MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pSYMA

Total Repeats: 684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018683	GCCG	2	8	5132	5139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018683	TCCG	2	8	14815	14822	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018683	CGTT	2	8	23030	23037	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018683	TGCC	2	8	25027	25034	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018683	ACCG	2	8	25443	25450	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018683	CCTA	2	8	25453	25460	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_018683	ACTC	2	8	25529	25536	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018683	TCCG	2	8	25751	25758	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018683	CGCT	2	8	25762	25769	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018683	GCGA	2	8	26306	26313	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_018683	CCGG	2	8	35620	35627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018683	ACCA	2	8	44457	44464	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018683	GTAA	2	8	46983	46990	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018683	CGGC	2	8	47758	47765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018683	ATGG	2	8	50802	50809	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018683	ACGT	2	8	50865	50872	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018683	AGAA	2	8	53920	53927	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018683	GGCC	2	8	53952	53959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018683	CAGC	2	8	54114	54121	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018683	GCCG	2	8	54323	54330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018683	GCAT	2	8	55863	55870	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018683	TCCG	2	8	60482	60489	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018683	CTTG	2	8	63255	63262	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018683	GTGC	2	8	64719	64726	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018683	CCGC	2	8	64745	64752	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_018683	TCTT	2	8	65013	65020	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018683	GCTT	2	8	65195	65202	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_018683	TTCG	2	8	65286	65293	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018683	GCCC	2	8	65369	65376	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_018683	AGCG	2	8	65933	65940	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_018683	CCGA	2	8	66116	66123	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018683	GTCA	2	8	66267	66274	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018683	GGCT	2	8	83576	83583	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018683	TGAA	2	8	92542	92549	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018683	TCGA	2	8	92583	92590	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018683	CCTT	2	8	92605	92612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018683	GCCG	2	8	92634	92641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018683	GACG	2	8	94886	94893	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018683	TGCT	2	8	98402	98409	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018683	CGAA	2	8	104263	104270	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018683	AGTC	2	8	107401	107408	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018683	GCAG	2	8	107639	107646	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018683	TGGA	2	8	110620	110627	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018683	AGCT	2	8	113748	113755	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018683	CCAC	2	8	115975	115982	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_018683	TGGA	2	8	116456	116463	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018683	GTCG	2	8	119522	119529	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_018683	GCCC	2	8	119793	119800	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_018683	CTTG	2	8	120232	120239	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018683	GGTC	2	8	123765	123772	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018683	TCAA	2	8	125254	125261	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_018683	ATTC	2	8	126377	126384	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018683	CGAT	2	8	126522	126529	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018683	GGGA	2	8	132377	132384	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018683	ATCG	2	8	132501	132508	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018683	CCTT	2	8	135070	135077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018683	CCAG	2	8	136410	136417	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018683	GATG	2	8	145728	145735	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018683	AAGC	2	8	145845	145852	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018683	GTCG	2	8	145992	145999	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018683	TGAA	2	8	146163	146170	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018683	AACG	2	8	147119	147126	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018683	GCCG	2	8	151096	151103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018683	CTTC	2	8	151186	151193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018683	GAAG	2	8	157699	157706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018683	CTTT	2	8	161513	161520	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_018683	GGGT	2	8	161564	161571	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018683	GAAG	2	8	161692	161699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018683	ATCC	2	8	163016	163023	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018683	CGCT	2	8	163157	163164	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018683	TGCG	2	8	164294	164301	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_018683	GAAG	2	8	164352	164359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018683	CTGA	2	8	166815	166822	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018683	CGTT	2	8	171726	171733	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018683	TGAC	2	8	174276	174283	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_018683	CAAA	2	8	181380	181387	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018683	TCCG	2	8	184395	184402	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018683	TGCA	2	8	185590	185597	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_018683	TCAA	2	8	187986	187993	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_018683	AAAC	2	8	188005	188012	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_018683	GCCA	2	8	207900	207907	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018683	CGGG	2	8	208430	208437	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_018683	GGAG	2	8	208612	208619	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018683	TTCA	2	8	215786	215793	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_018683	TTTC	2	8	224712	224719	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018683	GTCG	2	8	226532	226539	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_018683	AAGG	2	8	229144	229151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018683	CGGC	2	8	229191	229198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018683	CGAG	2	8	230583	230590	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_018683	AACG	2	8	230809	230816	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_018683	GAGG	2	8	233309	233316	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018683	CGAC	2	8	236222	236229	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_018683	CGGT	2	8	238958	238965	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_018683	TGGC	2	8	239035	239042	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_018683	TCAA	2	8	239083	239090	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018683	ATCC	2	8	240079	240086	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_018683	GATG	2	8	243115	243122	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018683	CCCG	2	8	243159	243166	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_018683	ACGG	2	8	249849	249856	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_018683	CTGC	2	8	249871	249878	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_018683	ATAG	2	8	252619	252626	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018683	AGGG	2	8	253792	253799	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018683	TCGC	2	8	254047	254054	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_018683	ATCG	2	8	257349	257356	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_018683	GGCG	2	8	257362	257369	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_018683	TGAC	2	8	257493	257500	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_018683	ATGC	2	8	260082	260089	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_018683	GCCT	2	8	264474	264481	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018683	TCCG	2	8	264693	264700	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_018683	AGGG	2	8	264712	264719	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018683	GGAT	2	8	264730	264737	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018683	GAAT	2	8	265945	265952	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018683	AGGA	2	8	274435	274442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018683	CAGG	2	8	275049	275056	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018683	CTCG	2	8	275194	275201	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018683	GCGA	2	8	275307	275314	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_018683	TCGG	2	8	275481	275488	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_018683	GCGG	2	8	280719	280726	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_018683	GCGG	2	8	288788	288795	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018683	ATCG	2	8	288860	288867	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_018683	GCCT	2	8	289086	289093	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_018683	GCCT	2	8	291359	291366	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_018683	TTCG	2	8	302072	302079	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_018683	CCGT	2	8	307328	307335	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_018683	CGAC	2	8	309671	309678	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_018683	GCTG	2	8	311547	311554	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_018683	TCAA	2	8	312119	312126	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_018683	GATG	2	8	312191	312198	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018683	GCAA	2	8	317997	318004	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_018683	GAGG	2	8	318145	318152	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018683	TGAA	2	8	319062	319069	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018683	CGCC	2	8	319102	319109	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
133	NC_018683	CTTC	2	8	321704	321711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_018683	ATCA	2	8	326419	326426	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_018683	TCGT	2	8	326491	326498	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_018683	CCGT	2	8	328015	328022	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_018683	TTTC	2	8	328666	328673	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_018683	TTGG	2	8	328726	328733	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018683	GGGA	2	8	331834	331841	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018683	AACG	2	8	331853	331860	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_018683	CGGG	2	8	332059	332066	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
142	NC_018683	TCGC	2	8	332137	332144	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018683	CATG	2	8	332317	332324	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_018683	CACG	2	8	332878	332885	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_018683	GGTT	2	8	335711	335718	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018683	GGCC	2	8	336350	336357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_018683	AGGC	2	8	336434	336441	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_018683	GCAG	2	8	337100	337107	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_018683	TATC	2	8	338828	338835	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_018683	GCAA	2	8	338845	338852	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_018683	GATG	2	8	338921	338928	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018683	CTTC	2	8	339756	339763	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_018683	TGGG	2	8	339800	339807	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018683	CGAG	2	8	339866	339873	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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157	NC_018683	TCCT	2	8	353321	353328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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166	NC_018683	TCCT	2	8	395786	395793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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170	NC_018683	CCCT	2	8	404710	404717	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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176	NC_018683	TCGG	2	8	407883	407890	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
177	NC_018683	GAAA	2	8	408302	408309	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
178	NC_018683	TCGA	2	8	414732	414739	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
179	NC_018683	TGCA	2	8	420613	420620	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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181	NC_018683	GTTC	2	8	428530	428537	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
182	NC_018683	TTTG	2	8	429785	429792	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_018683	CCAG	2	8	438757	438764	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
186	NC_018683	CGTC	2	8	440395	440402	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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271	NC_018683	GAAC	2	8	654378	654385	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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497	NC_018683	TTGC	2	8	1155342	1155349	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
498	NC_018683	TCAT	2	8	1155382	1155389	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
499	NC_018683	CGCT	2	8	1155588	1155595	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
500	NC_018683	CAAT	2	8	1156918	1156925	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

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