MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Leuconostoc carnosum JB16 plasmid pKLC1

Total Repeats: 275

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018674	TGT	2	6	6	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018674	ATA	2	6	12	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018674	TGG	2	6	73	78	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018674	ATT	2	6	95	100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018674	TTG	2	6	363	368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018674	ACA	2	6	472	477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719063
7	NC_018674	ATT	2	6	525	530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719063
8	NC_018674	TAA	2	6	602	607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719063
9	NC_018674	TAC	2	6	689	694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719063
10	NC_018674	CCA	2	6	832	837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719063
11	NC_018674	AGT	2	6	844	849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719063
12	NC_018674	GAA	2	6	1075	1080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719063
13	NC_018674	TAC	2	6	1252	1257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719064
14	NC_018674	GAT	2	6	1266	1271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719064
15	NC_018674	CAG	2	6	1342	1347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719064
16	NC_018674	TTA	2	6	1485	1490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719064
17	NC_018674	GAA	2	6	1518	1523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719064
18	NC_018674	AAT	2	6	1567	1572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719064
19	NC_018674	ATT	2	6	1716	1721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018674	CAT	2	6	1881	1886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719065
21	NC_018674	TAG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719065
22	NC_018674	CTA	2	6	1902	1907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719065
23	NC_018674	TCA	2	6	1971	1976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719065
24	NC_018674	CAC	2	6	1977	1982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719065
25	NC_018674	GAC	2	6	2208	2213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719065
26	NC_018674	CCA	2	6	2295	2300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719065
27	NC_018674	AAT	2	6	2317	2322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719065
28	NC_018674	ACC	2	6	2336	2341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719065
29	NC_018674	CGA	2	6	2448	2453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719065
30	NC_018674	TAA	2	6	2639	2644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018674	CAT	2	6	2740	2745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018674	AAC	2	6	3030	3035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719066
33	NC_018674	AGT	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719066
34	NC_018674	ATC	2	6	3048	3053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719066
35	NC_018674	TCG	2	6	3054	3059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719066
36	NC_018674	ACT	2	6	3114	3119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719066
37	NC_018674	TTG	2	6	3131	3136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719066
38	NC_018674	TAA	2	6	3150	3155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719066
39	NC_018674	CGC	2	6	3212	3217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719066
40	NC_018674	ATG	2	6	3686	3691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719066
41	NC_018674	TCG	2	6	3727	3732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719066
42	NC_018674	CCA	2	6	3753	3758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719066
43	NC_018674	AAG	2	6	3798	3803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719066
44	NC_018674	ACT	2	6	3891	3896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719066
45	NC_018674	GCT	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719066
46	NC_018674	GCC	2	6	4154	4159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719066
47	NC_018674	CCA	2	6	4239	4244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719066
48	NC_018674	CAA	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719066
49	NC_018674	TCC	2	6	4281	4286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_018674	CTT	2	6	4359	4364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719067
51	NC_018674	CAA	2	6	4410	4415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719067
52	NC_018674	TTC	2	6	4423	4428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719067
53	NC_018674	CAT	2	6	4575	4580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719067
54	NC_018674	AAG	2	6	4607	4612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719067
55	NC_018674	AGC	2	6	4648	4653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719067
56	NC_018674	TTG	2	6	4795	4800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719067
57	NC_018674	TGC	2	6	4889	4894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719067
58	NC_018674	CAC	2	6	4896	4901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719067
59	NC_018674	TCA	2	6	4967	4972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719067
60	NC_018674	CTT	2	6	4990	4995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719067
61	NC_018674	CGT	2	6	5188	5193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719067
62	NC_018674	CCT	2	6	5331	5336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407719068
63	NC_018674	CTT	2	6	5389	5394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719068
64	NC_018674	TCA	2	6	5502	5507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719068
65	NC_018674	GAA	2	6	5530	5535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719068
66	NC_018674	TCT	2	6	5685	5690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719068
67	NC_018674	CAT	2	6	5706	5711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719068
68	NC_018674	ATG	2	6	5788	5793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719068
69	NC_018674	TTG	2	6	5797	5802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719068
70	NC_018674	ATT	2	6	5995	6000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719068
71	NC_018674	GCT	2	6	6084	6089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719068
72	NC_018674	CCA	2	6	6182	6187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719068
73	NC_018674	ACC	2	6	6249	6254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719068
74	NC_018674	CAG	2	6	6268	6273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719068
75	NC_018674	TGA	2	6	6289	6294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719068
76	NC_018674	AAT	2	6	6400	6405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719068
77	NC_018674	AAC	2	6	6470	6475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719068
78	NC_018674	CGG	2	6	6504	6509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719068
79	NC_018674	CTG	2	6	6597	6602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719068
80	NC_018674	TAA	2	6	6685	6690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719068
81	NC_018674	GTC	2	6	6708	6713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719068
82	NC_018674	ATG	2	6	6762	6767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719068
83	NC_018674	TAA	2	6	6879	6884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018674	CTT	2	6	6885	6890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018674	ATT	2	6	6991	6996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018674	AGG	2	6	7073	7078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018674	CAA	2	6	7082	7087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018674	TTA	2	6	7271	7276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018674	ATA	2	6	7323	7328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018674	GAA	2	6	7443	7448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719069
91	NC_018674	ATT	2	6	7732	7737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719069
92	NC_018674	AAG	2	6	7790	7795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719069
93	NC_018674	ACA	2	6	7946	7951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018674	TTG	2	6	7952	7957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018674	AGT	2	6	8073	8078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018674	AAT	2	6	8422	8427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719070
97	NC_018674	ATG	2	6	8535	8540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719070
98	NC_018674	TCT	2	6	8543	8548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719070
99	NC_018674	CAT	2	6	8572	8577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719070
100	NC_018674	TGT	2	6	8653	8658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719070
101	NC_018674	ATT	2	6	8680	8685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018674	ATT	2	6	8883	8888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018674	CAA	2	6	8948	8953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018674	GTT	2	6	8957	8962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018674	ATG	2	6	9049	9054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018674	TAA	2	6	9071	9076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018674	TAT	2	6	9114	9119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018674	CTA	2	6	9179	9184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018674	ATT	2	6	9312	9317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018674	CTT	2	6	9330	9335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018674	AGC	2	6	9349	9354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018674	TAA	2	6	9375	9380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018674	CTT	2	6	9435	9440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018674	TAA	2	6	9458	9463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018674	CAA	2	6	9491	9496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719071
116	NC_018674	AGG	2	6	9648	9653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407719071
117	NC_018674	CAG	2	6	9737	9742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719071
118	NC_018674	TAA	2	6	9783	9788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719071
119	NC_018674	CAC	2	6	9797	9802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719071
120	NC_018674	TAA	2	6	9863	9868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719071
121	NC_018674	ATC	2	6	9879	9884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719071
122	NC_018674	AAT	2	6	10077	10082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719071
123	NC_018674	ATA	2	6	10093	10098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719071
124	NC_018674	TCA	2	6	10192	10197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018674	ATT	2	6	10306	10311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719072
126	NC_018674	TTG	2	6	10318	10323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719072
127	NC_018674	TAA	2	6	10349	10354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719072
128	NC_018674	ATT	2	6	10606	10611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018674	TAA	2	6	10666	10671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018674	TAT	2	6	10761	10766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018674	TGA	2	6	10815	10820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018674	ATA	2	6	10889	10894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018674	AGT	2	6	11220	11225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018674	CAG	2	6	11243	11248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018674	TTA	2	6	11288	11293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_018674	ATA	2	6	20719	20724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_018674	GAG	2	6	20759	20764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
265	NC_018674	TAA	2	6	20856	20861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_018674	CAG	2	6	20914	20919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_018674	TTA	2	6	20975	20980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_018674	CTT	2	6	21067	21072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_018674	TTA	4	12	21385	21396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_018674	AAG	2	6	21446	21451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
271	NC_018674	GAA	2	6	21508	21513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
272	NC_018674	GAA	2	6	21533	21538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
273	NC_018674	GTC	2	6	21577	21582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_018674	CTA	2	6	21778	21783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_018674	AGT	2	6	21830	21835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.