MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pRM41A

Total Repeats: 396

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018682	CG	3	6	1809	1814	0 %	0 %	50 %	50 %	407689768
2	NC_018682	CT	4	8	2395	2402	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018682	AG	4	8	4590	4597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018682	GC	3	6	5336	5341	0 %	0 %	50 %	50 %	407689771
5	NC_018682	GC	3	6	5467	5472	0 %	0 %	50 %	50 %	407689771
6	NC_018682	CG	3	6	6449	6454	0 %	0 %	50 %	50 %	407689772
7	NC_018682	CT	3	6	6500	6505	0 %	50 %	0 %	50 %	407689772
8	NC_018682	GC	3	6	6728	6733	0 %	0 %	50 %	50 %	407689773
9	NC_018682	CG	3	6	7045	7050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018682	AG	3	6	8799	8804	50 %	0 %	50 %	0 %	407689775
11	NC_018682	GA	3	6	8954	8959	50 %	0 %	50 %	0 %	407689775
12	NC_018682	GC	3	6	9602	9607	0 %	0 %	50 %	50 %	407689776
13	NC_018682	TC	3	6	10606	10611	0 %	50 %	0 %	50 %	407689776
14	NC_018682	CT	3	6	11003	11008	0 %	50 %	0 %	50 %	407689777
15	NC_018682	GC	3	6	12149	12154	0 %	0 %	50 %	50 %	407689777
16	NC_018682	CG	3	6	12364	12369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018682	CG	3	6	12437	12442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018682	TC	3	6	12925	12930	0 %	50 %	0 %	50 %	407689778
19	NC_018682	GT	3	6	13380	13385	0 %	50 %	50 %	0 %	407689778
20	NC_018682	CG	3	6	13498	13503	0 %	0 %	50 %	50 %	407689778
21	NC_018682	CG	3	6	13823	13828	0 %	0 %	50 %	50 %	407689778
22	NC_018682	CG	3	6	13977	13982	0 %	0 %	50 %	50 %	407689778
23	NC_018682	TG	3	6	14166	14171	0 %	50 %	50 %	0 %	407689778
24	NC_018682	TC	3	6	14373	14378	0 %	50 %	0 %	50 %	407689778
25	NC_018682	CT	3	6	14987	14992	0 %	50 %	0 %	50 %	407689778
26	NC_018682	CG	3	6	15656	15661	0 %	0 %	50 %	50 %	407689779
27	NC_018682	GC	3	6	16457	16462	0 %	0 %	50 %	50 %	407689780
28	NC_018682	CG	3	6	16693	16698	0 %	0 %	50 %	50 %	407689780
29	NC_018682	GC	3	6	17420	17425	0 %	0 %	50 %	50 %	407689780
30	NC_018682	CG	3	6	17488	17493	0 %	0 %	50 %	50 %	407689780
31	NC_018682	CG	3	6	18662	18667	0 %	0 %	50 %	50 %	407689781
32	NC_018682	GA	3	6	18799	18804	50 %	0 %	50 %	0 %	407689781
33	NC_018682	GA	3	6	19029	19034	50 %	0 %	50 %	0 %	407689782
34	NC_018682	AG	3	6	19074	19079	50 %	0 %	50 %	0 %	407689782
35	NC_018682	GC	3	6	19261	19266	0 %	0 %	50 %	50 %	407689782
36	NC_018682	CG	3	6	20730	20735	0 %	0 %	50 %	50 %	407689784
37	NC_018682	AC	3	6	20741	20746	50 %	0 %	0 %	50 %	407689784
38	NC_018682	TG	3	6	21137	21142	0 %	50 %	50 %	0 %	407689784
39	NC_018682	TC	3	6	23034	23039	0 %	50 %	0 %	50 %	407689786
40	NC_018682	GC	3	6	23063	23068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018682	CG	3	6	23508	23513	0 %	0 %	50 %	50 %	407689787
42	NC_018682	AT	3	6	23980	23985	50 %	50 %	0 %	0 %	407689787
43	NC_018682	GC	3	6	24785	24790	0 %	0 %	50 %	50 %	407689788
44	NC_018682	GA	4	8	25593	25600	50 %	0 %	50 %	0 %	407689788
45	NC_018682	GC	3	6	25661	25666	0 %	0 %	50 %	50 %	407689788
46	NC_018682	CG	3	6	25977	25982	0 %	0 %	50 %	50 %	407689788
47	NC_018682	AC	3	6	27048	27053	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018682	CG	4	8	27462	27469	0 %	0 %	50 %	50 %	407689790
49	NC_018682	GT	3	6	27829	27834	0 %	50 %	50 %	0 %	407689791
50	NC_018682	CT	4	8	28263	28270	0 %	50 %	0 %	50 %	407689791
51	NC_018682	CG	3	6	28990	28995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018682	GA	3	6	29245	29250	50 %	0 %	50 %	0 %	407689793
53	NC_018682	GC	3	6	30053	30058	0 %	0 %	50 %	50 %	407689794
54	NC_018682	CG	3	6	30327	30332	0 %	0 %	50 %	50 %	407689794
55	NC_018682	CG	3	6	30889	30894	0 %	0 %	50 %	50 %	407689796
56	NC_018682	GC	3	6	31346	31351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018682	GC	3	6	32067	32072	0 %	0 %	50 %	50 %	407689798
58	NC_018682	GA	3	6	32281	32286	50 %	0 %	50 %	0 %	407689798
59	NC_018682	CA	3	6	32522	32527	50 %	0 %	0 %	50 %	407689798
60	NC_018682	AG	3	6	33119	33124	50 %	0 %	50 %	0 %	407689799
61	NC_018682	CG	3	6	33136	33141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_018682	TC	3	6	33207	33212	0 %	50 %	0 %	50 %	407689800
63	NC_018682	GT	3	6	34216	34221	0 %	50 %	50 %	0 %	407689801
64	NC_018682	TC	3	6	34817	34822	0 %	50 %	0 %	50 %	407689802
65	NC_018682	GC	3	6	35979	35984	0 %	0 %	50 %	50 %	407689803
66	NC_018682	CG	3	6	36047	36052	0 %	0 %	50 %	50 %	407689803
67	NC_018682	GC	3	6	36063	36068	0 %	0 %	50 %	50 %	407689803
68	NC_018682	GC	3	6	36088	36093	0 %	0 %	50 %	50 %	407689803
69	NC_018682	CG	3	6	36521	36526	0 %	0 %	50 %	50 %	407689804
70	NC_018682	GC	3	6	36807	36812	0 %	0 %	50 %	50 %	407689804
71	NC_018682	AC	3	6	40204	40209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018682	CG	3	6	41930	41935	0 %	0 %	50 %	50 %	407689809
73	NC_018682	TC	3	6	42698	42703	0 %	50 %	0 %	50 %	407689809
74	NC_018682	GC	3	6	43946	43951	0 %	0 %	50 %	50 %	407689810
75	NC_018682	GT	3	6	44354	44359	0 %	50 %	50 %	0 %	407689811
76	NC_018682	GT	4	8	45030	45037	0 %	50 %	50 %	0 %	407689811
77	NC_018682	GC	3	6	45238	45243	0 %	0 %	50 %	50 %	407689811
78	NC_018682	GC	3	6	45458	45463	0 %	0 %	50 %	50 %	407689812
79	NC_018682	GC	3	6	45966	45971	0 %	0 %	50 %	50 %	407689812
80	NC_018682	GC	5	10	46235	46244	0 %	0 %	50 %	50 %	407689812
81	NC_018682	CG	3	6	46917	46922	0 %	0 %	50 %	50 %	407689813
82	NC_018682	GC	4	8	48082	48089	0 %	0 %	50 %	50 %	407689813
83	NC_018682	GC	4	8	48248	48255	0 %	0 %	50 %	50 %	407689814
84	NC_018682	CG	3	6	48280	48285	0 %	0 %	50 %	50 %	407689814
85	NC_018682	GC	4	8	48736	48743	0 %	0 %	50 %	50 %	407689814
86	NC_018682	TG	3	6	49748	49753	0 %	50 %	50 %	0 %	407689815
87	NC_018682	AT	3	6	50087	50092	50 %	50 %	0 %	0 %	407689816
88	NC_018682	GA	3	6	50969	50974	50 %	0 %	50 %	0 %	407689817
89	NC_018682	TG	3	6	51749	51754	0 %	50 %	50 %	0 %	407689817
90	NC_018682	GT	3	6	52377	52382	0 %	50 %	50 %	0 %	407689818
91	NC_018682	GC	3	6	52938	52943	0 %	0 %	50 %	50 %	407689818
92	NC_018682	GC	3	6	54735	54740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_018682	CG	3	6	55281	55286	0 %	0 %	50 %	50 %	407689820
94	NC_018682	CG	3	6	56445	56450	0 %	0 %	50 %	50 %	407689821
95	NC_018682	CG	3	6	56932	56937	0 %	0 %	50 %	50 %	407689821
96	NC_018682	AG	3	6	57338	57343	50 %	0 %	50 %	0 %	407689822
97	NC_018682	TG	3	6	57534	57539	0 %	50 %	50 %	0 %	407689822
98	NC_018682	GC	3	6	57578	57583	0 %	0 %	50 %	50 %	407689822
99	NC_018682	CT	3	6	58230	58235	0 %	50 %	0 %	50 %	407689822
100	NC_018682	CT	3	6	59021	59026	0 %	50 %	0 %	50 %	407689823
101	NC_018682	TG	3	6	59172	59177	0 %	50 %	50 %	0 %	407689823
102	NC_018682	GT	3	6	59472	59477	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018682	CG	3	6	60314	60319	0 %	0 %	50 %	50 %	407689824
104	NC_018682	CG	3	6	60593	60598	0 %	0 %	50 %	50 %	407689825
105	NC_018682	CT	3	6	61042	61047	0 %	50 %	0 %	50 %	407689825
106	NC_018682	CG	3	6	62047	62052	0 %	0 %	50 %	50 %	407689826
107	NC_018682	CG	3	6	63341	63346	0 %	0 %	50 %	50 %	407689828
108	NC_018682	CG	3	6	64742	64747	0 %	0 %	50 %	50 %	407689829
109	NC_018682	CG	3	6	65024	65029	0 %	0 %	50 %	50 %	407689829
110	NC_018682	GC	3	6	65064	65069	0 %	0 %	50 %	50 %	407689829
111	NC_018682	CG	3	6	65919	65924	0 %	0 %	50 %	50 %	407689830
112	NC_018682	CA	3	6	67389	67394	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_018682	GC	3	6	67876	67881	0 %	0 %	50 %	50 %	407689832
114	NC_018682	GC	3	6	68914	68919	0 %	0 %	50 %	50 %	407689833
115	NC_018682	GC	3	6	69071	69076	0 %	0 %	50 %	50 %	407689833
116	NC_018682	GC	3	6	70009	70014	0 %	0 %	50 %	50 %	407689834
117	NC_018682	GC	3	6	70422	70427	0 %	0 %	50 %	50 %	407689834
118	NC_018682	GC	3	6	70762	70767	0 %	0 %	50 %	50 %	407689834
119	NC_018682	TC	3	6	71419	71424	0 %	50 %	0 %	50 %	407689835
120	NC_018682	CT	3	6	71866	71871	0 %	50 %	0 %	50 %	407689836
121	NC_018682	GA	3	6	72125	72130	50 %	0 %	50 %	0 %	407689836
122	NC_018682	TC	3	6	74016	74021	0 %	50 %	0 %	50 %	407689838
123	NC_018682	GC	3	6	76158	76163	0 %	0 %	50 %	50 %	407689840
124	NC_018682	GC	3	6	77631	77636	0 %	0 %	50 %	50 %	407689842
125	NC_018682	GC	3	6	78123	78128	0 %	0 %	50 %	50 %	407689842
126	NC_018682	GC	3	6	78937	78942	0 %	0 %	50 %	50 %	407689843
127	NC_018682	GC	4	8	79518	79525	0 %	0 %	50 %	50 %	407689843
128	NC_018682	CG	3	6	79827	79832	0 %	0 %	50 %	50 %	407689844
129	NC_018682	AG	3	6	80760	80765	50 %	0 %	50 %	0 %	407689845
130	NC_018682	GC	3	6	81632	81637	0 %	0 %	50 %	50 %	407689845
131	NC_018682	AC	3	6	83728	83733	50 %	0 %	0 %	50 %	407689847
132	NC_018682	GC	3	6	84105	84110	0 %	0 %	50 %	50 %	407689847
133	NC_018682	CG	3	6	84389	84394	0 %	0 %	50 %	50 %	407689847
134	NC_018682	GC	3	6	84477	84482	0 %	0 %	50 %	50 %	407689847
135	NC_018682	GC	3	6	84554	84559	0 %	0 %	50 %	50 %	407689847
136	NC_018682	CG	3	6	84777	84782	0 %	0 %	50 %	50 %	407689848
137	NC_018682	GC	3	6	85503	85508	0 %	0 %	50 %	50 %	407689849
138	NC_018682	GA	3	6	86240	86245	50 %	0 %	50 %	0 %	407689849
139	NC_018682	CG	3	6	86389	86394	0 %	0 %	50 %	50 %	407689849
140	NC_018682	CG	3	6	87883	87888	0 %	0 %	50 %	50 %	407689851
141	NC_018682	CG	3	6	89192	89197	0 %	0 %	50 %	50 %	407689852
142	NC_018682	GC	3	6	89727	89732	0 %	0 %	50 %	50 %	407689852
143	NC_018682	GA	4	8	90661	90668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018682	GT	3	6	90850	90855	0 %	50 %	50 %	0 %	407689853
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.