MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-B-HRs chromosome

Total Repeats: 279

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018677	CTGTTG	4	24	3792	3815	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018677	AGATAA	2	12	4442	4453	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407681638
3	NC_018677	CCTATA	2	12	4563	4574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681638
4	NC_018677	TGCATT	2	12	4842	4853	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407681638
5	NC_018677	ATTAAA	2	12	5544	5555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681638
6	NC_018677	TTCCTG	2	12	6072	6083	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407681639
7	NC_018677	TAAAAA	2	12	6844	6855	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681639
8	NC_018677	TAAATA	2	12	7416	7427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681640
9	NC_018677	AAAATA	2	12	7541	7552	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681640
10	NC_018677	AGATAA	2	12	7992	8003	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407681640
11	NC_018677	CATAAA	2	12	8442	8453	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407681640
12	NC_018677	AAATTA	2	12	9101	9112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681640
13	NC_018677	AACATA	2	12	9284	9295	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407681641
14	NC_018677	ACCTAT	2	12	13149	13160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681645
15	NC_018677	CGATTA	2	12	13249	13260	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407681645
16	NC_018677	TTTTAT	2	12	19564	19575	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407681652
17	NC_018677	TGTAGT	2	12	20457	20468	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018677	TATGTT	2	12	21077	21088	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018677	ACATGA	2	12	21737	21748	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018677	AATTAT	2	12	24291	24302	50 %	50 %	0 %	0 %	407681653
21	NC_018677	CAGATG	2	12	24305	24316	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407681653
22	NC_018677	AGGAAC	4	24	25450	25473	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018677	AGGAAT	2	12	25480	25491	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018677	TGTAAG	2	12	25584	25595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018677	ATTTAC	2	12	26931	26942	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018677	TGCTCT	2	12	28750	28761	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018677	TGCTCT	5	30	28768	28797	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018677	TGTTAT	2	12	28798	28809	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018677	TAAAAT	2	12	30780	30791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018677	ATAAAA	2	12	31352	31363	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681655
31	NC_018677	AACTTT	2	12	33641	33652	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018677	AAAACA	2	12	34309	34320	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018677	CTTTAT	2	12	35138	35149	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407681657
34	NC_018677	TTTTAT	2	12	35283	35294	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407681657
35	NC_018677	GTTAAG	3	18	35630	35647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018677	AAATAT	2	12	36576	36587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681660
37	NC_018677	TCCATC	2	12	39992	40003	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	407681663
38	NC_018677	TAAAGT	2	12	41958	41969	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407681665
39	NC_018677	AAAAAG	2	12	42979	42990	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018677	ACAGCA	2	12	47321	47332	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407681671
41	NC_018677	AGTAAA	2	12	47463	47474	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407681672
42	NC_018677	TTATAG	2	12	48169	48180	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407681673
43	NC_018677	GTAAAA	2	12	48949	48960	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407681674
44	NC_018677	ATTTAT	2	12	50792	50803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681675
45	NC_018677	ATTTTA	2	12	53428	53439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681676
46	NC_018677	CAATAC	2	12	54494	54505	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018677	AACAAA	2	12	55421	55432	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018677	TAGAAA	2	12	58354	58365	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407681678
49	NC_018677	CAAATA	2	12	58753	58764	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407681678
50	NC_018677	TCTACA	2	12	60662	60673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018677	AAATAG	2	12	61932	61943	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018677	ATAAAA	2	12	68720	68731	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681685
53	NC_018677	TTAATA	2	12	70153	70164	50 %	50 %	0 %	0 %	407681686
54	NC_018677	AAAAAT	2	12	72501	72512	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681689
55	NC_018677	AATAGT	2	12	73682	73693	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407681690
56	NC_018677	TATATT	2	12	73958	73969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681690
57	NC_018677	TTAAAA	2	12	78824	78835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681696
58	NC_018677	AAATAA	2	12	79395	79406	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018677	TAAAAA	2	12	80314	80325	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681698
60	NC_018677	TATAAC	2	12	88807	88818	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407681702
61	NC_018677	AAACGG	2	12	88992	89003	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407681702
62	NC_018677	CAGTTC	2	12	89124	89135	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407681702
63	NC_018677	ATGCTA	2	12	89736	89747	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407681702
64	NC_018677	ACAAAC	2	12	96813	96824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681715
65	NC_018677	TAAAAT	2	12	98517	98528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681719
66	NC_018677	AATAGT	2	12	98635	98646	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407681719
67	NC_018677	ATTGGT	2	12	99038	99049	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018677	AGGTAA	2	12	100419	100430	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407681722
69	NC_018677	CAGGAA	2	12	100975	100986	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407681723
70	NC_018677	ATAGAT	2	12	101169	101180	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407681723
71	NC_018677	TAAAAA	2	12	101249	101260	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681723
72	NC_018677	TTGCTA	2	12	103989	104000	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407681728
73	NC_018677	ACTAAT	3	18	106175	106192	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_018677	AAATTA	2	12	107393	107404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681731
75	NC_018677	CGTAAA	2	12	107657	107668	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407681732
76	NC_018677	ACAGGA	2	12	109910	109921	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018677	ATTAAA	2	12	110458	110469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018677	ATAGTA	3	18	112232	112249	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018677	TAGTGG	3	18	112251	112268	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407681735
80	NC_018677	AAACAG	2	12	112693	112704	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407681736
81	NC_018677	ATTTTG	2	12	116058	116069	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407681739
82	NC_018677	TGTTAA	2	12	117144	117155	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018677	GTTAAT	2	12	117458	117469	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018677	AAAACA	10	60	118004	118063	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018677	TAAAAA	3	18	118075	118092	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018677	CTAAAA	3	18	118093	118110	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018677	TAAAAA	2	12	118111	118122	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018677	TAAAAC	3	18	118130	118147	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018677	TAATAC	4	24	118148	118171	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_018677	AAAAAG	2	12	118744	118755	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018677	AAAAGT	2	12	119070	119081	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018677	CTGACA	2	12	119938	119949	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018677	TGAAAT	2	12	122865	122876	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018677	TAATTT	2	12	123034	123045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018677	ATGTAT	2	12	124375	124386	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018677	AAAAAC	2	12	127435	127446	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_018677	AAAAGA	2	12	128303	128314	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407681744
98	NC_018677	AAATGA	2	12	129187	129198	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407681744
99	NC_018677	AAGGTC	2	12	131416	131427	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407681745
100	NC_018677	AGCACA	2	12	132345	132356	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407681746
101	NC_018677	ATAAAA	2	12	133581	133592	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681747
102	NC_018677	AAGGAA	2	12	135958	135969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681749
103	NC_018677	GTTGGG	3	18	135987	136004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407681749
104	NC_018677	AATTTA	2	12	136638	136649	50 %	50 %	0 %	0 %	407681750
105	NC_018677	TTAAAT	2	12	137996	138007	50 %	50 %	0 %	0 %	407681753
106	NC_018677	GAAGAT	2	12	142859	142870	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407681756
107	NC_018677	TTTTAA	2	12	144100	144111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681758
108	NC_018677	ATTTTA	2	12	144879	144890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681758
109	NC_018677	GTGCAG	2	12	145030	145041	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407681758
110	NC_018677	TATAAA	2	12	146699	146710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681760
111	NC_018677	ATTAAA	2	12	147357	147368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681761
112	NC_018677	TAGGAG	2	12	147673	147684	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018677	TTTTTG	2	12	147820	147831	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018677	AACCAC	2	12	147947	147958	50 %	0 %	0 %	50 %	407681762
115	NC_018677	AAACCC	2	12	147995	148006	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018677	ATTACT	2	12	148709	148720	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_018677	GTGGTT	5	30	152068	152097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018677	GTTAGT	3	18	152113	152130	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018677	TTAAAG	2	12	157116	157127	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018677	TACTGT	2	12	157517	157528	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_018677	CTGTTG	3	18	157628	157645	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_018677	TAGCAG	3	18	157920	157937	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_018677	TAAAAA	2	12	158577	158588	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681771
124	NC_018677	CACTTA	2	12	159391	159402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681772
125	NC_018677	TATTTT	2	12	161071	161082	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407681773
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245	NC_018677	TAAAAT	2	12	309848	309859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681878
246	NC_018677	TAAAAT	2	12	310530	310541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681879
247	NC_018677	ATTTAA	2	12	315530	315541	50 %	50 %	0 %	0 %	407681884
248	NC_018677	AAATAA	2	12	316214	316225	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681885
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250	NC_018677	TATCAA	2	12	317475	317486	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407681887
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257	NC_018677	CTTCCC	2	12	323333	323344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
258	NC_018677	ATAACA	2	12	324487	324498	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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261	NC_018677	TACTTT	2	12	325709	325720	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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279	NC_018677	TAGGTG	2	12	351057	351068	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.