MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-QVLC chromosome

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018676	TAAAGG	2	12	2850	2861	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407681356
2	NC_018676	AGATAA	2	12	4393	4404	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407681357
3	NC_018676	CCTATA	2	12	4514	4525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681357
4	NC_018676	TGCATT	2	12	4793	4804	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407681357
5	NC_018676	ATTAAA	2	12	5495	5506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
6	NC_018676	TTCCTG	2	12	6023	6034	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407681358
7	NC_018676	TAAAAA	2	12	6795	6806	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681358
8	NC_018676	TAAATA	2	12	7367	7378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681359
9	NC_018676	AAAATA	2	12	7492	7503	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681359
10	NC_018676	AGATAA	2	12	7943	7954	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407681359
11	NC_018676	CATAAA	2	12	8393	8404	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407681359
12	NC_018676	AAATTA	2	12	9052	9063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681359
13	NC_018676	AACATA	2	12	9235	9246	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407681360
14	NC_018676	ACCTAT	2	12	13100	13111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681364
15	NC_018676	CGATTA	2	12	13200	13211	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407681364
16	NC_018676	TTTTAT	2	12	19520	19531	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407681371
17	NC_018676	AATTAT	2	12	24241	24252	50 %	50 %	0 %	0 %	407681372
18	NC_018676	CAGATG	2	12	24255	24266	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407681372
19	NC_018676	ATAAAA	2	12	31257	31268	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681374
20	NC_018676	CTTTAT	2	12	34980	34991	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407681376
21	NC_018676	TTTTAT	2	12	35125	35136	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407681376
22	NC_018676	AAATAT	2	12	36418	36429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681379
23	NC_018676	TCCATC	2	12	39834	39845	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	407681382
24	NC_018676	TAAAGT	2	12	41800	41811	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407681384
25	NC_018676	ACAGCA	2	12	46905	46916	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407681389
26	NC_018676	AGTAAA	2	12	47047	47058	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407681390
27	NC_018676	TTATAG	2	12	47753	47764	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407681391
28	NC_018676	GTAAAA	2	12	48533	48544	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407681392
29	NC_018676	ATTTAT	2	12	50376	50387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681393
30	NC_018676	ATTTTA	2	12	53012	53023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681394
31	NC_018676	TAGAAA	2	12	57954	57965	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407681396
32	NC_018676	CAAATA	2	12	58353	58364	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407681396
33	NC_018676	ATAAAA	2	12	68303	68314	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681403
34	NC_018676	TTAATA	2	12	69736	69747	50 %	50 %	0 %	0 %	407681404
35	NC_018676	AAAAAT	2	12	72084	72095	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681407
36	NC_018676	AATAGT	2	12	73265	73276	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407681408
37	NC_018676	TATATT	2	12	73541	73552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681408
38	NC_018676	TTAAAA	2	12	78735	78746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681414
39	NC_018676	TAAAAA	2	12	80225	80236	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681416
40	NC_018676	AAAACC	2	12	87711	87722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681418
41	NC_018676	TATAAC	2	12	88718	88729	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407681420
42	NC_018676	AAACGG	2	12	88903	88914	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407681420
43	NC_018676	CAGTTC	2	12	89035	89046	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407681420
44	NC_018676	ATGCTA	2	12	89647	89658	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407681420
45	NC_018676	ACAAAC	2	12	96725	96736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681433
46	NC_018676	TAAAAT	2	12	98429	98440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681437
47	NC_018676	AATAGT	2	12	98547	98558	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407681437
48	NC_018676	AGGTAA	2	12	100331	100342	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407681440
49	NC_018676	CAGGAA	2	12	100887	100898	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407681441
50	NC_018676	ATAGAT	2	12	101081	101092	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407681441
51	NC_018676	TAAAAA	2	12	101161	101172	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681441
52	NC_018676	TTGCTA	2	12	103901	103912	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407681446
53	NC_018676	AAATTA	2	12	107305	107316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681449
54	NC_018676	CGTAAA	2	12	107569	107580	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407681450
55	NC_018676	ACAGGA	2	12	109822	109833	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407681453
56	NC_018676	ATTAAA	2	12	110371	110382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681453
57	NC_018676	AAACAG	2	12	112600	112611	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407681454
58	NC_018676	ATTTTG	2	12	115965	115976	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407681457
59	NC_018676	AAAAGA	2	12	128105	128116	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407681463
60	NC_018676	AAATGA	2	12	128989	129000	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407681463
61	NC_018676	AAGGTC	2	12	131218	131229	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407681464
62	NC_018676	ATAAAA	2	12	133377	133388	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681466
63	NC_018676	AAGGAA	2	12	135754	135765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681468
64	NC_018676	GTTGGG	4	24	135790	135813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407681468
65	NC_018676	AATTTA	2	12	136503	136514	50 %	50 %	0 %	0 %	407681469
66	NC_018676	TTAAAT	2	12	137862	137873	50 %	50 %	0 %	0 %	407681472
67	NC_018676	GAAGAT	2	12	142739	142750	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407681475
68	NC_018676	TTTTAA	2	12	143980	143991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681477
69	NC_018676	ATTTTA	2	12	144759	144770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681477
70	NC_018676	GTGCAG	2	12	144910	144921	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407681477
71	NC_018676	TATAAA	2	12	146579	146590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681479
72	NC_018676	ATTAAA	2	12	147237	147248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681480
73	NC_018676	AACCAC	2	12	147827	147838	50 %	0 %	0 %	50 %	407681481
74	NC_018676	GGTTGT	4	24	152065	152088	0 %	50 %	50 %	0 %	407681485
75	NC_018676	TAAAAA	2	12	158533	158544	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681491
76	NC_018676	CACTTA	2	12	159347	159358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681492
77	NC_018676	TATTTT	2	12	161027	161038	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407681493
78	NC_018676	CTTTTA	2	12	167194	167205	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407681495
79	NC_018676	ATAACA	2	12	168237	168248	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407681496
80	NC_018676	TTTATA	2	12	168567	168578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681496
81	NC_018676	ATTTTA	2	12	168765	168776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681496
82	NC_018676	CTTTTA	2	12	170746	170757	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407681498
83	NC_018676	CATCTT	2	12	171412	171423	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407681498
84	NC_018676	TAACTT	2	12	171827	171838	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407681498
85	NC_018676	TGTTTT	2	12	171954	171965	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407681498
86	NC_018676	ATTTAA	2	12	173986	173997	50 %	50 %	0 %	0 %	407681499
87	NC_018676	TTGTTT	2	12	175246	175257	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407681499
88	NC_018676	AACCTG	2	12	176502	176513	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407681500
89	NC_018676	TTTACA	2	12	177675	177686	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407681501
90	NC_018676	TTAATG	2	12	177724	177735	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407681501
91	NC_018676	TTTTGT	2	12	184347	184358	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407681504
92	NC_018676	CAAAAT	2	12	185152	185163	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407681504
93	NC_018676	AGAAGT	2	12	187809	187820	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407681505
94	NC_018676	ATTTAT	2	12	188793	188804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681507
95	NC_018676	TTTGTT	2	12	197560	197571	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407681516
96	NC_018676	ATAAAC	2	12	202394	202405	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407681519
97	NC_018676	TTATAT	2	12	202956	202967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681520
98	NC_018676	ATTTAT	2	12	209350	209361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681524
99	NC_018676	GGTTTA	2	12	211810	211821	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407681526
100	NC_018676	TTTAAT	2	12	212226	212237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681526
101	NC_018676	GTTTTG	2	12	212330	212341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407681526
102	NC_018676	ATGTTA	2	12	213240	213251	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407681527
103	NC_018676	TTTATA	2	12	213678	213689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681527
104	NC_018676	CAAAAA	2	12	215414	215425	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	407681530
105	NC_018676	ATTTAT	2	12	217174	217185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681531
106	NC_018676	AATAGA	2	12	217988	217999	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407681531
107	NC_018676	GCAAAT	2	12	219834	219845	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407681533
108	NC_018676	AGGCGG	2	12	220275	220286	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	407681533
109	NC_018676	GAAAAA	2	12	220699	220710	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407681533
110	NC_018676	AAATTA	2	12	222717	222728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681534
111	NC_018676	TAAAAA	2	12	223309	223320	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681535
112	NC_018676	TTGTTT	2	12	230838	230849	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407681540
113	NC_018676	TTTTTA	2	12	233010	233021	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407681544
114	NC_018676	TTTACC	2	12	236212	236223	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407681548
115	NC_018676	TAAAAA	2	12	236719	236730	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407681548
116	NC_018676	TATAAA	2	12	239043	239054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681550
117	NC_018676	TTTTTA	2	12	239236	239247	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407681550
118	NC_018676	GCTAAT	2	12	244449	244460	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407681552
119	NC_018676	AAGTTT	2	12	246160	246171	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407681556
120	NC_018676	AGAACC	2	12	246450	246461	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407681556
121	NC_018676	CTAAAG	2	12	248397	248408	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407681557
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.