MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pRM41A

Total Repeats: 3137

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018682	GCA	2	6	113	118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689767
2	NC_018682	GCA	2	6	156	161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689767
3	NC_018682	CAG	2	6	297	302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689767
4	NC_018682	AAC	2	6	310	315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689767
5	NC_018682	TCC	2	6	395	400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689767
6	NC_018682	CGT	2	6	406	411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689767
7	NC_018682	GGC	2	6	454	459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689767
8	NC_018682	ACC	3	9	469	477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689767
9	NC_018682	TGC	2	6	612	617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689767
10	NC_018682	ACG	2	6	626	631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689767
11	NC_018682	CGT	2	6	640	645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689767
12	NC_018682	TCT	2	6	773	778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689767
13	NC_018682	ACG	2	6	821	826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689767
14	NC_018682	CCG	2	6	844	849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689767
15	NC_018682	CAA	2	6	887	892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689767
16	NC_018682	ATT	2	6	898	903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407689767
17	NC_018682	TGA	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689767
18	NC_018682	ATG	2	6	1046	1051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689767
19	NC_018682	TTG	2	6	1105	1110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689767
20	NC_018682	TCA	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689767
21	NC_018682	TTG	2	6	1306	1311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689768
22	NC_018682	AGC	2	6	1363	1368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689768
23	NC_018682	CCT	2	6	1374	1379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689768
24	NC_018682	GCT	2	6	1692	1697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689768
25	NC_018682	CAG	2	6	1698	1703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689768
26	NC_018682	TCG	2	6	1753	1758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689768
27	NC_018682	GCA	2	6	2047	2052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689768
28	NC_018682	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689769
29	NC_018682	GCG	2	6	2538	2543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689769
30	NC_018682	CGA	2	6	2566	2571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689769
31	NC_018682	CGA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689769
32	NC_018682	TCG	2	6	2825	2830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689769
33	NC_018682	GAA	2	6	2950	2955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689769
34	NC_018682	GCA	2	6	2970	2975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689769
35	NC_018682	TCA	2	6	3050	3055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689769
36	NC_018682	CCG	2	6	3056	3061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689769
37	NC_018682	GAA	2	6	3067	3072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689769
38	NC_018682	ACA	2	6	3152	3157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689769
39	NC_018682	GGA	2	6	3171	3176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689769
40	NC_018682	ATC	2	6	3199	3204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689769
41	NC_018682	ACA	2	6	3219	3224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689769
42	NC_018682	TGC	2	6	3249	3254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689769
43	NC_018682	GAT	3	9	3346	3354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689769
44	NC_018682	TGG	2	6	3447	3452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689769
45	NC_018682	ATG	2	6	3463	3468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689769
46	NC_018682	GTC	3	9	3478	3486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689769
47	NC_018682	AGG	2	6	3521	3526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689769
48	NC_018682	CGC	2	6	3552	3557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689769
49	NC_018682	GGA	2	6	3607	3612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689769
50	NC_018682	CGA	2	6	3706	3711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689769
51	NC_018682	TGC	2	6	4232	4237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689770
52	NC_018682	CAG	2	6	4240	4245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689770
53	NC_018682	CGC	2	6	4263	4268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689770
54	NC_018682	TCG	4	12	5099	5110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689771
55	NC_018682	GTC	2	6	5114	5119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689771
56	NC_018682	TCG	2	6	5197	5202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689771
57	NC_018682	GCC	2	6	5224	5229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689771
58	NC_018682	GCC	2	6	5247	5252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689771
59	NC_018682	AGG	2	6	5402	5407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689771
60	NC_018682	GCC	3	9	5411	5419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689771
61	NC_018682	CAG	2	6	5454	5459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689771
62	NC_018682	CCG	2	6	5489	5494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689771
63	NC_018682	GCG	2	6	5976	5981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689772
64	NC_018682	TCG	2	6	6004	6009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689772
65	NC_018682	GCC	2	6	6045	6050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689772
66	NC_018682	CGC	2	6	6129	6134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689772
67	NC_018682	TCA	2	6	6143	6148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689772
68	NC_018682	GCG	2	6	6165	6170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689772
69	NC_018682	CGA	2	6	6232	6237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689772
70	NC_018682	TCG	2	6	6358	6363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689772
71	NC_018682	GTC	2	6	6410	6415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689772
72	NC_018682	CGC	2	6	6459	6464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689772
73	NC_018682	ACG	2	6	6671	6676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689773
74	NC_018682	AGC	2	6	6704	6709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689773
75	NC_018682	CGG	2	6	6774	6779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689773
76	NC_018682	GTC	2	6	6814	6819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689773
77	NC_018682	CAT	2	6	7629	7634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689774
78	NC_018682	GTT	2	6	7682	7687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689774
79	NC_018682	GAT	2	6	7731	7736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689774
80	NC_018682	TCG	3	9	7937	7945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689774
81	NC_018682	TCG	2	6	7982	7987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689774
82	NC_018682	GTC	2	6	8098	8103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689774
83	NC_018682	CGC	2	6	8355	8360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689775
84	NC_018682	CAG	2	6	8509	8514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689775
85	NC_018682	ATC	2	6	8554	8559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689775
86	NC_018682	CAC	2	6	8616	8621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689775
87	NC_018682	AGC	2	6	8786	8791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689775
88	NC_018682	TCT	2	6	8840	8845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689775
89	NC_018682	TGG	2	6	8855	8860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689775
90	NC_018682	AGC	2	6	8927	8932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689775
91	NC_018682	CAA	2	6	8979	8984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689775
92	NC_018682	GCG	2	6	9120	9125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689776
93	NC_018682	TTG	2	6	9254	9259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689776
94	NC_018682	GAT	2	6	9265	9270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689776
95	NC_018682	GCG	2	6	9400	9405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689776
96	NC_018682	TCG	2	6	9432	9437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689776
97	NC_018682	AAT	2	6	9561	9566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407689776
98	NC_018682	CTC	2	6	9673	9678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689776
99	NC_018682	GGC	2	6	9687	9692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689776
100	NC_018682	CGC	2	6	9754	9759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689776
101	NC_018682	AGA	2	6	9780	9785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689776
102	NC_018682	CGA	2	6	9819	9824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689776
103	NC_018682	GCC	2	6	9902	9907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689776
104	NC_018682	TGA	2	6	9954	9959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689776
105	NC_018682	CGA	2	6	10179	10184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689776
106	NC_018682	CGA	2	6	10382	10387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689776
107	NC_018682	GTC	2	6	10447	10452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689776
108	NC_018682	CGC	2	6	10592	10597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689776
109	NC_018682	GTT	2	6	10832	10837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689777
110	NC_018682	TGC	2	6	10955	10960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689777
111	NC_018682	CTC	2	6	11057	11062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689777
112	NC_018682	CAA	2	6	11164	11169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689777
113	NC_018682	TCG	2	6	11601	11606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689777
114	NC_018682	ATC	2	6	11807	11812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689777
115	NC_018682	GTA	2	6	11841	11846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689777
116	NC_018682	CCT	2	6	11917	11922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689777
117	NC_018682	GCC	2	6	11978	11983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689777
118	NC_018682	TCC	2	6	12009	12014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689777
119	NC_018682	GAT	2	6	12172	12177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689777
120	NC_018682	CGG	2	6	12779	12784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689778
121	NC_018682	GCT	2	6	12844	12849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689778
122	NC_018682	GAT	2	6	12940	12945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689778
123	NC_018682	AAG	2	6	13130	13135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689778
124	NC_018682	CAG	2	6	13149	13154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689778
125	NC_018682	CGC	2	6	13302	13307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689778
126	NC_018682	GAA	2	6	13309	13314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689778
127	NC_018682	GCT	2	6	13337	13342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689778
128	NC_018682	GTT	2	6	13397	13402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689778
129	NC_018682	GAC	2	6	13427	13432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689778
130	NC_018682	GAC	2	6	13529	13534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689778
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132	NC_018682	TGG	2	6	13656	13661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689778
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134	NC_018682	TAC	2	6	13875	13880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689778
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153	NC_018682	TGG	2	6	15270	15275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689778
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251	NC_018682	CTT	2	6	21983	21988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689785
252	NC_018682	GCT	2	6	22192	22197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689785
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284	NC_018682	TGG	2	6	25491	25496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689788
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358	NC_018682	GAC	2	6	32383	32388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689798
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367	NC_018682	TTG	2	6	32917	32922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689799
368	NC_018682	GTC	2	6	32967	32972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689799
369	NC_018682	AAG	2	6	33228	33233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689800
370	NC_018682	TCT	2	6	33252	33257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689800
371	NC_018682	ACC	2	6	33277	33282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689800
372	NC_018682	GTC	2	6	33293	33298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689800
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497	NC_018682	CAA	2	6	43717	43722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689810
498	NC_018682	AAC	2	6	43793	43798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689810
499	NC_018682	CGC	3	9	43858	43866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689810
500	NC_018682	TCG	2	6	43887	43892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689810

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