MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-QVLC chromosome

Total Repeats: 267

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018676	TAAAGG	2	12	2850	2861	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407681356
2	NC_018676	CTGTTG	4	24	3743	3766	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018676	AGATAA	2	12	4393	4404	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407681357
4	NC_018676	CCTATA	2	12	4514	4525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681357
5	NC_018676	TGCATT	2	12	4793	4804	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407681357
6	NC_018676	ATTAAA	2	12	5495	5506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
7	NC_018676	TTCCTG	2	12	6023	6034	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407681358
8	NC_018676	TAAAAA	2	12	6795	6806	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681358
9	NC_018676	TAAATA	2	12	7367	7378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681359
10	NC_018676	AAAATA	2	12	7492	7503	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681359
11	NC_018676	AGATAA	2	12	7943	7954	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407681359
12	NC_018676	CATAAA	2	12	8393	8404	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407681359
13	NC_018676	AAATTA	2	12	9052	9063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681359
14	NC_018676	AACATA	2	12	9235	9246	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407681360
15	NC_018676	ACCTAT	2	12	13100	13111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681364
16	NC_018676	CGATTA	2	12	13200	13211	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407681364
17	NC_018676	TTTTAT	2	12	19520	19531	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407681371
18	NC_018676	TGTAGT	2	12	20413	20424	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018676	ACATGA	2	12	21687	21698	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018676	AATTAT	2	12	24241	24252	50 %	50 %	0 %	0 %	407681372
21	NC_018676	CAGATG	2	12	24255	24266	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407681372
22	NC_018676	AGGAAC	3	18	25400	25417	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018676	AGGAAT	2	12	25418	25429	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018676	TGTAAG	2	12	25522	25533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018676	ATTTAC	2	12	26869	26880	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018676	TGCTCT	4	24	28700	28723	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018676	TGTTAT	2	12	28724	28735	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018676	TAAAAT	2	12	30685	30696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018676	ATAAAA	2	12	31257	31268	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681374
30	NC_018676	AACTTT	2	12	33546	33557	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018676	AAAACA	2	12	34151	34162	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018676	CTTTAT	2	12	34980	34991	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407681376
33	NC_018676	TTTTAT	2	12	35125	35136	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407681376
34	NC_018676	ACGTTA	2	12	35470	35481	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018676	AAATAT	2	12	36418	36429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681379
36	NC_018676	TCCATC	2	12	39834	39845	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	407681382
37	NC_018676	TAAAGT	2	12	41800	41811	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407681384
38	NC_018676	AAAAAG	2	12	42688	42699	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018676	ACAGCA	2	12	46905	46916	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407681389
40	NC_018676	AGTAAA	2	12	47047	47058	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407681390
41	NC_018676	TTATAG	2	12	47753	47764	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407681391
42	NC_018676	GTAAAA	2	12	48533	48544	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407681392
43	NC_018676	ATTTAT	2	12	50376	50387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681393
44	NC_018676	ATTTTA	2	12	53012	53023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681394
45	NC_018676	CAATAC	2	12	54077	54088	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018676	TTAAGC	2	12	54166	54177	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018676	CTCTAA	2	12	54828	54839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018676	AACAAA	3	18	55015	55032	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018676	TAGAAA	2	12	57954	57965	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407681396
50	NC_018676	CAAATA	2	12	58353	58364	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407681396
51	NC_018676	TCTACA	2	12	60270	60281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018676	TAAACA	2	12	61528	61539	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018676	ATAAAA	2	12	68303	68314	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681403
54	NC_018676	TTAATA	2	12	69736	69747	50 %	50 %	0 %	0 %	407681404
55	NC_018676	AAAAAT	2	12	72084	72095	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681407
56	NC_018676	AATAGT	2	12	73265	73276	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407681408
57	NC_018676	TATATT	2	12	73541	73552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681408
58	NC_018676	TTAAAA	2	12	78735	78746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681414
59	NC_018676	AAATAA	2	12	79306	79317	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018676	TAAAAA	2	12	80225	80236	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681416
61	NC_018676	AAAACC	2	12	87711	87722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681418
62	NC_018676	TATAAC	2	12	88718	88729	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407681420
63	NC_018676	AAACGG	2	12	88903	88914	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407681420
64	NC_018676	CAGTTC	2	12	89035	89046	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407681420
65	NC_018676	ATGCTA	2	12	89647	89658	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407681420
66	NC_018676	ACAAAC	2	12	96725	96736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681433
67	NC_018676	TAAAAT	2	12	98429	98440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681437
68	NC_018676	AATAGT	2	12	98547	98558	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407681437
69	NC_018676	ATTGGT	2	12	98950	98961	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018676	AGGTAA	2	12	100331	100342	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407681440
71	NC_018676	CAGGAA	2	12	100887	100898	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407681441
72	NC_018676	ATAGAT	2	12	101081	101092	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407681441
73	NC_018676	TAAAAA	2	12	101161	101172	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681441
74	NC_018676	TTGCTA	2	12	103901	103912	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407681446
75	NC_018676	ACTAAT	2	12	106094	106105	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018676	AAATTA	2	12	107305	107316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681449
77	NC_018676	CGTAAA	2	12	107569	107580	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407681450
78	NC_018676	ACAGGA	2	12	109822	109833	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407681453
79	NC_018676	ATTAAA	2	12	110371	110382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681453
80	NC_018676	TAGTGG	3	18	112152	112169	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018676	TTAAGG	2	12	112170	112181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018676	AAACAG	2	12	112600	112611	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407681454
83	NC_018676	ATTTTG	2	12	115965	115976	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407681457
84	NC_018676	TGTTAA	2	12	117044	117055	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018676	GTTAAT	2	12	117358	117369	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018676	ATAAAA	2	12	117993	118004	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018676	CTAAAA	2	12	118005	118016	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_018676	CTAATA	2	12	118017	118028	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018676	AAAAGT	2	12	118934	118945	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018676	CTGACA	2	12	119801	119812	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018676	TGAAAT	2	12	122728	122739	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018676	TAATTT	2	12	122897	122908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018676	ATGTAT	2	12	124281	124292	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018676	AAAAAC	2	12	127237	127248	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_018676	AAAAGA	2	12	128105	128116	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407681463
96	NC_018676	AAATGA	2	12	128989	129000	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407681463
97	NC_018676	AAGGTC	2	12	131218	131229	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407681464
98	NC_018676	ATAAAA	2	12	133377	133388	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681466
99	NC_018676	AAGGAA	2	12	135754	135765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681468
100	NC_018676	GTTGGG	4	24	135790	135813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407681468
101	NC_018676	AATTTA	2	12	136503	136514	50 %	50 %	0 %	0 %	407681469
102	NC_018676	TTAAAT	2	12	137862	137873	50 %	50 %	0 %	0 %	407681472
103	NC_018676	GAAGAT	2	12	142739	142750	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407681475
104	NC_018676	TTTTAA	2	12	143980	143991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681477
105	NC_018676	ATTTTA	2	12	144759	144770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681477
106	NC_018676	GTGCAG	2	12	144910	144921	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407681477
107	NC_018676	TATAAA	2	12	146579	146590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681479
108	NC_018676	ATTAAA	2	12	147237	147248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681480
109	NC_018676	TAGGAG	2	12	147553	147564	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018676	TTTTTG	2	12	147700	147711	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018676	AACCAC	2	12	147827	147838	50 %	0 %	0 %	50 %	407681481
112	NC_018676	AAACCC	2	12	147881	147892	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_018676	ATTACT	2	12	148550	148561	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_018676	GGTTGT	4	24	152065	152088	0 %	50 %	50 %	0 %	407681485
115	NC_018676	TTAAAG	2	12	157068	157079	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018676	TACTGT	2	12	157468	157479	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_018676	CTGTTG	4	24	157579	157602	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_018676	TAGCAG	4	24	157870	157893	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_018676	TAAAAA	2	12	158533	158544	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681491
120	NC_018676	CACTTA	2	12	159347	159358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681492
121	NC_018676	TATTTT	2	12	161027	161038	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407681493
122	NC_018676	GTTAGT	3	18	164425	164442	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018676	AAAGAA	2	12	166167	166178	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018676	CTTTTA	2	12	167194	167205	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407681495
125	NC_018676	ATAACA	2	12	168237	168248	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407681496
126	NC_018676	TTTATA	2	12	168567	168578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681496
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128	NC_018676	CTTTTA	2	12	170746	170757	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407681498
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133	NC_018676	TATTAG	3	18	173459	173476	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_018676	TTTGGG	2	12	316925	316936	0 %	50 %	50 %	0 %	407681609
242	NC_018676	TATCAA	2	12	317063	317074	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407681609
243	NC_018676	AGGTTT	2	12	319276	319287	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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245	NC_018676	GTAAAC	2	12	319699	319710	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
246	NC_018676	GATATG	2	12	321152	321163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681611
247	NC_018676	TCCCCT	4	24	322805	322828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407681612
248	NC_018676	ATAACA	2	12	323979	323990	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
249	NC_018676	TACAAA	2	12	324086	324097	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
250	NC_018676	TTTTAA	2	12	324876	324887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_018676	TACTTT	2	12	325186	325197	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
252	NC_018676	CAAATA	2	12	326369	326380	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407681614
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258	NC_018676	TGAATT	2	12	334016	334027	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
259	NC_018676	TCTTGT	2	12	337609	337620	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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264	NC_018676	CATGCT	2	12	340808	340819	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407681626
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267	NC_018676	TAGGAG	2	12	350322	350333	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.