MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC8

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018684	AGT	2	6	118	123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708755
2	NC_018684	CAT	2	6	505	510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708756
3	NC_018684	TAT	2	6	513	518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708756
4	NC_018684	TTC	2	6	559	564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708756
5	NC_018684	ATA	2	6	1510	1515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708758
6	NC_018684	GAA	2	6	1796	1801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708759
7	NC_018684	GCT	2	6	1802	1807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708759
8	NC_018684	ATA	2	6	1878	1883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708759
9	NC_018684	CAG	2	6	1908	1913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407708759
10	NC_018684	ATT	2	6	1957	1962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708759
11	NC_018684	GAT	2	6	2021	2026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708759
12	NC_018684	GCT	2	6	2087	2092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407708759
13	NC_018684	CAA	2	6	2172	2177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407708759
14	NC_018684	ATA	2	6	2178	2183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708759
15	NC_018684	TAA	2	6	2305	2310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708759
16	NC_018684	TAA	2	6	2323	2328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708759
17	NC_018684	GAT	2	6	2396	2401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708759
18	NC_018684	ATT	2	6	2593	2598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708759
19	NC_018684	AGA	2	6	2650	2655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708759
20	NC_018684	AAG	2	6	2691	2696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708759
21	NC_018684	TGA	2	6	2725	2730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708759
22	NC_018684	AAG	2	6	2790	2795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708759
23	NC_018684	CAA	2	6	2819	2824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407708759
24	NC_018684	ATG	2	6	3600	3605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708760
25	NC_018684	TAC	2	6	3987	3992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708761
26	NC_018684	GAA	3	9	4309	4317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708762
27	NC_018684	ATT	2	6	4419	4424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708762
28	NC_018684	TCT	2	6	4450	4455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708762
29	NC_018684	AGT	2	6	4570	4575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407708762
30	NC_018684	TAA	2	6	4649	4654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708762
31	NC_018684	GAA	2	6	4705	4710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708762
32	NC_018684	GAA	2	6	4723	4728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708762
33	NC_018684	GAA	3	9	4735	4743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708762
34	NC_018684	ATA	3	9	4832	4840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708762
35	NC_018684	AAG	2	6	4865	4870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708762
36	NC_018684	GAA	2	6	5038	5043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708762
37	NC_018684	GAA	2	6	5155	5160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708762
38	NC_018684	AGA	2	6	5187	5192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708762
39	NC_018684	GAA	2	6	5245	5250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708762
40	NC_018684	TTG	2	6	5945	5950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407708763
41	NC_018684	TTC	2	6	6023	6028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708763
42	NC_018684	AAT	2	6	6049	6054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708763
43	NC_018684	GTT	2	6	6060	6065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407708763
44	NC_018684	TGG	3	9	6098	6106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407708763
45	NC_018684	CTT	2	6	6141	6146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708763
46	NC_018684	TCT	2	6	6171	6176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708763
47	NC_018684	GAA	2	6	6261	6266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708763
48	NC_018684	TTA	2	6	6358	6363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708763
49	NC_018684	TAC	2	6	6611	6616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708764
50	NC_018684	TTC	2	6	6687	6692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708764
51	NC_018684	TCT	2	6	6745	6750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708764
52	NC_018684	CTT	2	6	6776	6781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708764
53	NC_018684	TTC	2	6	6894	6899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708764
54	NC_018684	CTT	2	6	7067	7072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708764
55	NC_018684	ATT	2	6	7098	7103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708764
56	NC_018684	TTC	3	9	7194	7202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708764
57	NC_018684	TTC	2	6	7209	7214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708764
58	NC_018684	CTT	2	6	7226	7231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708764
59	NC_018684	TTA	2	6	7283	7288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407708764
60	NC_018684	ACT	2	6	7362	7367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407708764
61	NC_018684	AGA	2	6	7482	7487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407708764
62	NC_018684	TAA	2	6	7512	7517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407708764
63	NC_018684	TTC	3	9	7620	7628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407708764

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.