MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pRM41A

Total Repeats: 3601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018682	CGG	2	6	35	40	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018682	GCC	2	6	44	49	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_018682	GCA	2	6	113	118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689767
4	NC_018682	GCA	2	6	156	161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689767
5	NC_018682	CAG	2	6	297	302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689767
6	NC_018682	AAC	2	6	310	315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689767
7	NC_018682	TCC	2	6	395	400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689767
8	NC_018682	CGT	2	6	406	411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689767
9	NC_018682	GGC	2	6	454	459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689767
10	NC_018682	ACC	3	9	469	477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689767
11	NC_018682	TGC	2	6	612	617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689767
12	NC_018682	ACG	2	6	626	631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689767
13	NC_018682	CGT	2	6	640	645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689767
14	NC_018682	TCT	2	6	773	778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689767
15	NC_018682	ACG	2	6	821	826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689767
16	NC_018682	CCG	2	6	844	849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689767
17	NC_018682	CAA	2	6	887	892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689767
18	NC_018682	ATT	2	6	898	903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407689767
19	NC_018682	TGA	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689767
20	NC_018682	ATG	2	6	1046	1051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689767
21	NC_018682	TTG	2	6	1105	1110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689767
22	NC_018682	TCA	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689767
23	NC_018682	TTG	2	6	1306	1311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689768
24	NC_018682	AGC	2	6	1363	1368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689768
25	NC_018682	CCT	2	6	1374	1379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689768
26	NC_018682	GCT	2	6	1692	1697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689768
27	NC_018682	CAG	2	6	1698	1703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689768
28	NC_018682	TCG	2	6	1753	1758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689768
29	NC_018682	GCA	2	6	2047	2052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689768
30	NC_018682	GAA	2	6	2338	2343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018682	CGT	2	6	2383	2388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018682	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689769
33	NC_018682	GCG	2	6	2538	2543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689769
34	NC_018682	CGA	2	6	2566	2571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689769
35	NC_018682	CGA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689769
36	NC_018682	TCG	2	6	2825	2830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689769
37	NC_018682	GAA	2	6	2950	2955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689769
38	NC_018682	GCA	2	6	2970	2975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689769
39	NC_018682	TCA	2	6	3050	3055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689769
40	NC_018682	CCG	2	6	3056	3061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689769
41	NC_018682	GAA	2	6	3067	3072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689769
42	NC_018682	ACA	2	6	3152	3157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689769
43	NC_018682	GGA	2	6	3171	3176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689769
44	NC_018682	ATC	2	6	3199	3204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689769
45	NC_018682	ACA	2	6	3219	3224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689769
46	NC_018682	TGC	2	6	3249	3254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689769
47	NC_018682	GAT	3	9	3346	3354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689769
48	NC_018682	TGG	2	6	3447	3452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689769
49	NC_018682	ATG	2	6	3463	3468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689769
50	NC_018682	GTC	3	9	3478	3486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689769
51	NC_018682	AGG	2	6	3521	3526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689769
52	NC_018682	CGC	2	6	3552	3557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689769
53	NC_018682	GGA	2	6	3607	3612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689769
54	NC_018682	CGA	2	6	3706	3711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689769
55	NC_018682	GGT	2	6	3740	3745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018682	GCG	4	12	3763	3774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018682	CGG	3	9	3891	3899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018682	AAT	2	6	3924	3929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018682	GCG	2	6	3971	3976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018682	GCG	2	6	3984	3989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018682	TGC	2	6	4232	4237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689770
62	NC_018682	CAG	2	6	4240	4245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689770
63	NC_018682	CGC	2	6	4263	4268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689770
64	NC_018682	ACG	2	6	4347	4352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018682	CCA	2	6	4378	4383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_018682	CTC	2	6	4458	4463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_018682	CGC	2	6	4558	4563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_018682	GCA	2	6	4637	4642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018682	GAA	2	6	4688	4693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018682	TTC	2	6	4724	4729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018682	GTT	2	6	4787	4792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018682	GCC	2	6	4803	4808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_018682	CTG	2	6	4832	4837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018682	AAC	2	6	4911	4916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018682	CCG	2	6	4981	4986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_018682	GGC	2	6	5076	5081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018682	TCG	4	12	5099	5110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689771
78	NC_018682	GTC	2	6	5114	5119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689771
79	NC_018682	TCG	2	6	5197	5202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689771
80	NC_018682	GCC	2	6	5224	5229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689771
81	NC_018682	GCC	2	6	5247	5252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689771
82	NC_018682	AGG	2	6	5402	5407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689771
83	NC_018682	GCC	3	9	5411	5419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689771
84	NC_018682	CAG	2	6	5454	5459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689771
85	NC_018682	CCG	2	6	5489	5494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689771
86	NC_018682	CGC	2	6	5619	5624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_018682	CGC	2	6	5812	5817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_018682	AAG	2	6	5936	5941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018682	GCG	2	6	5976	5981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689772
90	NC_018682	TCG	2	6	6004	6009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689772
91	NC_018682	GCC	2	6	6045	6050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689772
92	NC_018682	CGC	2	6	6129	6134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689772
93	NC_018682	TCA	2	6	6143	6148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689772
94	NC_018682	GCG	2	6	6165	6170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689772
95	NC_018682	CGA	2	6	6232	6237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689772
96	NC_018682	TCG	2	6	6358	6363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689772
97	NC_018682	GTC	2	6	6410	6415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689772
98	NC_018682	CGC	2	6	6459	6464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689772
99	NC_018682	ACG	2	6	6671	6676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689773
100	NC_018682	AGC	2	6	6704	6709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689773
101	NC_018682	CGG	2	6	6774	6779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689773
102	NC_018682	GTC	2	6	6814	6819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689773
103	NC_018682	AGC	2	6	7083	7088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018682	GCC	2	6	7177	7182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_018682	TGA	2	6	7335	7340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018682	TAA	2	6	7433	7438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018682	CAT	2	6	7629	7634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689774
108	NC_018682	GTT	2	6	7682	7687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689774
109	NC_018682	GAT	2	6	7731	7736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689774
110	NC_018682	TCG	3	9	7937	7945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689774
111	NC_018682	TCG	2	6	7982	7987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689774
112	NC_018682	GTC	2	6	8098	8103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689774
113	NC_018682	GCC	2	6	8210	8215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_018682	GAT	2	6	8228	8233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018682	GAT	2	6	8252	8257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018682	GAT	2	6	8288	8293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018682	TGT	2	6	8294	8299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018682	CGC	2	6	8355	8360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689775
119	NC_018682	CAG	2	6	8509	8514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689775
120	NC_018682	ATC	2	6	8554	8559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689775
121	NC_018682	CAC	2	6	8616	8621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689775
122	NC_018682	AGC	2	6	8786	8791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689775
123	NC_018682	TCT	2	6	8840	8845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689775
124	NC_018682	TGG	2	6	8855	8860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689775
125	NC_018682	AGC	2	6	8927	8932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689775
126	NC_018682	CAA	2	6	8979	8984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689775
127	NC_018682	GCG	2	6	9120	9125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689776
128	NC_018682	TTG	2	6	9254	9259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689776
129	NC_018682	GAT	2	6	9265	9270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689776
130	NC_018682	GCG	2	6	9400	9405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689776
131	NC_018682	TCG	2	6	9432	9437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689776
132	NC_018682	AAT	2	6	9561	9566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407689776
133	NC_018682	CTC	2	6	9673	9678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689776
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258	NC_018682	GAC	2	6	19439	19444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689782
259	NC_018682	CGA	2	6	19621	19626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689782
260	NC_018682	CGA	2	6	19785	19790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689783
261	NC_018682	CTT	2	6	19795	19800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689783
262	NC_018682	GTA	2	6	19837	19842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689783
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379	NC_018682	AGC	2	6	28761	28766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689792
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