MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Leuconostoc carnosum JB16 chromosome

Total Repeats: 558

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018673	TTTAGC	2	12	3403	3414	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407717517
2	NC_018673	CAGATA	2	12	5068	5079	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407717518
3	NC_018673	TATATT	2	12	6135	6146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407717518
4	NC_018673	ACAAGC	2	12	7821	7832	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407717519
5	NC_018673	TGAAGA	2	12	8049	8060	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407717519
6	NC_018673	TTGGAT	2	12	10683	10694	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407717521
7	NC_018673	TTATCG	2	12	15646	15657	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407717525
8	NC_018673	ATTAAC	2	12	20070	20081	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407717530
9	NC_018673	GAAGCA	2	12	20626	20637	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407717530
10	NC_018673	GTGCTG	2	12	22621	22632	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	407717532
11	NC_018673	ATGACA	2	12	23049	23060	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407717533
12	NC_018673	GTTTAC	2	12	25417	25428	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407717534
13	NC_018673	ATTGCG	2	12	28462	28473	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407717538
14	NC_018673	AACAGA	2	12	46139	46150	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407717548
15	NC_018673	AGTGCG	2	12	46200	46211	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407717548
16	NC_018673	ATGGCA	2	12	47712	47723	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407717550
17	NC_018673	CAATGG	2	12	47935	47946	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407717550
18	NC_018673	TACCAT	2	12	48922	48933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407717550
19	NC_018673	GCTTTG	2	12	51914	51925	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407717553
20	NC_018673	AAATTG	2	12	54119	54130	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407717556
21	NC_018673	ACAAGC	2	12	55275	55286	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407717557
22	NC_018673	AAGATA	2	12	55460	55471	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407717557
23	NC_018673	TGAATT	2	12	57522	57533	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407717557
24	NC_018673	GCTATT	2	12	57547	57558	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407717557
25	NC_018673	AGTTGA	2	12	57747	57758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407717557
26	NC_018673	TGTTGG	2	12	61582	61593	0 %	50 %	50 %	0 %	407717560
27	NC_018673	TGATTT	2	12	63780	63791	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407717562
28	NC_018673	GACATT	2	12	70572	70583	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407717568
29	NC_018673	GTAATC	2	12	73926	73937	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407717569
30	NC_018673	CAATAC	2	12	75526	75537	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407717570
31	NC_018673	TTAATA	2	12	79227	79238	50 %	50 %	0 %	0 %	407717573
32	NC_018673	GCAAAA	2	12	80349	80360	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407717574
33	NC_018673	CATTTG	2	12	82957	82968	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407717576
34	NC_018673	TACGCA	2	12	85576	85587	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407717580
35	NC_018673	TTACCA	2	12	90460	90471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407717587
36	NC_018673	ATTTTG	2	12	93167	93178	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407717591
37	NC_018673	GTGCTG	2	12	94901	94912	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	407717592
38	NC_018673	TGATAT	2	12	101023	101034	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407717597
39	NC_018673	GTCATT	2	12	101297	101308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407717597
40	NC_018673	AGCGTT	2	12	117732	117743	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407717613
41	NC_018673	TTTCAT	2	12	128749	128760	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407717625
42	NC_018673	GGTGAA	2	12	129715	129726	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	407717626
43	NC_018673	TGCTGA	2	12	130104	130115	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407717626
44	NC_018673	TGGCAA	2	12	134282	134293	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407717629
45	NC_018673	TGATGT	2	12	136113	136124	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407717632
46	NC_018673	GCAATC	2	12	136422	136433	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407717632
47	NC_018673	ATGCTA	2	12	137903	137914	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407717633
48	NC_018673	TGACAA	2	12	141411	141422	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407717637
49	NC_018673	TAAAAA	2	12	148439	148450	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407717643
50	NC_018673	TATCGT	2	12	149481	149492	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407717644
51	NC_018673	TGTATT	2	12	150343	150354	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407717644
52	NC_018673	AAGTGA	2	12	151224	151235	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407717645
53	NC_018673	TTAATG	2	12	152010	152021	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407717646
54	NC_018673	ATAAAA	2	12	168416	168427	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407717653
55	NC_018673	TAATTA	2	12	169170	169181	50 %	50 %	0 %	0 %	407717653
56	NC_018673	TGCTAT	2	12	173013	173024	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407717655
57	NC_018673	CGTGTA	2	12	174731	174742	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407717656
58	NC_018673	AAGTCA	2	12	175445	175456	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407717657
59	NC_018673	GCCGTA	2	12	176796	176807	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407717659
60	NC_018673	ATTCGA	2	12	178052	178063	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407717659
61	NC_018673	AAATAA	2	12	179276	179287	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407717660
62	NC_018673	TTCAGG	2	12	180122	180133	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407717661
63	NC_018673	CTGTTG	2	12	189097	189108	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407717675
64	NC_018673	TATCGA	2	12	189902	189913	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407717677
65	NC_018673	TAAAGG	2	12	191645	191656	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407717680
66	NC_018673	CTTGGA	2	12	192774	192785	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407717683
67	NC_018673	TAAGCA	2	12	195694	195705	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407717688
68	NC_018673	GTTCGT	2	12	195935	195946	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407717689
69	NC_018673	TTTGAA	2	12	196967	196978	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407717691
70	NC_018673	ATTACG	2	12	201689	201700	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407717695
71	NC_018673	CTTTAC	2	12	209016	209027	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407717704
72	NC_018673	TCGTCA	2	12	210318	210329	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407717706
73	NC_018673	GATCAT	2	12	210820	210831	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407717706
74	NC_018673	TTATCA	2	12	210888	210899	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407717706
75	NC_018673	TTTAAG	2	12	212743	212754	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407717708
76	NC_018673	TTTATG	2	12	219362	219373	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407717714
77	NC_018673	TTGGTT	2	12	221101	221112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407717716
78	NC_018673	GTGAAG	2	12	225797	225808	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	407717717
79	NC_018673	CGTATT	2	12	233380	233391	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407717723
80	NC_018673	AATGCT	2	12	235185	235196	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407717724
81	NC_018673	GCACAG	2	12	235698	235709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407717724
82	NC_018673	GGAAGC	2	12	244620	244631	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	407717736
83	NC_018673	TAAGGT	2	12	246018	246029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407717738
84	NC_018673	TCAGTT	2	12	247571	247582	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407717741
85	NC_018673	ACAAAC	2	12	249415	249426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407717742
86	NC_018673	AAGATA	2	12	251552	251563	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407717746
87	NC_018673	ATTTAT	2	12	251947	251958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407717747
88	NC_018673	TTTTTG	2	12	253972	253983	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407717749
89	NC_018673	GCTGAA	2	12	254398	254409	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407717749
90	NC_018673	AGTATT	2	12	254502	254513	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407717750
91	NC_018673	TGTGGT	2	12	254574	254585	0 %	50 %	50 %	0 %	407717750
92	NC_018673	AATGTC	2	12	257685	257696	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407717753
93	NC_018673	TCAACA	2	12	262115	262126	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407717757
94	NC_018673	TGCACG	2	12	268483	268494	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407717763
95	NC_018673	ATGAAA	2	12	270223	270234	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407717764
96	NC_018673	ACAATA	2	12	271568	271579	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407717766
97	NC_018673	TACAGA	2	12	272343	272354	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407717767
98	NC_018673	CGTCAT	2	12	274879	274890	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407717769
99	NC_018673	TTGGTA	2	12	276575	276586	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407717771
100	NC_018673	CATTGT	2	12	281492	281503	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407717775
101	NC_018673	ATTTTG	2	12	282020	282031	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407717776
102	NC_018673	TAAGAT	2	12	282827	282838	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407717777
103	NC_018673	CTATTG	2	12	291517	291528	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407717785
104	NC_018673	TTTAAA	2	12	291651	291662	50 %	50 %	0 %	0 %	407717785
105	NC_018673	TTACGT	2	12	299988	299999	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407717791
106	NC_018673	GCGGTT	2	12	303127	303138	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	407717795
107	NC_018673	CAACAG	2	12	304242	304253	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407717796
108	NC_018673	GGCTAT	2	12	314372	314383	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407717807
109	NC_018673	TTAAAA	2	12	315946	315957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407717809
110	NC_018673	TTAAAA	2	12	317381	317392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407717811
111	NC_018673	ATTAGG	2	12	318217	318228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407717812
112	NC_018673	CTGAAG	2	12	320221	320232	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407717814
113	NC_018673	ATATTA	2	12	320290	320301	50 %	50 %	0 %	0 %	407717814
114	NC_018673	TTTGAA	2	12	325351	325362	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407717820
115	NC_018673	AACTGA	2	12	325585	325596	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407717820
116	NC_018673	TAAATT	2	12	337120	337131	50 %	50 %	0 %	0 %	407717831
117	NC_018673	GAAAAA	2	12	346525	346536	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407717838
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343	NC_018673	CTTCAT	2	12	1044724	1044735	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407718500
344	NC_018673	TTCCTT	2	12	1051401	1051412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407718506
345	NC_018673	CACCAA	2	12	1053522	1053533	50 %	0 %	0 %	50 %	407718509
346	NC_018673	GCTAAG	2	12	1053953	1053964	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407718509
347	NC_018673	CTTGTT	2	12	1055978	1055989	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407718511
348	NC_018673	CTAATA	2	12	1058511	1058522	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407718512
349	NC_018673	TTTCTA	2	12	1060443	1060454	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407718514
350	NC_018673	TAATCA	2	12	1067179	1067190	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407718519
351	NC_018673	GCTGTT	2	12	1069324	1069335	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407718522
352	NC_018673	GCAACT	2	12	1070171	1070182	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407718523
353	NC_018673	AATTTC	2	12	1079632	1079643	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407718533
354	NC_018673	ATTTTG	2	12	1081181	1081192	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407718534
355	NC_018673	AAGCTG	2	12	1084928	1084939	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407718538
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357	NC_018673	CTGCAA	2	12	1089853	1089864	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407718542
358	NC_018673	GCTTTA	2	12	1092517	1092528	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407718546
359	NC_018673	TTGATC	2	12	1093724	1093735	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407718548
360	NC_018673	AGCATT	2	12	1094204	1094215	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407718548
361	NC_018673	CTGCAC	2	12	1094284	1094295	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	407718548
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364	NC_018673	ACCATT	2	12	1100203	1100214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407718553
365	NC_018673	ACGTAA	2	12	1105397	1105408	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407718558
366	NC_018673	TAATGT	2	12	1112285	1112296	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407718563
367	NC_018673	ATCAGC	2	12	1113630	1113641	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407718565
368	NC_018673	TTCAGC	2	12	1115754	1115765	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407718565
369	NC_018673	GACCAA	2	12	1115782	1115793	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407718565
370	NC_018673	ATTTTG	2	12	1115987	1115998	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407718565
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373	NC_018673	TAATGA	2	12	1123410	1123421	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407718573
374	NC_018673	ATCCTG	2	12	1126059	1126070	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407718576
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379	NC_018673	CACTGT	2	12	1136089	1136100	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407718589
380	NC_018673	GCTACT	2	12	1137360	1137371	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407718589
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443	NC_018673	TCACTA	2	12	1299572	1299583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407718735
444	NC_018673	TCAAAT	2	12	1299888	1299899	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407718735
445	NC_018673	TACCAG	2	12	1307183	1307194	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407718742
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447	NC_018673	TAATTT	2	12	1311555	1311566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407718746
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449	NC_018673	GCATCA	2	12	1318416	1318427	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407718751
450	NC_018673	TACTTT	2	12	1328346	1328357	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407718760
451	NC_018673	CAATTC	2	12	1331045	1331056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407718762
452	NC_018673	TGGTTT	2	12	1331953	1331964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407718763
453	NC_018673	GTAACA	2	12	1338585	1338596	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407718771
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455	NC_018673	TGCAAT	2	12	1343649	1343660	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407718774
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