MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pRM41A

Total Repeats: 464

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018682	CGG	2	6	35	40	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018682	GCC	2	6	44	49	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_018682	GAA	2	6	2338	2343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018682	CGT	2	6	2383	2388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018682	GGT	2	6	3740	3745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018682	GCG	4	12	3763	3774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018682	CGG	3	9	3891	3899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018682	AAT	2	6	3924	3929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018682	GCG	2	6	3971	3976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018682	GCG	2	6	3984	3989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018682	ACG	2	6	4347	4352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018682	CCA	2	6	4378	4383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_018682	CTC	2	6	4458	4463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_018682	CGC	2	6	4558	4563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_018682	GCA	2	6	4637	4642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018682	GAA	2	6	4688	4693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018682	TTC	2	6	4724	4729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018682	GTT	2	6	4787	4792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018682	GCC	2	6	4803	4808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_018682	CTG	2	6	4832	4837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018682	AAC	2	6	4911	4916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018682	CCG	2	6	4981	4986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_018682	GGC	2	6	5076	5081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018682	CGC	2	6	5619	5624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_018682	CGC	2	6	5812	5817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_018682	AAG	2	6	5936	5941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018682	AGC	2	6	7083	7088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018682	GCC	2	6	7177	7182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_018682	TGA	2	6	7335	7340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018682	TAA	2	6	7433	7438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018682	GCC	2	6	8210	8215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_018682	GAT	2	6	8228	8233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018682	GAT	2	6	8252	8257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018682	GAT	2	6	8288	8293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018682	TGT	2	6	8294	8299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018682	CAG	2	6	10662	10667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018682	CAT	2	6	10702	10707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018682	CAC	2	6	12295	12300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_018682	TCT	2	6	12386	12391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018682	GAT	2	6	12399	12404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018682	GCG	2	6	12535	12540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018682	GCG	2	6	15608	15613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018682	CGA	2	6	24266	24271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018682	GTT	2	6	24296	24301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018682	ACG	2	6	24448	24453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018682	ACG	2	6	24507	24512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018682	GTT	2	6	24522	24527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018682	CAC	2	6	26338	26343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_018682	GCA	2	6	26797	26802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018682	TCT	2	6	26839	26844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018682	GTT	2	6	26857	26862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018682	CTG	2	6	26920	26925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018682	CCT	2	6	26982	26987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_018682	CAA	2	6	27072	27077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018682	GCG	2	6	27103	27108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018682	CAA	2	6	28450	28455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018682	AGG	2	6	28519	28524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018682	CGC	2	6	28844	28849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_018682	TGT	2	6	29015	29020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018682	AAG	2	6	29024	29029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018682	GAA	2	6	29072	29077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018682	TGC	2	6	29334	29339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018682	TGA	2	6	29355	29360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018682	GAG	2	6	29494	29499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018682	GCC	2	6	29520	29525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_018682	TCC	2	6	29531	29536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_018682	CCT	2	6	29635	29640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_018682	GCG	2	6	30350	30355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018682	ACG	2	6	30357	30362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018682	GCC	2	6	31056	31061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_018682	GCG	2	6	31096	31101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018682	CAG	2	6	31115	31120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018682	CCG	2	6	31133	31138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_018682	AGC	2	6	31313	31318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018682	GCG	2	6	31365	31370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018682	GTT	2	6	31449	31454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018682	CGT	2	6	31569	31574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018682	CGA	2	6	31633	31638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018682	GCC	2	6	31686	31691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_018682	CAT	2	6	31911	31916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018682	TGT	2	6	31923	31928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018682	TCC	2	6	39851	39856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_018682	CGC	2	6	39940	39945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_018682	GAA	2	6	40077	40082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018682	CCA	2	6	40109	40114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_018682	CGA	2	6	40221	40226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018682	GCA	2	6	40236	40241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018682	GGA	2	6	41874	41879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018682	GCG	2	6	46578	46583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018682	GTC	2	6	49111	49116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018682	CTC	2	6	50603	50608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_018682	TCC	2	6	53335	53340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_018682	CTT	2	6	53404	53409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018682	CTC	2	6	53424	53429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_018682	TCG	2	6	53436	53441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018682	TGT	2	6	53460	53465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018682	AAC	2	6	53486	53491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018682	GAG	2	6	53600	53605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018682	TGC	2	6	53611	53616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018682	CGC	2	6	53716	53721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_018682	GGC	2	6	53726	53731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018682	CGC	2	6	54754	54759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_018682	CCG	2	6	58291	58296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_018682	GAA	2	6	58358	58363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018682	GAG	2	6	58413	58418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018682	TGG	2	6	61463	61468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018682	TTC	2	6	61559	61564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018682	GCG	2	6	61713	61718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018682	TCT	2	6	62894	62899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018682	ATA	2	6	62902	62907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018682	GCA	2	6	62909	62914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018682	TCC	2	6	63896	63901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_018682	GCG	2	6	65412	65417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018682	GGT	2	6	67318	67323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018682	AGG	2	6	67446	67451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018682	CCA	2	6	68536	68541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_018682	AAC	2	6	68542	68547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018682	GGA	2	6	68550	68555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018682	GCA	2	6	69515	69520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018682	GAA	2	6	71019	71024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018682	AAG	2	6	71830	71835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018682	GGC	2	6	75517	75522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018682	TCG	2	6	75650	75655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018682	GGA	2	6	75669	75674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018682	CGA	2	6	75694	75699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018682	CAG	2	6	75712	75717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018682	CGG	2	6	75916	75921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018682	CAG	2	6	75973	75978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018682	GGC	2	6	76052	76057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018682	GGA	2	6	76765	76770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018682	CCG	2	6	77108	77113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_018682	GTG	2	6	77143	77148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018682	CCG	2	6	77170	77175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_018682	GAA	2	6	78507	78512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018682	TTG	2	6	79663	79668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018682	TCG	2	6	79727	79732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018682	AGA	2	6	79752	79757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018682	GCC	2	6	80320	80325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_018682	GAA	2	6	81683	81688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018682	CTG	3	9	81751	81759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018682	GCC	2	6	81812	81817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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407	NC_018682	TTG	2	6	219720	219725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
408	NC_018682	TTC	2	6	219814	219819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
409	NC_018682	CGC	2	6	219833	219838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
410	NC_018682	TCC	2	6	219862	219867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
411	NC_018682	GCC	2	6	219870	219875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
412	NC_018682	AAC	2	6	219961	219966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
413	NC_018682	CTC	2	6	220325	220330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
414	NC_018682	CTG	2	6	220374	220379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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420	NC_018682	GTC	2	6	220917	220922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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423	NC_018682	CCG	2	6	220954	220959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
424	NC_018682	CTC	2	6	220968	220973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
425	NC_018682	GCC	2	6	220992	220997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
426	NC_018682	TCC	2	6	221001	221006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
427	NC_018682	CTG	2	6	221010	221015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
428	NC_018682	GCC	2	6	221049	221054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
429	NC_018682	AGG	2	6	221081	221086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_018682	GGT	2	6	221572	221577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
433	NC_018682	TGA	2	6	221628	221633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
434	NC_018682	GGT	2	6	221643	221648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
435	NC_018682	TGA	2	6	221728	221733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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437	NC_018682	TGC	2	6	221810	221815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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439	NC_018682	CGG	2	6	221970	221975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
440	NC_018682	CGA	2	6	222044	222049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
441	NC_018682	CGC	2	6	222071	222076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
442	NC_018682	AGG	2	6	222130	222135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
443	NC_018682	CGA	2	6	222220	222225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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464	NC_018682	CCG	2	6	245966	245971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.