MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC95

Total Repeats: 155

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018685	GA	3	6	57	62	50 %	0 %	50 %	0 %	407702036
2	NC_018685	AT	3	6	500	505	50 %	50 %	0 %	0 %	407702036
3	NC_018685	GA	3	6	700	705	50 %	0 %	50 %	0 %	407702036
4	NC_018685	GT	3	6	936	941	0 %	50 %	50 %	0 %	407702036
5	NC_018685	AG	3	6	971	976	50 %	0 %	50 %	0 %	407702036
6	NC_018685	TA	3	6	978	983	50 %	50 %	0 %	0 %	407702036
7	NC_018685	AC	3	6	1144	1149	50 %	0 %	0 %	50 %	407702036
8	NC_018685	AG	3	6	1594	1599	50 %	0 %	50 %	0 %	407702036
9	NC_018685	CA	3	6	1627	1632	50 %	0 %	0 %	50 %	407702036
10	NC_018685	AG	3	6	2132	2137	50 %	0 %	50 %	0 %	407702036
11	NC_018685	TG	3	6	2195	2200	0 %	50 %	50 %	0 %	407702036
12	NC_018685	TC	3	6	3057	3062	0 %	50 %	0 %	50 %	407702036
13	NC_018685	AT	3	6	4030	4035	50 %	50 %	0 %	0 %	407702037
14	NC_018685	AT	3	6	4686	4691	50 %	50 %	0 %	0 %	407702037
15	NC_018685	CA	3	6	4711	4716	50 %	0 %	0 %	50 %	407702037
16	NC_018685	AT	3	6	7490	7495	50 %	50 %	0 %	0 %	407702043
17	NC_018685	AG	3	6	8357	8362	50 %	0 %	50 %	0 %	407702043
18	NC_018685	AG	3	6	9565	9570	50 %	0 %	50 %	0 %	407702043
19	NC_018685	TG	3	6	11541	11546	0 %	50 %	50 %	0 %	407702046
20	NC_018685	AG	3	6	11765	11770	50 %	0 %	50 %	0 %	407702046
21	NC_018685	TC	3	6	11962	11967	0 %	50 %	0 %	50 %	407702046
22	NC_018685	AT	3	6	13585	13590	50 %	50 %	0 %	0 %	407702048
23	NC_018685	TA	3	6	14228	14233	50 %	50 %	0 %	0 %	407702050
24	NC_018685	AT	3	6	16305	16310	50 %	50 %	0 %	0 %	407702053
25	NC_018685	GT	3	6	16323	16328	0 %	50 %	50 %	0 %	407702053
26	NC_018685	CT	3	6	17595	17600	0 %	50 %	0 %	50 %	407702054
27	NC_018685	GT	3	6	17627	17632	0 %	50 %	50 %	0 %	407702054
28	NC_018685	TA	4	8	17800	17807	50 %	50 %	0 %	0 %	407702054
29	NC_018685	AT	3	6	17945	17950	50 %	50 %	0 %	0 %	407702054
30	NC_018685	GT	3	6	19094	19099	0 %	50 %	50 %	0 %	407702055
31	NC_018685	TA	3	6	19544	19549	50 %	50 %	0 %	0 %	407702055
32	NC_018685	GA	3	6	19694	19699	50 %	0 %	50 %	0 %	407702055
33	NC_018685	AT	3	6	20219	20224	50 %	50 %	0 %	0 %	407702056
34	NC_018685	AT	3	6	20959	20964	50 %	50 %	0 %	0 %	407702058
35	NC_018685	AT	3	6	21765	21770	50 %	50 %	0 %	0 %	407702060
36	NC_018685	TA	3	6	22263	22268	50 %	50 %	0 %	0 %	407702060
37	NC_018685	AC	3	6	23419	23424	50 %	0 %	0 %	50 %	407702060
38	NC_018685	TG	3	6	24291	24296	0 %	50 %	50 %	0 %	407702062
39	NC_018685	GT	3	6	25549	25554	0 %	50 %	50 %	0 %	407702065
40	NC_018685	CA	3	6	27131	27136	50 %	0 %	0 %	50 %	407702065
41	NC_018685	AG	3	6	27486	27491	50 %	0 %	50 %	0 %	407702065
42	NC_018685	AC	3	6	28265	28270	50 %	0 %	0 %	50 %	407702066
43	NC_018685	TA	3	6	28344	28349	50 %	50 %	0 %	0 %	407702066
44	NC_018685	GC	3	6	28519	28524	0 %	0 %	50 %	50 %	407702066
45	NC_018685	AT	3	6	28983	28988	50 %	50 %	0 %	0 %	407702066
46	NC_018685	TA	3	6	29658	29663	50 %	50 %	0 %	0 %	407702068
47	NC_018685	CA	3	6	30231	30236	50 %	0 %	0 %	50 %	407702069
48	NC_018685	TA	3	6	30358	30363	50 %	50 %	0 %	0 %	407702069
49	NC_018685	CT	3	6	31520	31525	0 %	50 %	0 %	50 %	407702071
50	NC_018685	TG	5	10	31674	31683	0 %	50 %	50 %	0 %	407702071
51	NC_018685	AG	3	6	32231	32236	50 %	0 %	50 %	0 %	407702072
52	NC_018685	TG	3	6	32936	32941	0 %	50 %	50 %	0 %	407702072
53	NC_018685	TA	3	6	33585	33590	50 %	50 %	0 %	0 %	407702072
54	NC_018685	TA	3	6	34627	34632	50 %	50 %	0 %	0 %	407702073
55	NC_018685	TA	3	6	35211	35216	50 %	50 %	0 %	0 %	407702074
56	NC_018685	TG	3	6	35423	35428	0 %	50 %	50 %	0 %	407702074
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58	NC_018685	AT	3	6	36270	36275	50 %	50 %	0 %	0 %	407702074
59	NC_018685	TA	3	6	38688	38693	50 %	50 %	0 %	0 %	407702076
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62	NC_018685	TA	3	6	40943	40948	50 %	50 %	0 %	0 %	407702080
63	NC_018685	TA	3	6	43182	43187	50 %	50 %	0 %	0 %	407702083
64	NC_018685	TA	3	6	43319	43324	50 %	50 %	0 %	0 %	407702083
65	NC_018685	CA	3	6	43814	43819	50 %	0 %	0 %	50 %	407702084
66	NC_018685	AT	3	6	43838	43843	50 %	50 %	0 %	0 %	407702084
67	NC_018685	TG	3	6	44496	44501	0 %	50 %	50 %	0 %	407702084
68	NC_018685	GT	3	6	44888	44893	0 %	50 %	50 %	0 %	407702084
69	NC_018685	AT	3	6	45717	45722	50 %	50 %	0 %	0 %	407702085
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71	NC_018685	GA	3	6	47978	47983	50 %	0 %	50 %	0 %	407702087
72	NC_018685	AT	3	6	48216	48221	50 %	50 %	0 %	0 %	407702088
73	NC_018685	CA	3	6	48328	48333	50 %	0 %	0 %	50 %	407702088
74	NC_018685	GA	3	6	49179	49184	50 %	0 %	50 %	0 %	407702089
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80	NC_018685	TA	3	6	52057	52062	50 %	50 %	0 %	0 %	407702095
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82	NC_018685	TA	3	6	55793	55798	50 %	50 %	0 %	0 %	407702099
83	NC_018685	TA	3	6	55860	55865	50 %	50 %	0 %	0 %	407702099
84	NC_018685	AT	4	8	55896	55903	50 %	50 %	0 %	0 %	407702099
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87	NC_018685	TA	4	8	56316	56323	50 %	50 %	0 %	0 %	407702100
88	NC_018685	AT	3	6	57197	57202	50 %	50 %	0 %	0 %	407702100
89	NC_018685	AT	3	6	57252	57257	50 %	50 %	0 %	0 %	407702100
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91	NC_018685	AT	3	6	59807	59812	50 %	50 %	0 %	0 %	407702102
92	NC_018685	AG	3	6	59827	59832	50 %	0 %	50 %	0 %	407702102
93	NC_018685	GA	3	6	60110	60115	50 %	0 %	50 %	0 %	407702102
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105	NC_018685	AT	3	6	69104	69109	50 %	50 %	0 %	0 %	407702106
106	NC_018685	AT	4	8	70396	70403	50 %	50 %	0 %	0 %	407702108
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109	NC_018685	AT	3	6	71726	71731	50 %	50 %	0 %	0 %	407702110
110	NC_018685	AT	3	6	72382	72387	50 %	50 %	0 %	0 %	407702110
111	NC_018685	CA	3	6	72407	72412	50 %	0 %	0 %	50 %	407702110
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129	NC_018685	AT	3	6	80627	80632	50 %	50 %	0 %	0 %	407702118
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139	NC_018685	AC	3	6	85423	85428	50 %	0 %	0 %	50 %	407702120
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142	NC_018685	AT	3	6	89216	89221	50 %	50 %	0 %	0 %	407702127
143	NC_018685	TA	3	6	89408	89413	50 %	50 %	0 %	0 %	407702127
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.