MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Leuconostoc carnosum JB16 chromosome

Total Repeats: 252

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018673	AAATG	2	10	16294	16303	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018673	ATAGT	2	10	30657	30666	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018673	TACCA	2	10	31457	31466	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_018673	TCGTG	2	10	32043	32052	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_018673	GTTAA	2	10	32888	32897	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018673	GAGAT	2	10	35677	35686	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018673	TAAAA	2	10	39053	39062	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018673	TAAAA	2	10	39998	40007	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018673	ATAGT	2	10	50211	50220	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018673	TGCGG	2	10	52584	52593	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018673	AATAT	2	10	61081	61090	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018673	AAATA	2	10	63082	63091	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018673	TAGTG	2	10	74774	74783	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018673	TTTAT	2	10	74815	74824	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018673	CCTAG	2	10	86170	86179	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_018673	AATAA	2	10	92659	92668	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018673	TTTTA	2	10	92895	92904	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018673	GTAAT	2	10	99767	99776	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018673	TCTGT	2	10	114906	114915	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018673	AATAA	2	10	115009	115018	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018673	ATATA	2	10	117933	117942	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018673	TATAA	2	10	118059	118068	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018673	TATGA	2	10	119531	119540	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018673	TATAA	2	10	123648	123657	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018673	AAAAG	2	10	124907	124916	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018673	ATAAA	2	10	128497	128506	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018673	TGATA	2	10	129214	129223	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018673	TGATA	2	10	132399	132408	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018673	TTTTA	2	10	141062	141071	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018673	CACAA	2	10	156458	156467	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_018673	ATAGT	2	10	159502	159511	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018673	TACCA	2	10	160302	160311	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_018673	TCGTG	2	10	160888	160897	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018673	GTTAA	2	10	161733	161742	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018673	GAGAT	2	10	164522	164531	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018673	TATAA	2	10	171908	171917	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018673	TAAAA	2	10	175095	175104	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018673	TCTGT	2	10	175252	175261	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_018673	ATCAC	2	10	175263	175272	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_018673	TTTAA	2	10	178701	178710	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018673	TAGGC	2	10	195286	195295	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018673	TTAAT	2	10	196248	196257	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018673	TCGTA	2	10	211965	211974	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_018673	TTTAT	2	10	216257	216266	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018673	TGATA	2	10	217117	217126	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018673	TTTAA	2	10	218184	218193	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018673	ATTAA	2	10	220222	220231	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018673	CGTGT	2	10	224134	224143	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018673	ATATA	2	10	230016	230025	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018673	AGTAT	2	10	243056	243065	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018673	TAAAT	2	10	245095	245104	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018673	CAGGA	2	10	248017	248026	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018673	ATATT	2	10	267116	267125	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018673	TTTTA	2	10	273898	273907	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018673	TTTTG	2	10	286314	286323	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018673	AAAAT	2	10	286382	286391	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018673	TTTAT	2	10	286789	286798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018673	TAGGG	2	10	302555	302564	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018673	AATAA	2	10	302646	302655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018673	CTTTT	2	10	318578	318587	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_018673	ACTAT	2	10	326166	326175	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018673	ATATG	2	10	328063	328072	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018673	ACTAA	2	10	342870	342879	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_018673	ACAGT	2	10	352722	352731	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_018673	ATATT	2	10	357787	357796	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018673	TTTTA	2	10	392815	392824	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018673	TATCA	2	10	402463	402472	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_018673	TGAAG	2	10	406406	406415	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018673	GAAAG	2	10	411723	411732	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018673	TATTT	2	10	413303	413312	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018673	TAATT	2	10	422012	422021	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018673	CTTAA	2	10	424811	424820	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018673	AAAAT	2	10	427094	427103	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018673	GTTTT	2	10	440900	440909	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018673	TAAAA	2	10	449826	449835	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018673	TGATA	2	10	463786	463795	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018673	CAAAA	2	10	466712	466721	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018673	TCATT	2	10	467077	467086	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018673	CAATT	2	10	467421	467430	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_018673	AATTG	2	10	467506	467515	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018673	TTGAT	2	10	467931	467940	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018673	AATTT	2	10	472005	472014	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018673	TAAAA	2	10	479711	479720	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018673	ATAAA	2	10	484240	484249	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018673	ATTGA	2	10	486907	486916	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018673	TTTAC	2	10	520749	520758	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_018673	ATTTA	2	10	533249	533258	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018673	ATAAA	2	10	533387	533396	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018673	ATTTT	2	10	536177	536186	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018673	TAATG	2	10	544573	544582	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018673	AATAA	2	10	563635	563644	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018673	AGTTA	2	10	567567	567576	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018673	TAAAA	2	10	610833	610842	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018673	TTGGT	2	10	622229	622238	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018673	TATTT	2	10	628994	629003	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018673	GATAA	2	10	632540	632549	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018673	TGTGT	2	10	654148	654157	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018673	GATAG	2	10	657692	657701	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018673	TTGAT	2	10	663416	663425	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018673	ATTAA	2	10	679947	679956	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018673	AGTTC	2	10	695035	695044	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_018673	GTACG	2	10	695083	695092	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_018673	ATAAA	2	10	706572	706581	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018673	TTTAA	2	10	719837	719846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018673	TATTG	2	10	728601	728610	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018673	TAAAA	2	10	738652	738661	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018673	TAATA	2	10	749951	749960	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018673	GAAAG	2	10	798969	798978	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018673	ATGAA	2	10	801270	801279	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018673	TACTA	2	10	802021	802030	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_018673	CTTTC	2	10	808507	808516	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_018673	AAATA	2	10	813098	813107	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018673	TTTAT	2	10	823501	823510	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018673	CTCAT	2	10	832227	832236	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_018673	TTAAT	2	10	833468	833477	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018673	ATTTT	2	10	833488	833497	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018673	ATTCT	2	10	835323	835332	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_018673	TTGAA	2	10	835407	835416	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018673	TTACA	2	10	843023	843032	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018673	ATCAT	2	10	850542	850551	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_018673	TAATT	2	10	853790	853799	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018673	TATTG	2	10	856005	856014	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018673	GAATA	2	10	856539	856548	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018673	TGAAC	2	10	858813	858822	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018673	AAAAT	2	10	858837	858846	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018673	TTTAG	2	10	859040	859049	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018673	TTTTA	2	10	874595	874604	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018673	ACTAA	2	10	883541	883550	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_018673	TGAAA	2	10	892348	892357	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018673	ATTGC	2	10	895217	895226	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_018673	ATTGA	2	10	895259	895268	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018673	AATTT	2	10	907667	907676	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018673	ATGAC	2	10	910125	910134	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_018673	TAATT	2	10	913306	913315	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018673	ATTAT	2	10	921588	921597	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018673	CTTTT	2	10	959031	959040	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_018673	TAAAT	2	10	970009	970018	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018673	ATTTT	2	10	975594	975603	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018673	AGTCA	2	10	979012	979021	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_018673	TCATA	2	10	984991	985000	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_018673	AATAA	2	10	989961	989970	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018673	TTTAT	2	10	1023090	1023099	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018673	TCTAT	2	10	1027900	1027909	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_018673	CGTTT	2	10	1037085	1037094	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_018673	GTTTG	2	10	1053303	1053312	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018673	ATAAA	2	10	1054962	1054971	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018673	CAAAA	2	10	1056466	1056475	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_018673	TTTAA	2	10	1060509	1060518	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.