MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pRM41A

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018682	GAGGG	2	10	5778	5787	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018682	TGCTG	2	10	29316	29325	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018682	GCCGG	2	10	31142	31151	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_018682	TGCGC	2	10	31612	31621	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_018682	CGTCG	2	10	59500	59509	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_018682	CAGGA	2	10	68524	68533	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_018682	TTGGC	2	10	80250	80259	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018682	GACAG	2	10	82623	82632	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018682	CCGCG	2	10	116326	116335	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10	NC_018682	ATCTG	2	10	117168	117177	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018682	GCGGA	2	10	123172	123181	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018682	CAAGC	2	10	134313	134322	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_018682	GTCCG	2	10	143716	143725	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_018682	GGCTC	2	10	144173	144182	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_018682	GGGCA	2	10	168831	168840	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_018682	TAAGC	2	10	181060	181069	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018682	AGCGC	2	10	190099	190108	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_018682	TTCGG	2	10	212559	212568	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018682	GCAGC	2	10	213591	213600	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_018682	GGACC	2	10	217202	217211	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_018682	CCGCG	2	10	217278	217287	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_018682	TCCGC	2	10	218316	218325	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_018682	CATTT	2	10	219879	219888	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_018682	CCTTC	2	10	234107	234116	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
25	NC_018682	AGCTG	2	10	235466	235475	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018682	AAGCC	2	10	245808	245817	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.