MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Leuconostoc carnosum JB16 plasmid pKLC1

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018674	TGT	2	6	6	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018674	ATA	2	6	12	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018674	TGG	2	6	73	78	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018674	ATT	2	6	95	100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018674	TTG	2	6	363	368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018674	ATT	2	6	1716	1721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018674	TAA	2	6	2639	2644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018674	CAT	2	6	2740	2745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018674	TCC	2	6	4281	4286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_018674	TAA	2	6	6879	6884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018674	CTT	2	6	6885	6890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018674	ATT	2	6	6991	6996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018674	AGG	2	6	7073	7078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018674	CAA	2	6	7082	7087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018674	TTA	2	6	7271	7276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018674	ATA	2	6	7323	7328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018674	ACA	2	6	7946	7951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018674	TTG	2	6	7952	7957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018674	AGT	2	6	8073	8078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018674	ATT	2	6	8680	8685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018674	ATT	2	6	8883	8888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018674	CAA	2	6	8948	8953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018674	GTT	2	6	8957	8962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018674	ATG	2	6	9049	9054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018674	TAA	2	6	9071	9076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018674	TAT	2	6	9114	9119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018674	CTA	2	6	9179	9184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018674	ATT	2	6	9312	9317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018674	CTT	2	6	9330	9335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018674	AGC	2	6	9349	9354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018674	TAA	2	6	9375	9380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018674	CTT	2	6	9435	9440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018674	TAA	2	6	9458	9463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018674	TCA	2	6	10192	10197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018674	ATT	2	6	10606	10611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018674	TAA	2	6	10666	10671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018674	TAT	2	6	10761	10766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018674	TGA	2	6	10815	10820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018674	ATA	2	6	10889	10894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018674	AGT	2	6	11220	11225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018674	CAG	2	6	11243	11248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018674	TTA	2	6	11288	11293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018674	GTT	2	6	11612	11617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018674	TCA	2	6	11652	11657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018674	TAA	2	6	11779	11784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018674	AAT	2	6	11820	11825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018674	GAT	2	6	11870	11875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018674	AAT	2	6	11891	11896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018674	TGA	2	6	11941	11946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018674	ATT	2	6	12036	12041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018674	CAA	2	6	12094	12099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018674	TGT	2	6	12125	12130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018674	ATG	2	6	12279	12284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018674	CCA	2	6	12315	12320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_018674	AAT	2	6	12351	12356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018674	CAA	2	6	12369	12374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018674	CTC	2	6	12378	12383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_018674	GAG	2	6	12474	12479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018674	TGA	2	6	12506	12511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018674	GTT	2	6	12530	12535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018674	TAT	2	6	12544	12549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018674	ACA	2	6	12556	12561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018674	ATT	2	6	12577	12582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018674	CTA	2	6	12616	12621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018674	GCT	2	6	15369	15374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018674	TAA	2	6	15387	15392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018674	TCC	2	6	15745	15750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_018674	CTT	2	6	15814	15819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018674	TCA	2	6	15838	15843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018674	AAC	2	6	15985	15990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018674	GAC	2	6	16030	16035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018674	TTG	2	6	16061	16066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018674	TAA	2	6	18844	18849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018674	GTT	2	6	19003	19008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018674	AGC	2	6	19032	19037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018674	CAA	2	6	20050	20055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018674	TAT	2	6	20195	20200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018674	AAT	2	6	20311	20316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018674	TTA	2	6	20672	20677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018674	TCA	2	6	20686	20691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018674	TTA	2	6	20701	20706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018674	ATA	2	6	20719	20724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018674	GAG	2	6	20759	20764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018674	TAA	2	6	20856	20861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018674	CAG	2	6	20914	20919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018674	TTA	2	6	20975	20980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018674	CTT	2	6	21067	21072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018674	TTA	4	12	21385	21396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018674	AAG	2	6	21446	21451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018674	GAA	2	6	21508	21513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018674	GAA	2	6	21533	21538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018674	GTC	2	6	21577	21582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018674	CTA	2	6	21778	21783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018674	AGT	2	6	21830	21835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.