MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-QVLC chromosome

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018676	CTGTTG	4	24	3743	3766	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018676	TGTAGT	2	12	20413	20424	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018676	ACATGA	2	12	21687	21698	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018676	AGGAAC	3	18	25400	25417	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018676	AGGAAT	2	12	25418	25429	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018676	TGTAAG	2	12	25522	25533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018676	ATTTAC	2	12	26869	26880	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018676	TGCTCT	4	24	28700	28723	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018676	TGTTAT	2	12	28724	28735	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018676	TAAAAT	2	12	30685	30696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018676	AACTTT	2	12	33546	33557	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018676	AAAACA	2	12	34151	34162	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018676	ACGTTA	2	12	35470	35481	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018676	AAAAAG	2	12	42688	42699	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018676	CAATAC	2	12	54077	54088	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018676	TTAAGC	2	12	54166	54177	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018676	CTCTAA	2	12	54828	54839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018676	AACAAA	3	18	55015	55032	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018676	TCTACA	2	12	60270	60281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018676	TAAACA	2	12	61528	61539	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018676	AAATAA	2	12	79306	79317	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018676	ATTGGT	2	12	98950	98961	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018676	ACTAAT	2	12	106094	106105	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018676	TAGTGG	3	18	112152	112169	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018676	TTAAGG	2	12	112170	112181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018676	TGTTAA	2	12	117044	117055	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018676	GTTAAT	2	12	117358	117369	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018676	ATAAAA	2	12	117993	118004	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018676	CTAAAA	2	12	118005	118016	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018676	CTAATA	2	12	118017	118028	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018676	AAAAGT	2	12	118934	118945	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018676	CTGACA	2	12	119801	119812	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018676	TGAAAT	2	12	122728	122739	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018676	TAATTT	2	12	122897	122908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018676	ATGTAT	2	12	124281	124292	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018676	AAAAAC	2	12	127237	127248	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018676	TAGGAG	2	12	147553	147564	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018676	TTTTTG	2	12	147700	147711	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018676	AAACCC	2	12	147881	147892	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018676	ATTACT	2	12	148550	148561	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018676	TTAAAG	2	12	157068	157079	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018676	TACTGT	2	12	157468	157479	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018676	CTGTTG	4	24	157579	157602	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018676	TAGCAG	4	24	157870	157893	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018676	GTTAGT	3	18	164425	164442	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018676	AAAGAA	2	12	166167	166178	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018676	ATTTGT	2	12	173210	173221	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018676	TATTAG	3	18	173459	173476	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018676	ACAGTT	4	24	173557	173580	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018676	GCCGTT	3	18	173581	173598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018676	TTTAGT	2	12	182077	182088	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018676	CTGTTT	2	12	182401	182412	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018676	TTTGTT	2	12	182767	182778	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018676	TTTATT	2	12	185558	185569	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018676	ACTGTT	2	12	185575	185586	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_018676	CATTAG	2	12	222113	222124	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018676	TTTAAA	2	12	226836	226847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018676	ATAACA	2	12	228452	228463	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018676	GGTGTT	2	12	234667	234678	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018676	TTATTT	2	12	237216	237227	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018676	TTTTAT	2	12	237344	237355	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018676	TTATAT	2	12	240127	240138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018676	TGTTAT	3	18	240139	240156	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018676	TTTTTA	2	12	240435	240446	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018676	GTTTTT	2	12	241999	242010	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018676	TTTTAG	2	12	245923	245934	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018676	TTTTGT	2	12	245947	245958	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018676	AGTTGT	2	12	251721	251732	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018676	GATGTT	2	12	252248	252259	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018676	ATTTAA	2	12	256629	256640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018676	TAACCG	3	18	257045	257062	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018676	GAATTT	2	12	259301	259312	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018676	ATTTAT	2	12	268228	268239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018676	AACAAA	2	12	269134	269145	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_018676	TTTTCT	2	12	269431	269442	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018676	TAATTA	2	12	269928	269939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018676	AAAAAG	2	12	270294	270305	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018676	TTATTT	2	12	271925	271936	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018676	GTTATT	2	12	272386	272397	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018676	GATTTT	2	12	273222	273233	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018676	ATCTTT	3	18	273234	273251	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_018676	ATTGTT	2	12	273252	273263	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018676	TTTTTA	2	12	273341	273352	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018676	TAAATG	2	12	273484	273495	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018676	TTTTAT	2	12	277033	277044	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018676	GAATTA	2	12	281771	281782	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018676	TTTTTA	2	12	282773	282784	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018676	ATGTTA	2	12	283193	283204	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018676	AGGTTT	2	12	319276	319287	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018676	ACAGAA	2	12	319675	319686	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018676	GTAAAC	2	12	319699	319710	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018676	ATAACA	2	12	323979	323990	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_018676	TACAAA	2	12	324086	324097	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_018676	TTTTAA	2	12	324876	324887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018676	TACTTT	2	12	325186	325197	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018676	ACCTAT	2	12	330395	330406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018676	TGAATT	2	12	334016	334027	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018676	TCTTGT	2	12	337609	337620	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_018676	AGTGTT	2	12	348718	348729	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018676	TAGCAG	2	12	350310	350321	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_018676	TAGGAG	2	12	350322	350333	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.