MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Leuconostoc carnosum JB16 chromosome

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018673	ACTGGT	2	12	19377	19388	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018673	CAATCT	2	12	39983	39994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018673	GTTTTC	2	12	40053	40064	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018673	TTAATT	2	12	83435	83446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018673	GAAAAA	2	12	86062	86073	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018673	ATTCTG	2	12	175212	175223	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018673	AAATCA	2	12	218556	218567	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018673	TTTATT	2	12	267213	267224	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018673	ATTGAT	2	12	281559	281570	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018673	TATTGT	2	12	284745	284756	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018673	TTAAGC	2	12	303603	303614	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018673	AAAATC	2	12	324027	324038	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018673	TACTTT	2	12	367022	367033	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018673	TAATTA	2	12	375825	375836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018673	TAAAAA	2	12	388756	388767	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018673	TAAAAA	2	12	388853	388864	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018673	TAATTT	2	12	390828	390839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018673	TTAAAT	2	12	398925	398936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018673	ATAAAT	2	12	435349	435360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018673	AATTTT	2	12	438188	438199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018673	CAGCAA	2	12	468324	468335	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018673	CAAAAT	2	12	487096	487107	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018673	TTTACA	2	12	499611	499622	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018673	TAGAAA	2	12	512410	512421	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018673	ACCAAG	2	12	594532	594543	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018673	TAAAAT	2	12	642607	642618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018673	ATGTTA	2	12	659882	659893	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018673	ATTGCC	2	12	664822	664833	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018673	AAGTAA	2	12	669807	669818	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018673	TGTTAA	2	12	714313	714324	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018673	ATATTT	2	12	750025	750036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018673	ATAATT	2	12	776670	776681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018673	TCATGC	2	12	784434	784445	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018673	TAAATA	2	12	830808	830819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018673	TCTATA	2	12	861437	861448	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018673	TCATTT	2	12	879660	879671	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018673	ATTACA	2	12	892317	892328	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018673	TATTTT	2	12	967379	967390	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018673	TTTTTA	2	12	987439	987450	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018673	TAGCCT	2	12	993566	993577	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018673	TTATAA	2	12	1008977	1008988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018673	AATTTA	2	12	1053182	1053193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018673	AAAGAA	4	24	1060693	1060716	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018673	TGTTAT	2	12	1096127	1096138	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018673	ATTTGT	2	12	1102832	1102843	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018673	ATAATG	2	12	1112429	1112440	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018673	ACCAAC	2	12	1165244	1165255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018673	TAGTTG	2	12	1187607	1187618	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018673	TAAAAA	2	12	1197917	1197928	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018673	TAATAT	2	12	1212340	1212351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018673	CCATTA	2	12	1261882	1261893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018673	TAATCT	2	12	1301831	1301842	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018673	AAATTG	2	12	1368049	1368060	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018673	CTATTA	2	12	1434560	1434571	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018673	TTTTAT	2	12	1444050	1444061	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018673	TAATAT	2	12	1451864	1451875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018673	TATTTA	2	12	1474944	1474955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018673	CGGCAA	2	12	1481665	1481676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018673	TTATTT	2	12	1506578	1506589	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018673	ATATTT	2	12	1536177	1536188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018673	AAAATT	2	12	1554098	1554109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018673	TTAAAA	2	12	1562089	1562100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018673	TGAGAA	2	12	1575593	1575604	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018673	TATATT	2	12	1577854	1577865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018673	ATTCTA	2	12	1581577	1581588	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018673	CTTTTT	2	12	1597029	1597040	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_018673	TAAAAT	2	12	1599195	1599206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018673	TCTATT	2	12	1600057	1600068	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_018673	AAAAAG	2	12	1606606	1606617	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018673	TAGAAT	2	12	1609118	1609129	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.