MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Nocardia brasiliensis ATCC 700358 chromosome

Total Repeats: 9687

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018681	ACCAC	2	10	1880	1889	40 %	0 %	0 %	60 %	407641179
2	NC_018681	TCCCG	2	10	3027	3036	0 %	20 %	20 %	60 %	407641180
3	NC_018681	TCCCG	2	10	3040	3049	0 %	20 %	20 %	60 %	407641180
4	NC_018681	CACGC	2	10	6128	6137	20 %	0 %	20 %	60 %	407641182
5	NC_018681	ACCGC	2	10	10788	10797	20 %	0 %	20 %	60 %	407641184
6	NC_018681	TGCTC	2	10	11013	11022	0 %	40 %	20 %	40 %	407641184
7	NC_018681	GGGCC	2	10	11104	11113	0 %	0 %	60 %	40 %	407641184
8	NC_018681	CCGGC	2	10	12124	12133	0 %	0 %	40 %	60 %	407641186
9	NC_018681	ATGGC	2	10	12909	12918	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_018681	CGCCC	2	10	13130	13139	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
11	NC_018681	CGCCC	2	10	13433	13442	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
12	NC_018681	AGCGG	2	10	16631	16640	20 %	0 %	60 %	20 %	407641190
13	NC_018681	CGGCG	2	10	21630	21639	0 %	0 %	60 %	40 %	407641195
14	NC_018681	GCCAC	2	10	22427	22436	20 %	0 %	20 %	60 %	407641196
15	NC_018681	CGGCG	2	10	25399	25408	0 %	0 %	60 %	40 %	407641201
16	NC_018681	CCGGC	2	10	25933	25942	0 %	0 %	40 %	60 %	407641202
17	NC_018681	GCGCG	2	10	29169	29178	0 %	0 %	60 %	40 %	407641206
18	NC_018681	CGGCG	2	10	29743	29752	0 %	0 %	60 %	40 %	407641206
19	NC_018681	GCGCC	2	10	30583	30592	0 %	0 %	40 %	60 %	407641207
20	NC_018681	TGGCC	2	10	30595	30604	0 %	20 %	40 %	40 %	407641207
21	NC_018681	CGGGC	2	10	30692	30701	0 %	0 %	60 %	40 %	407641207
22	NC_018681	CCCGG	2	10	31193	31202	0 %	0 %	40 %	60 %	407641207
23	NC_018681	GTCGG	2	10	31443	31452	0 %	20 %	60 %	20 %	407641207
24	NC_018681	GCTCG	2	10	32598	32607	0 %	20 %	40 %	40 %	407641208
25	NC_018681	CGGCG	2	10	33164	33173	0 %	0 %	60 %	40 %	407641209
26	NC_018681	CGGCG	2	10	37054	37063	0 %	0 %	60 %	40 %	407641212
27	NC_018681	TCTCT	2	10	38691	38700	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_018681	CGGAT	2	10	39666	39675	20 %	20 %	40 %	20 %	407641214
29	NC_018681	GGGCA	2	10	42092	42101	20 %	0 %	60 %	20 %	407641216
30	NC_018681	CGGCG	2	10	42259	42268	0 %	0 %	60 %	40 %	407641216
31	NC_018681	GGCCG	2	10	43294	43303	0 %	0 %	60 %	40 %	407641217
32	NC_018681	GGCCG	2	10	43731	43740	0 %	0 %	60 %	40 %	407641218
33	NC_018681	CGGCC	2	10	44309	44318	0 %	0 %	40 %	60 %	407641218
34	NC_018681	CGAGG	2	10	45559	45568	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018681	AACCG	2	10	46266	46275	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_018681	CGTGC	2	10	46675	46684	0 %	20 %	40 %	40 %	407641219
37	NC_018681	CGAAT	2	10	46957	46966	40 %	20 %	20 %	20 %	407641219
38	NC_018681	TGAAG	2	10	48182	48191	40 %	20 %	40 %	0 %	407641220
39	NC_018681	GCCGG	2	10	48253	48262	0 %	0 %	60 %	40 %	407641221
40	NC_018681	TGCGC	2	10	49114	49123	0 %	20 %	40 %	40 %	407641221
41	NC_018681	TGCCC	2	10	50010	50019	0 %	20 %	20 %	60 %	407641222
42	NC_018681	CCGGC	2	10	50423	50432	0 %	0 %	40 %	60 %	407641222
43	NC_018681	GCGCC	2	10	51977	51986	0 %	0 %	40 %	60 %	407641224
44	NC_018681	CCAGC	2	10	53085	53094	20 %	0 %	20 %	60 %	407641225
45	NC_018681	GACGA	2	10	53371	53380	40 %	0 %	40 %	20 %	407641225
46	NC_018681	CGACG	2	10	54374	54383	20 %	0 %	40 %	40 %	407641227
47	NC_018681	GCCGG	2	10	55280	55289	0 %	0 %	60 %	40 %	407641227
48	NC_018681	CCTCG	2	10	55679	55688	0 %	20 %	20 %	60 %	407641227
49	NC_018681	CGGCG	2	10	56881	56890	0 %	0 %	60 %	40 %	407641228
50	NC_018681	CGCAG	2	10	57473	57482	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_018681	TGCGC	2	10	57946	57955	0 %	20 %	40 %	40 %	407641229
52	NC_018681	CGCGG	2	10	58511	58520	0 %	0 %	60 %	40 %	407641229
53	NC_018681	CGGTC	2	10	59029	59038	0 %	20 %	40 %	40 %	407641229
54	NC_018681	ATCCG	2	10	59229	59238	20 %	20 %	20 %	40 %	407641229
55	NC_018681	TTCGT	2	10	59727	59736	0 %	60 %	20 %	20 %	407641230
56	NC_018681	CGCGA	2	10	61747	61756	20 %	0 %	40 %	40 %	407641231
57	NC_018681	CGGCC	2	10	62418	62427	0 %	0 %	40 %	60 %	407641231
58	NC_018681	GCTCG	2	10	62847	62856	0 %	20 %	40 %	40 %	407641231
59	NC_018681	CCCGG	2	10	63025	63034	0 %	0 %	40 %	60 %	407641231
60	NC_018681	GCGCG	2	10	63480	63489	0 %	0 %	60 %	40 %	407641231
61	NC_018681	CTCGC	2	10	63949	63958	0 %	20 %	20 %	60 %	407641231
62	NC_018681	ACCCG	2	10	66445	66454	20 %	0 %	20 %	60 %	407641232
63	NC_018681	GCGAC	2	10	67587	67596	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_018681	CCGGC	2	10	72356	72365	0 %	0 %	40 %	60 %	407641237
65	NC_018681	CACGC	2	10	73469	73478	20 %	0 %	20 %	60 %	407641237
66	NC_018681	TGCCC	2	10	74578	74587	0 %	20 %	20 %	60 %	407641239
67	NC_018681	TCGAT	2	10	75478	75487	20 %	40 %	20 %	20 %	407641241
68	NC_018681	CGGCG	2	10	76284	76293	0 %	0 %	60 %	40 %	407641242
69	NC_018681	GGCCG	2	10	76997	77006	0 %	0 %	60 %	40 %	407641243
70	NC_018681	GACGG	2	10	77392	77401	20 %	0 %	60 %	20 %	407641244
71	NC_018681	TCGGT	2	10	77712	77721	0 %	40 %	40 %	20 %	407641244
72	NC_018681	GACCA	2	10	78456	78465	40 %	0 %	20 %	40 %	407641245
73	NC_018681	CGGCG	2	10	78591	78600	0 %	0 %	60 %	40 %	407641246
74	NC_018681	GCCGC	2	10	83389	83398	0 %	0 %	40 %	60 %	407641249
75	NC_018681	GCCGG	2	10	83780	83789	0 %	0 %	60 %	40 %	407641249
76	NC_018681	GGCCG	2	10	85466	85475	0 %	0 %	60 %	40 %	407641251
77	NC_018681	CGGCG	2	10	86950	86959	0 %	0 %	60 %	40 %	407641253
78	NC_018681	CGAGC	2	10	87097	87106	20 %	0 %	40 %	40 %	407641253
79	NC_018681	GAGCG	2	10	88644	88653	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_018681	GTCCG	2	10	89552	89561	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_018681	CCGGG	2	10	90369	90378	0 %	0 %	60 %	40 %	407641257
82	NC_018681	CGTTC	2	10	90809	90818	0 %	40 %	20 %	40 %	407641257
83	NC_018681	GAACC	2	10	91034	91043	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_018681	CCGCG	2	10	91536	91545	0 %	0 %	40 %	60 %	407641258
85	NC_018681	CTGAT	2	10	96039	96048	20 %	40 %	20 %	20 %	407641262
86	NC_018681	GGACC	2	10	96475	96484	20 %	0 %	40 %	40 %	407641263
87	NC_018681	TCGAA	2	10	96609	96618	40 %	20 %	20 %	20 %	407641263
88	NC_018681	TCCGG	2	10	97098	97107	0 %	20 %	40 %	40 %	407641264
89	NC_018681	TGGCG	2	10	97737	97746	0 %	20 %	60 %	20 %	407641264
90	NC_018681	CCGGA	2	10	98259	98268	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_018681	CCGGG	2	10	99254	99263	0 %	0 %	60 %	40 %	407641266
92	NC_018681	GCCCG	2	10	99433	99442	0 %	0 %	40 %	60 %	407641266
93	NC_018681	CTCGC	2	10	102084	102093	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
94	NC_018681	CTAAG	2	10	102115	102124	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_018681	CTCCG	2	10	102554	102563	0 %	20 %	20 %	60 %	407641270
96	NC_018681	CGGCC	2	10	103663	103672	0 %	0 %	40 %	60 %	407641272
97	NC_018681	CACCC	2	10	104272	104281	20 %	0 %	0 %	80 %	407641272
98	NC_018681	CCCGC	2	10	104560	104569	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
99	NC_018681	CCCGC	2	10	105026	105035	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
100	NC_018681	CCGGG	2	10	105676	105685	0 %	0 %	60 %	40 %	407641273
101	NC_018681	GCGCG	2	10	106806	106815	0 %	0 %	60 %	40 %	407641274
102	NC_018681	CGGCA	2	10	107173	107182	20 %	0 %	40 %	40 %	407641274
103	NC_018681	TGTGC	2	10	107288	107297	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_018681	GACTC	2	10	107627	107636	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_018681	CGCAG	2	10	108679	108688	20 %	0 %	40 %	40 %	407641277
106	NC_018681	CGCGC	2	10	109192	109201	0 %	0 %	40 %	60 %	407641277
107	NC_018681	CCGGG	2	10	109408	109417	0 %	0 %	60 %	40 %	407641278
108	NC_018681	GCGCG	2	10	109528	109537	0 %	0 %	60 %	40 %	407641278
109	NC_018681	CGCGA	2	10	110734	110743	20 %	0 %	40 %	40 %	407641278
110	NC_018681	GCGCC	2	10	113826	113835	0 %	0 %	40 %	60 %	407641280
111	NC_018681	AGTGA	2	10	116769	116778	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018681	CCCGC	2	10	116907	116916	0 %	0 %	20 %	80 %	407641283
113	NC_018681	CGGCG	2	10	117555	117564	0 %	0 %	60 %	40 %	407641284
114	NC_018681	GCGCC	2	10	118520	118529	0 %	0 %	40 %	60 %	407641285
115	NC_018681	CCGCG	2	10	118992	119001	0 %	0 %	40 %	60 %	407641285
116	NC_018681	CCGTG	2	10	119011	119020	0 %	20 %	40 %	40 %	407641285
117	NC_018681	CTGTC	2	10	120169	120178	0 %	40 %	20 %	40 %	407641286
118	NC_018681	CAGAT	2	10	121689	121698	40 %	20 %	20 %	20 %	407641288
119	NC_018681	GCGCG	2	10	123367	123376	0 %	0 %	60 %	40 %	407641289
120	NC_018681	CGGCG	2	10	123645	123654	0 %	0 %	60 %	40 %	407641289
121	NC_018681	ACCGC	2	10	124893	124902	20 %	0 %	20 %	60 %	407641291
122	NC_018681	GCCGC	2	10	125343	125352	0 %	0 %	40 %	60 %	407641291
123	NC_018681	GCCGT	2	10	128199	128208	0 %	20 %	40 %	40 %	407641293
124	NC_018681	ACCGT	2	10	129056	129065	20 %	20 %	20 %	40 %	407641294
125	NC_018681	GCGCC	2	10	129534	129543	0 %	0 %	40 %	60 %	407641294
126	NC_018681	CGACC	2	10	131441	131450	20 %	0 %	20 %	60 %	407641296
127	NC_018681	GCGCC	2	10	131651	131660	0 %	0 %	40 %	60 %	407641296
128	NC_018681	CCGCA	2	10	131737	131746	20 %	0 %	20 %	60 %	407641296
129	NC_018681	TGGGC	2	10	132856	132865	0 %	20 %	60 %	20 %	407641297
130	NC_018681	CGAGG	2	10	133405	133414	20 %	0 %	60 %	20 %	407641298
131	NC_018681	AAGTG	2	10	134124	134133	40 %	20 %	40 %	0 %	407641298
132	NC_018681	TCGGC	2	10	137243	137252	0 %	20 %	40 %	40 %	407641300
133	NC_018681	GCGCG	2	10	137766	137775	0 %	0 %	60 %	40 %	407641300
134	NC_018681	CGAGC	2	10	138818	138827	20 %	0 %	40 %	40 %	407641301
135	NC_018681	ATCGA	2	10	139688	139697	40 %	20 %	20 %	20 %	407641302
136	NC_018681	GTCGT	2	10	141756	141765	0 %	40 %	40 %	20 %	407641304
137	NC_018681	GGCCG	2	10	141962	141971	0 %	0 %	60 %	40 %	407641304
138	NC_018681	CCGGC	2	10	143080	143089	0 %	0 %	40 %	60 %	407641304
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240	NC_018681	CGATC	2	10	255018	255027	20 %	20 %	20 %	40 %	407641397
241	NC_018681	GCCGG	2	10	255492	255501	0 %	0 %	60 %	40 %	407641398
242	NC_018681	GCCGG	2	10	256007	256016	0 %	0 %	60 %	40 %	407641398
243	NC_018681	GCGGA	2	10	257833	257842	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
244	NC_018681	GCGTC	2	10	258279	258288	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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261	NC_018681	TCGGC	2	10	278483	278492	0 %	20 %	40 %	40 %	407641421
262	NC_018681	CGAAC	2	10	279310	279319	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
263	NC_018681	CCCGC	2	10	279894	279903	0 %	0 %	20 %	80 %	407641422
264	NC_018681	TGTGG	2	10	281729	281738	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
265	NC_018681	CGTGA	2	10	282280	282289	20 %	20 %	40 %	20 %	407641424
266	NC_018681	ACCGG	2	10	283465	283474	20 %	0 %	40 %	40 %	407641424
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391	NC_018681	CTCGA	2	10	424410	424419	20 %	20 %	20 %	40 %	407641547
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393	NC_018681	GGCCT	2	10	425435	425444	0 %	20 %	40 %	40 %	407641548
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395	NC_018681	CCGAT	2	10	428671	428680	20 %	20 %	20 %	40 %	407641551
396	NC_018681	CACGA	2	10	431801	431810	40 %	0 %	20 %	40 %	407641553
397	NC_018681	ACGGC	2	10	432343	432352	20 %	0 %	40 %	40 %	407641553
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