MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pAA-EA11

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018666	AGCAAG	2	12	87	98	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018666	CAAGAT	2	12	385	396	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018666	TCTAGC	2	12	2447	2458	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018666	ACTTAT	2	12	7883	7894	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407484811
5	NC_018666	AAACAG	2	12	11828	11839	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407484817
6	NC_018666	AGGTGC	2	12	15947	15958	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018666	TATTGA	2	12	18536	18547	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018666	ACTTGA	14	84	22385	22468	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018666	CAGCGG	2	12	28834	28845	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	407484839
10	NC_018666	GCTGTC	2	12	29892	29903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484841
11	NC_018666	TGACAC	2	12	32529	32540	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407484845
12	NC_018666	TGGATA	2	12	32727	32738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484845
13	NC_018666	GGGCCG	2	12	36444	36455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018666	GCCGGA	2	12	40826	40837	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	407484857
15	NC_018666	TCCGCC	2	12	43233	43244	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_018666	CATCAG	2	12	43364	43375	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407484861
17	NC_018666	GGAGCA	2	12	43677	43688	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	407484862
18	NC_018666	GCCCCA	2	12	47789	47800	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	407484866
19	NC_018666	CCACAT	2	12	48095	48106	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	407484866
20	NC_018666	ACAGGA	2	12	51367	51378	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018666	TGATGC	2	12	58344	58355	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407484873
22	NC_018666	CTGGAG	2	12	59686	59697	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407484873
23	NC_018666	TGCTCC	2	12	60650	60661	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	407484875
24	NC_018666	GCTGAT	2	12	60962	60973	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407484876
25	NC_018666	GGCGGA	2	12	62530	62541	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	407484877
26	NC_018666	AACATC	2	12	68326	68337	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407484882
27	NC_018666	TGGATG	2	12	72700	72711	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.