MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC95

Total Repeats: 212

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018685	GA	3	6	57	62	50 %	0 %	50 %	0 %	407702036
2	NC_018685	AT	3	6	500	505	50 %	50 %	0 %	0 %	407702036
3	NC_018685	GA	3	6	700	705	50 %	0 %	50 %	0 %	407702036
4	NC_018685	GT	3	6	936	941	0 %	50 %	50 %	0 %	407702036
5	NC_018685	AG	3	6	971	976	50 %	0 %	50 %	0 %	407702036
6	NC_018685	TA	3	6	978	983	50 %	50 %	0 %	0 %	407702036
7	NC_018685	AC	3	6	1144	1149	50 %	0 %	0 %	50 %	407702036
8	NC_018685	AG	3	6	1594	1599	50 %	0 %	50 %	0 %	407702036
9	NC_018685	CA	3	6	1627	1632	50 %	0 %	0 %	50 %	407702036
10	NC_018685	AG	3	6	2132	2137	50 %	0 %	50 %	0 %	407702036
11	NC_018685	TG	3	6	2195	2200	0 %	50 %	50 %	0 %	407702036
12	NC_018685	TC	3	6	3057	3062	0 %	50 %	0 %	50 %	407702036
13	NC_018685	GT	3	6	3886	3891	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018685	AT	3	6	3912	3917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018685	AT	3	6	4030	4035	50 %	50 %	0 %	0 %	407702037
16	NC_018685	AT	3	6	4686	4691	50 %	50 %	0 %	0 %	407702037
17	NC_018685	CA	3	6	4711	4716	50 %	0 %	0 %	50 %	407702037
18	NC_018685	CT	3	6	5794	5799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018685	AT	3	6	7490	7495	50 %	50 %	0 %	0 %	407702043
20	NC_018685	AG	3	6	8357	8362	50 %	0 %	50 %	0 %	407702043
21	NC_018685	AG	3	6	9565	9570	50 %	0 %	50 %	0 %	407702043
22	NC_018685	AT	3	6	10218	10223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018685	TG	3	6	11541	11546	0 %	50 %	50 %	0 %	407702046
24	NC_018685	AG	3	6	11765	11770	50 %	0 %	50 %	0 %	407702046
25	NC_018685	TC	3	6	11962	11967	0 %	50 %	0 %	50 %	407702046
26	NC_018685	AT	3	6	13585	13590	50 %	50 %	0 %	0 %	407702048
27	NC_018685	TA	3	6	14228	14233	50 %	50 %	0 %	0 %	407702050
28	NC_018685	TA	3	6	14490	14495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018685	TA	3	6	15171	15176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018685	TA	3	6	16116	16121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018685	TA	3	6	16153	16158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018685	AT	3	6	16305	16310	50 %	50 %	0 %	0 %	407702053
33	NC_018685	GT	3	6	16323	16328	0 %	50 %	50 %	0 %	407702053
34	NC_018685	TA	3	6	16773	16778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018685	GT	3	6	17006	17011	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018685	CT	3	6	17595	17600	0 %	50 %	0 %	50 %	407702054
37	NC_018685	GT	3	6	17627	17632	0 %	50 %	50 %	0 %	407702054
38	NC_018685	TA	4	8	17800	17807	50 %	50 %	0 %	0 %	407702054
39	NC_018685	AT	3	6	17945	17950	50 %	50 %	0 %	0 %	407702054
40	NC_018685	CA	3	6	18525	18530	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018685	GT	3	6	19094	19099	0 %	50 %	50 %	0 %	407702055
42	NC_018685	TA	3	6	19544	19549	50 %	50 %	0 %	0 %	407702055
43	NC_018685	GA	3	6	19694	19699	50 %	0 %	50 %	0 %	407702055
44	NC_018685	AT	3	6	20219	20224	50 %	50 %	0 %	0 %	407702056
45	NC_018685	AT	3	6	20548	20553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018685	AT	3	6	20959	20964	50 %	50 %	0 %	0 %	407702058
47	NC_018685	AT	3	6	21765	21770	50 %	50 %	0 %	0 %	407702060
48	NC_018685	TA	3	6	22263	22268	50 %	50 %	0 %	0 %	407702060
49	NC_018685	AC	3	6	23419	23424	50 %	0 %	0 %	50 %	407702060
50	NC_018685	TG	3	6	24291	24296	0 %	50 %	50 %	0 %	407702062
51	NC_018685	GT	3	6	25549	25554	0 %	50 %	50 %	0 %	407702065
52	NC_018685	CA	3	6	27131	27136	50 %	0 %	0 %	50 %	407702065
53	NC_018685	AG	3	6	27486	27491	50 %	0 %	50 %	0 %	407702065
54	NC_018685	AC	3	6	28265	28270	50 %	0 %	0 %	50 %	407702066
55	NC_018685	TA	3	6	28344	28349	50 %	50 %	0 %	0 %	407702066
56	NC_018685	GC	3	6	28519	28524	0 %	0 %	50 %	50 %	407702066
57	NC_018685	AT	3	6	28983	28988	50 %	50 %	0 %	0 %	407702066
58	NC_018685	TA	3	6	29658	29663	50 %	50 %	0 %	0 %	407702068
59	NC_018685	CA	3	6	30231	30236	50 %	0 %	0 %	50 %	407702069
60	NC_018685	TA	3	6	30358	30363	50 %	50 %	0 %	0 %	407702069
61	NC_018685	CT	3	6	31520	31525	0 %	50 %	0 %	50 %	407702071
62	NC_018685	TG	5	10	31674	31683	0 %	50 %	50 %	0 %	407702071
63	NC_018685	AG	3	6	32231	32236	50 %	0 %	50 %	0 %	407702072
64	NC_018685	TG	3	6	32936	32941	0 %	50 %	50 %	0 %	407702072
65	NC_018685	TA	3	6	33585	33590	50 %	50 %	0 %	0 %	407702072
66	NC_018685	TA	3	6	34627	34632	50 %	50 %	0 %	0 %	407702073
67	NC_018685	TA	3	6	35211	35216	50 %	50 %	0 %	0 %	407702074
68	NC_018685	TG	3	6	35423	35428	0 %	50 %	50 %	0 %	407702074
69	NC_018685	TC	3	6	35848	35853	0 %	50 %	0 %	50 %	407702074
70	NC_018685	AT	3	6	36270	36275	50 %	50 %	0 %	0 %	407702074
71	NC_018685	TA	3	6	38688	38693	50 %	50 %	0 %	0 %	407702076
72	NC_018685	AC	3	6	39811	39816	50 %	0 %	0 %	50 %	407702077
73	NC_018685	AT	3	6	40714	40719	50 %	50 %	0 %	0 %	407702080
74	NC_018685	TA	3	6	40943	40948	50 %	50 %	0 %	0 %	407702080
75	NC_018685	AT	3	6	41480	41485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018685	AT	3	6	41490	41495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018685	AT	3	6	43157	43162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018685	TA	3	6	43182	43187	50 %	50 %	0 %	0 %	407702083
79	NC_018685	TA	3	6	43319	43324	50 %	50 %	0 %	0 %	407702083
80	NC_018685	GA	3	6	43378	43383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018685	CA	3	6	43814	43819	50 %	0 %	0 %	50 %	407702084
82	NC_018685	AT	3	6	43838	43843	50 %	50 %	0 %	0 %	407702084
83	NC_018685	TG	3	6	44496	44501	0 %	50 %	50 %	0 %	407702084
84	NC_018685	GT	3	6	44888	44893	0 %	50 %	50 %	0 %	407702084
85	NC_018685	AT	3	6	44959	44964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018685	AT	3	6	45717	45722	50 %	50 %	0 %	0 %	407702085
87	NC_018685	AT	3	6	45960	45965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018685	TC	3	6	46749	46754	0 %	50 %	0 %	50 %	407702086
89	NC_018685	AT	3	6	47623	47628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018685	AT	3	6	47651	47656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018685	GA	3	6	47978	47983	50 %	0 %	50 %	0 %	407702087
92	NC_018685	AT	3	6	48216	48221	50 %	50 %	0 %	0 %	407702088
93	NC_018685	CA	3	6	48328	48333	50 %	0 %	0 %	50 %	407702088
94	NC_018685	AT	3	6	48471	48476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018685	CT	3	6	48786	48791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_018685	GA	3	6	49179	49184	50 %	0 %	50 %	0 %	407702089
97	NC_018685	TA	3	6	49400	49405	50 %	50 %	0 %	0 %	407702090
98	NC_018685	TA	3	6	50300	50305	50 %	50 %	0 %	0 %	407702093
99	NC_018685	TA	3	6	50799	50804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018685	AT	3	6	50820	50825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018685	CT	3	6	50889	50894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_018685	AT	3	6	51143	51148	50 %	50 %	0 %	0 %	407702094
103	NC_018685	GA	3	6	51447	51452	50 %	0 %	50 %	0 %	407702094
104	NC_018685	TA	3	6	52047	52052	50 %	50 %	0 %	0 %	407702095
105	NC_018685	TA	3	6	52057	52062	50 %	50 %	0 %	0 %	407702095
106	NC_018685	TA	3	6	52357	52362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018685	CA	3	6	52752	52757	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_018685	CA	3	6	53712	53717	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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110	NC_018685	TA	3	6	55793	55798	50 %	50 %	0 %	0 %	407702099
111	NC_018685	TA	3	6	55860	55865	50 %	50 %	0 %	0 %	407702099
112	NC_018685	AT	4	8	55896	55903	50 %	50 %	0 %	0 %	407702099
113	NC_018685	TA	3	6	56161	56166	50 %	50 %	0 %	0 %	407702100
114	NC_018685	AT	3	6	56294	56299	50 %	50 %	0 %	0 %	407702100
115	NC_018685	TA	4	8	56316	56323	50 %	50 %	0 %	0 %	407702100
116	NC_018685	AT	3	6	57197	57202	50 %	50 %	0 %	0 %	407702100
117	NC_018685	AT	3	6	57252	57257	50 %	50 %	0 %	0 %	407702100
118	NC_018685	TA	3	6	58566	58571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018685	TG	3	6	59463	59468	0 %	50 %	50 %	0 %	407702102
120	NC_018685	AT	3	6	59807	59812	50 %	50 %	0 %	0 %	407702102
121	NC_018685	AG	3	6	59827	59832	50 %	0 %	50 %	0 %	407702102
122	NC_018685	GA	3	6	60110	60115	50 %	0 %	50 %	0 %	407702102
123	NC_018685	AT	3	6	60410	60415	50 %	50 %	0 %	0 %	407702102
124	NC_018685	TA	3	6	60727	60732	50 %	50 %	0 %	0 %	407702102
125	NC_018685	TA	3	6	62027	62032	50 %	50 %	0 %	0 %	407702102
126	NC_018685	AT	3	6	62349	62354	50 %	50 %	0 %	0 %	407702102
127	NC_018685	TA	3	6	62428	62433	50 %	50 %	0 %	0 %	407702102
128	NC_018685	CA	3	6	62877	62882	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_018685	TA	3	6	62901	62906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018685	AT	3	6	63357	63362	50 %	50 %	0 %	0 %	407702103
131	NC_018685	AT	3	6	63678	63683	50 %	50 %	0 %	0 %	407702103
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133	NC_018685	TC	3	6	64747	64752	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_018685	TA	4	8	64966	64973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018685	TA	3	6	65084	65089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018685	TA	3	6	65739	65744	50 %	50 %	0 %	0 %	407702104
137	NC_018685	TA	3	6	66058	66063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018685	TA	3	6	66173	66178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018685	TA	3	6	66527	66532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018685	TA	3	6	67195	67200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018685	TA	3	6	67850	67855	50 %	50 %	0 %	0 %	407702106
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144	NC_018685	AT	4	8	70396	70403	50 %	50 %	0 %	0 %	407702108
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146	NC_018685	GA	3	6	70808	70813	50 %	0 %	50 %	0 %	407702108
147	NC_018685	AT	3	6	71116	71121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.