MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pRM41A

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018682	ACCA	2	8	5048	5055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018682	ACCT	2	8	5585	5592	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018682	ATCG	2	8	6565	6572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018682	GATC	2	8	6580	6587	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018682	ACCT	2	8	7498	7505	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018682	TCGG	2	8	7564	7571	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018682	TTCA	2	8	8303	8310	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018682	TTCC	2	8	10625	10632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018682	GAAG	2	8	10643	10650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018682	CAGG	2	8	26905	26912	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_018682	AGGC	2	8	27062	27069	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018682	GCTT	2	8	31337	31344	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018682	CAGC	2	8	31406	31413	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018682	CGTT	2	8	31540	31547	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018682	CTGG	2	8	31766	31773	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018682	CGAT	2	8	31816	31823	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018682	AAAT	2	8	53572	53579	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018682	GGAA	2	8	59567	59574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018682	GTCG	2	8	61583	61590	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018682	GGCA	2	8	65392	65399	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018682	AGGG	2	8	65420	65427	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018682	AGGG	2	8	68503	68510	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018682	GATC	2	8	77183	77190	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018682	GAAA	2	8	79741	79748	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018682	CGGT	2	8	82704	82711	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018682	CGTG	2	8	90610	90617	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018682	GGGC	2	8	95837	95844	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_018682	ATGC	2	8	95857	95864	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018682	CATT	2	8	98335	98342	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018682	GGTG	2	8	98381	98388	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018682	GAGG	2	8	98419	98426	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018682	TAGG	2	8	107959	107966	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018682	CAGC	2	8	112549	112556	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018682	ATCT	2	8	112612	112619	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018682	CAGC	2	8	116350	116357	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018682	CACC	2	8	116498	116505	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_018682	TCTT	2	8	116767	116774	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018682	CCGG	2	8	116932	116939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018682	CTGC	2	8	123202	123209	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018682	CGGC	2	8	134365	134372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018682	GCCG	2	8	134386	134393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018682	AGCG	2	8	134429	134436	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018682	CGGC	2	8	134613	134620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018682	AATG	2	8	139674	139681	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018682	AGGC	2	8	150518	150525	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018682	GCAC	2	8	157977	157984	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_018682	TATG	2	8	159062	159069	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018682	GTTA	2	8	159195	159202	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018682	TTCA	2	8	168415	168422	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018682	GCGA	2	8	168823	168830	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018682	GAGC	2	8	169174	169181	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_018682	TTCC	2	8	172952	172959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018682	CATG	2	8	174033	174040	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018682	CAGC	2	8	179350	179357	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018682	CCGG	2	8	180249	180256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018682	ACGA	2	8	180726	180733	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018682	ACCA	2	8	180968	180975	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018682	GCCG	2	8	186025	186032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018682	AGGG	2	8	186547	186554	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018682	TGCG	2	8	190153	190160	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018682	TCAA	2	8	191490	191497	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018682	TGTC	2	8	201520	201527	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018682	CGAT	2	8	201689	201696	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_018682	AGGG	2	8	202442	202449	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018682	ATGC	2	8	209073	209080	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_018682	CGGC	2	8	212479	212486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018682	ACGC	2	8	213658	213665	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_018682	TTCC	2	8	216819	216826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018682	TTCC	2	8	219708	219715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018682	GGGC	2	8	219950	219957	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018682	TCCT	2	8	221032	221039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018682	GCAG	2	8	221439	221446	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_018682	TCGA	2	8	221468	221475	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018682	CGAG	2	8	221816	221823	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018682	TCCG	2	8	225046	225053	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.