MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Leuconostoc carnosum JB16 plasmid pKLC3

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018675	ATTA	2	8	173	180	50 %	50 %	0 %	0 %	407719084
2	NC_018675	TTCA	2	8	678	685	25 %	50 %	0 %	25 %	407719084
3	NC_018675	AAAC	2	8	1214	1221	75 %	0 %	0 %	25 %	407719085
4	NC_018675	TAAT	2	8	1399	1406	50 %	50 %	0 %	0 %	407719085
5	NC_018675	ATGA	2	8	1996	2003	50 %	25 %	25 %	0 %	407719086
6	NC_018675	CGAA	2	8	2015	2022	50 %	0 %	25 %	25 %	407719086
7	NC_018675	CAAT	2	8	2448	2455	50 %	25 %	0 %	25 %	407719087
8	NC_018675	ATTT	2	8	2527	2534	25 %	75 %	0 %	0 %	407719087
9	NC_018675	GTAT	2	8	3203	3210	25 %	50 %	25 %	0 %	407719088
10	NC_018675	TTTA	2	8	3677	3684	25 %	75 %	0 %	0 %	407719088
11	NC_018675	ATTT	2	8	3773	3780	25 %	75 %	0 %	0 %	407719088
12	NC_018675	TTTG	2	8	3891	3898	0 %	75 %	25 %	0 %	407719088
13	NC_018675	AAAT	2	8	4373	4380	75 %	25 %	0 %	0 %	407719088
14	NC_018675	AATA	2	8	4482	4489	75 %	25 %	0 %	0 %	407719088
15	NC_018675	AGAA	2	8	4568	4575	75 %	0 %	25 %	0 %	407719088
16	NC_018675	AACT	2	8	5003	5010	50 %	25 %	0 %	25 %	407719088
17	NC_018675	TCCT	2	8	5724	5731	0 %	50 %	0 %	50 %	407719089
18	NC_018675	ATTT	2	8	5820	5827	25 %	75 %	0 %	0 %	407719089
19	NC_018675	TGAT	2	8	7027	7034	25 %	50 %	25 %	0 %	407719091
20	NC_018675	GTTT	2	8	7160	7167	0 %	75 %	25 %	0 %	407719091
21	NC_018675	TAGT	2	8	7295	7302	25 %	50 %	25 %	0 %	407719091
22	NC_018675	CGTT	2	8	7424	7431	0 %	50 %	25 %	25 %	407719091
23	NC_018675	TATT	2	8	7751	7758	25 %	75 %	0 %	0 %	407719092
24	NC_018675	TTGT	2	8	10034	10041	0 %	75 %	25 %	0 %	407719094
25	NC_018675	ATAA	2	8	10166	10173	75 %	25 %	0 %	0 %	407719094
26	NC_018675	GCCA	2	8	10233	10240	25 %	0 %	25 %	50 %	407719094
27	NC_018675	CATT	2	8	10384	10391	25 %	50 %	0 %	25 %	407719094
28	NC_018675	AATT	2	8	10587	10594	50 %	50 %	0 %	0 %	407719094
29	NC_018675	TTGA	2	8	12274	12281	25 %	50 %	25 %	0 %	407719098
30	NC_018675	TATG	2	8	12552	12559	25 %	50 %	25 %	0 %	407719098
31	NC_018675	GTGA	2	8	12652	12659	25 %	25 %	50 %	0 %	407719098
32	NC_018675	TAAG	2	8	12888	12895	50 %	25 %	25 %	0 %	407719098
33	NC_018675	TTGG	2	8	13107	13114	0 %	50 %	50 %	0 %	407719099
34	NC_018675	TTTA	2	8	13142	13149	25 %	75 %	0 %	0 %	407719099
35	NC_018675	GGTT	2	8	13409	13416	0 %	50 %	50 %	0 %	407719100
36	NC_018675	GGAC	2	8	13436	13443	25 %	0 %	50 %	25 %	407719100
37	NC_018675	GTTT	2	8	13991	13998	0 %	75 %	25 %	0 %	407719100
38	NC_018675	TAGT	2	8	14442	14449	25 %	50 %	25 %	0 %	407719100
39	NC_018675	TTGG	2	8	15392	15399	0 %	50 %	50 %	0 %	407719102
40	NC_018675	TTAA	2	8	15441	15448	50 %	50 %	0 %	0 %	407719102
41	NC_018675	ATTT	2	8	15834	15841	25 %	75 %	0 %	0 %	407719102
42	NC_018675	ACCT	2	8	16336	16343	25 %	25 %	0 %	50 %	407719102
43	NC_018675	AACA	2	8	16579	16586	75 %	0 %	0 %	25 %	407719103
44	NC_018675	TCAA	2	8	16698	16705	50 %	25 %	0 %	25 %	407719104
45	NC_018675	AAGC	2	8	18592	18599	50 %	0 %	25 %	25 %	407719107
46	NC_018675	CAAT	2	8	18715	18722	50 %	25 %	0 %	25 %	407719107
47	NC_018675	ATCA	2	8	19204	19211	50 %	25 %	0 %	25 %	407719107
48	NC_018675	GCTG	2	8	20746	20753	0 %	25 %	50 %	25 %	407719110
49	NC_018675	TGAT	2	8	20973	20980	25 %	50 %	25 %	0 %	407719110
50	NC_018675	AGTG	2	8	20989	20996	25 %	25 %	50 %	0 %	407719110
51	NC_018675	ATTT	2	8	21084	21091	25 %	75 %	0 %	0 %	407719110
52	NC_018675	TGAT	2	8	21975	21982	25 %	50 %	25 %	0 %	407719110
53	NC_018675	GTTT	2	8	23264	23271	0 %	75 %	25 %	0 %	407719112
54	NC_018675	GTTA	2	8	23327	23334	25 %	50 %	25 %	0 %	407719112
55	NC_018675	AAAG	2	8	24050	24057	75 %	0 %	25 %	0 %	407719112
56	NC_018675	GTTT	2	8	24299	24306	0 %	75 %	25 %	0 %	407719112
57	NC_018675	GTTA	2	8	24552	24559	25 %	50 %	25 %	0 %	407719112
58	NC_018675	AAAC	2	8	24716	24723	75 %	0 %	0 %	25 %	407719112
59	NC_018675	CAGT	2	8	25250	25257	25 %	25 %	25 %	25 %	407719112
60	NC_018675	ATCA	2	8	25836	25843	50 %	25 %	0 %	25 %	407719114
61	NC_018675	ACAA	2	8	26885	26892	75 %	0 %	0 %	25 %	407719116
62	NC_018675	AGCC	2	8	26908	26915	25 %	0 %	25 %	50 %	407719116
63	NC_018675	AAGC	2	8	27040	27047	50 %	0 %	25 %	25 %	407719116
64	NC_018675	TTGG	2	8	27704	27711	0 %	50 %	50 %	0 %	407719117
65	NC_018675	AGCA	2	8	28086	28093	50 %	0 %	25 %	25 %	407719117
66	NC_018675	AAAG	2	8	28676	28683	75 %	0 %	25 %	0 %	407719117
67	NC_018675	GAAA	2	8	28756	28763	75 %	0 %	25 %	0 %	407719118
68	NC_018675	GCAG	2	8	28843	28850	25 %	0 %	50 %	25 %	407719118
69	NC_018675	ACTG	2	8	29450	29457	25 %	25 %	25 %	25 %	407719119
70	NC_018675	CGTC	2	8	30157	30164	0 %	25 %	25 %	50 %	407719120
71	NC_018675	TCGC	2	8	30452	30459	0 %	25 %	25 %	50 %	407719121
72	NC_018675	ATTT	2	8	30746	30753	25 %	75 %	0 %	0 %	407719121
73	NC_018675	ATTT	2	8	31071	31078	25 %	75 %	0 %	0 %	407719122
74	NC_018675	TTTG	2	8	31539	31546	0 %	75 %	25 %	0 %	407719122
75	NC_018675	TTCC	2	8	31724	31731	0 %	50 %	0 %	50 %	407719122
76	NC_018675	TTTG	2	8	31984	31991	0 %	75 %	25 %	0 %	407719122
77	NC_018675	AGAT	2	8	32386	32393	50 %	25 %	25 %	0 %	407719123
78	NC_018675	AATA	2	8	32432	32439	75 %	25 %	0 %	0 %	407719123
79	NC_018675	ACTA	2	8	32728	32735	50 %	25 %	0 %	25 %	407719123
80	NC_018675	CTTT	2	8	32784	32791	0 %	75 %	0 %	25 %	407719123
81	NC_018675	AATA	2	8	32968	32975	75 %	25 %	0 %	0 %	407719123
82	NC_018675	TTCT	2	8	33452	33459	0 %	75 %	0 %	25 %	407719124
83	NC_018675	AATA	3	12	33516	33527	75 %	25 %	0 %	0 %	407719124
84	NC_018675	GTTA	2	8	34022	34029	25 %	50 %	25 %	0 %	407719124
85	NC_018675	TTTC	2	8	34055	34062	0 %	75 %	0 %	25 %	407719124
86	NC_018675	TTGC	2	8	35715	35722	0 %	50 %	25 %	25 %	407719125
87	NC_018675	GTTA	2	8	36261	36268	25 %	50 %	25 %	0 %	407719126
88	NC_018675	TTTC	2	8	36341	36348	0 %	75 %	0 %	25 %	407719126
89	NC_018675	TGGT	2	8	36617	36624	0 %	50 %	50 %	0 %	407719126
90	NC_018675	TTGC	2	8	36792	36799	0 %	50 %	25 %	25 %	407719126
91	NC_018675	CAAC	2	8	37154	37161	50 %	0 %	0 %	50 %	407719126
92	NC_018675	AGTT	2	8	38594	38601	25 %	50 %	25 %	0 %	407719126
93	NC_018675	ACTG	2	8	39289	39296	25 %	25 %	25 %	25 %	407719127

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.