %	0 %	407702098
131	NC_018685	TCAT	2	8	55756	55763	25 %	50 %	0 %	25 %	407702099
132	NC_018685	CATT	2	8	55834	55841	25 %	50 %	0 %	25 %	407702099
133	NC_018685	TTGG	2	8	56096	56103	0 %	50 %	50 %	0 %	407702100
134	NC_018685	TTAA	2	8	56480	56487	50 %	50 %	0 %	0 %	407702100
135	NC_018685	CATT	2	8	56565	56572	25 %	50 %	0 %	25 %	407702100
136	NC_018685	TGAT	2	8	56822	56829	25 %	50 %	25 %	0 %	407702100
137	NC_018685	AAAG	2	8	58293	58300	75 %	0 %	25 %	0 %	407702101
138	NC_018685	AAGC	2	8	59632	59639	50 %	0 %	25 %	25 %	407702102
139	NC_018685	ATTT	2	8	60005	60012	25 %	75 %	0 %	0 %	407702102
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.