MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-QVLC chromosome

Total Repeats: 5614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018676	TAC	2	6	30	35	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681355
2	NC_018676	TAC	2	6	102	107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681355
3	NC_018676	TGA	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681355
4	NC_018676	ATG	2	6	233	238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681355
5	NC_018676	CAG	2	6	377	382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407681355
6	NC_018676	ATT	2	6	386	391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681355
7	NC_018676	TAA	2	6	416	421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681355
8	NC_018676	CTA	2	6	458	463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681355
9	NC_018676	GCT	3	9	520	528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681355
10	NC_018676	GGT	2	6	586	591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407681355
11	NC_018676	AGG	2	6	681	686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407681355
12	NC_018676	AGA	2	6	687	692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
13	NC_018676	TAA	2	6	707	712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681355
14	NC_018676	AGC	2	6	792	797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407681355
15	NC_018676	CAA	2	6	829	834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681355
16	NC_018676	CTG	2	6	860	865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681355
17	NC_018676	TAA	2	6	935	940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681355
18	NC_018676	ACT	2	6	988	993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681355
19	NC_018676	GAT	2	6	1003	1008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681355
20	NC_018676	ATA	2	6	1009	1014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681355
21	NC_018676	GGT	2	6	1021	1026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407681355
22	NC_018676	AAG	2	6	1076	1081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
23	NC_018676	AGG	2	6	1134	1139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407681355
24	NC_018676	GGT	2	6	1213	1218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407681355
25	NC_018676	TAC	2	6	1245	1250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681355
26	NC_018676	CTA	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681355
27	NC_018676	CAG	2	6	1283	1288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407681355
28	NC_018676	CTC	2	6	1394	1399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407681355
29	NC_018676	TAA	2	6	1496	1501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681355
30	NC_018676	GGT	2	6	1513	1518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407681355
31	NC_018676	AGA	2	6	1524	1529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
32	NC_018676	GAT	2	6	1542	1547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681355
33	NC_018676	AGA	3	9	1569	1577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
34	NC_018676	GAA	2	6	1588	1593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
35	NC_018676	TGA	2	6	1725	1730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681355
36	NC_018676	AGA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
37	NC_018676	TAA	2	6	1755	1760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681355
38	NC_018676	GAA	2	6	1768	1773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
39	NC_018676	TCT	2	6	1858	1863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407681355
40	NC_018676	TGT	2	6	1881	1886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407681355
41	NC_018676	GAA	2	6	1900	1905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
42	NC_018676	TAA	3	9	1908	1916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681355
43	NC_018676	ATT	2	6	1955	1960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681356
44	NC_018676	TAA	2	6	1977	1982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681356
45	NC_018676	CTG	2	6	1985	1990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681356
46	NC_018676	ATC	2	6	2036	2041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681356
47	NC_018676	AAT	2	6	2179	2184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681356
48	NC_018676	TAA	2	6	2241	2246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681356
49	NC_018676	CAA	4	12	2247	2258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681356
50	NC_018676	ACA	2	6	2469	2474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681356
51	NC_018676	TGC	2	6	2751	2756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681356
52	NC_018676	AGG	2	6	2760	2765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407681356
53	NC_018676	GTA	2	6	2876	2881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681356
54	NC_018676	ATT	2	6	2952	2957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681356
55	NC_018676	TGT	2	6	3004	3009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018676	TCT	2	6	3062	3067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018676	GTT	2	6	3073	3078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018676	TTA	3	9	3161	3169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018676	GTT	2	6	3170	3175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018676	TGT	2	6	3282	3287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018676	AGT	2	6	3309	3314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018676	ATA	2	6	3335	3340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018676	ATG	2	6	3342	3347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018676	TGT	2	6	3400	3405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018676	ATT	2	6	3412	3417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018676	TTA	2	6	3545	3550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018676	TAT	2	6	3645	3650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018676	TTA	2	6	3651	3656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018676	GTT	2	6	3727	3732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018676	TAT	2	6	3817	3822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018676	TTA	3	9	3823	3831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018676	GTT	2	6	3862	3867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018676	GTA	2	6	3899	3904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018676	TAT	2	6	3927	3932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018676	TAA	3	9	3952	3960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018676	AAC	2	6	3964	3969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018676	CAA	2	6	3983	3988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018676	TAA	2	6	4025	4030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018676	ACA	2	6	4031	4036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018676	AAC	2	6	4067	4072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018676	TAA	2	6	4088	4093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018676	ACA	2	6	4094	4099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018676	TAC	2	6	4126	4131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018676	AAC	2	6	4191	4196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018676	TTA	2	6	4341	4346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
86	NC_018676	ATA	2	6	4411	4416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
87	NC_018676	GTT	2	6	4443	4448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407681357
88	NC_018676	ATT	2	6	4478	4483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
89	NC_018676	ATA	3	9	4489	4497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
90	NC_018676	CTG	2	6	4593	4598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681357
91	NC_018676	AAC	2	6	4622	4627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681357
92	NC_018676	ATT	2	6	4696	4701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
93	NC_018676	GTT	2	6	4733	4738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407681357
94	NC_018676	TAA	2	6	4750	4755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
95	NC_018676	ATT	2	6	4808	4813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
96	NC_018676	ATT	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
97	NC_018676	ATT	2	6	4936	4941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
98	NC_018676	TAT	2	6	5131	5136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
99	NC_018676	AGT	2	6	5146	5151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681357
100	NC_018676	ATC	2	6	5155	5160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681357
101	NC_018676	ATA	2	6	5170	5175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
102	NC_018676	ATA	2	6	5197	5202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
103	NC_018676	ATA	2	6	5208	5213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
104	NC_018676	AGA	2	6	5248	5253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681357
105	NC_018676	TTA	2	6	5322	5327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
106	NC_018676	TAA	2	6	5395	5400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
107	NC_018676	ATT	2	6	5423	5428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
108	NC_018676	CTT	2	6	5439	5444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407681357
109	NC_018676	AAT	2	6	5523	5528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
110	NC_018676	ATT	2	6	5537	5542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
111	NC_018676	ATA	2	6	5580	5585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
112	NC_018676	TAA	2	6	5593	5598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
113	NC_018676	TAT	2	6	5602	5607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
114	NC_018676	TTA	2	6	5610	5615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
115	NC_018676	TAA	2	6	5652	5657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
116	NC_018676	ATT	2	6	5663	5668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
117	NC_018676	TAA	2	6	5722	5727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681358
118	NC_018676	ATT	2	6	5782	5787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681358
119	NC_018676	TAA	2	6	5804	5809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681358
120	NC_018676	ATA	2	6	5895	5900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681358
121	NC_018676	TAA	2	6	5994	5999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681358
122	NC_018676	TCC	2	6	6102	6107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407681358
123	NC_018676	TTA	4	12	6155	6166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681358
124	NC_018676	ATA	2	6	6330	6335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681358
125	NC_018676	ATA	2	6	6343	6348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681358
126	NC_018676	TAA	2	6	6414	6419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681358
127	NC_018676	GCT	2	6	6427	6432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681358
128	NC_018676	TAA	2	6	6561	6566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681358
129	NC_018676	TTA	2	6	6668	6673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681358
130	NC_018676	ATT	2	6	6778	6783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681358
131	NC_018676	AAT	2	6	6831	6836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681358
132	NC_018676	CAA	2	6	6852	6857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681358
133	NC_018676	TTA	2	6	6883	6888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681358
134	NC_018676	TAC	2	6	6927	6932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681358
135	NC_018676	TAA	2	6	6936	6941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681358
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139	NC_018676	CAA	2	6	7231	7236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681359
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153	NC_018676	TTA	2	6	7719	7724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681359
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