MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Leuconostoc carnosum JB16 plasmid pKLC1

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018674	CTTTT	2	10	79	88	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018674	ATTTT	2	10	144	153	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018674	GCTGA	2	10	3504	3513	20 %	20 %	40 %	20 %	407719066
4	NC_018674	GCCCT	2	10	4064	4073	0 %	20 %	20 %	60 %	407719066
5	NC_018674	GCTCG	2	10	4592	4601	0 %	20 %	40 %	40 %	407719067
6	NC_018674	TAGCG	2	10	5636	5645	20 %	20 %	40 %	20 %	407719068
7	NC_018674	GGCGT	2	10	6223	6232	0 %	20 %	60 %	20 %	407719068
8	NC_018674	AAATA	2	10	8291	8300	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018674	TAAAA	2	10	8441	8450	80 %	20 %	0 %	0 %	407719070
10	NC_018674	TTACC	2	10	8508	8517	20 %	40 %	0 %	40 %	407719070
11	NC_018674	TTTAA	2	10	8775	8784	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018674	CTATA	2	10	9399	9408	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018674	TTAAT	2	10	10910	10919	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018674	CTTAT	2	10	12008	12017	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018674	TTGCT	2	10	14369	14378	0 %	60 %	20 %	20 %	407719075
16	NC_018674	TCACT	2	10	15160	15169	20 %	40 %	0 %	40 %	407719075
17	NC_018674	GGTAA	2	10	15262	15271	40 %	20 %	40 %	0 %	407719075
18	NC_018674	CTGGT	2	10	16738	16747	0 %	40 %	40 %	20 %	407719077
19	NC_018674	GCCAT	2	10	17057	17066	20 %	20 %	20 %	40 %	407719078
20	NC_018674	AGGTT	2	10	18547	18556	20 %	40 %	40 %	0 %	407719079
21	NC_018674	ATTGG	2	10	20070	20079	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018674	CTAAA	2	10	20232	20241	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018674	CAACA	2	10	21358	21367	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.