MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pAA-EA11

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018666	TCATT	2	10	654	663	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018666	GAGTA	2	10	3119	3128	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018666	TCATT	2	10	9493	9502	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_018666	ATGGT	2	10	11191	11200	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018666	CAAAA	2	10	13043	13052	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_018666	CCGAA	2	10	15084	15093	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_018666	CAGCC	2	10	15162	15171	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_018666	AGGAA	2	10	27247	27256	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018666	TTATG	2	10	33712	33721	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018666	ACGCA	2	10	34840	34849	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_018666	GTCTG	2	10	40293	40302	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018666	GAATC	2	10	52114	52123	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018666	ATCAC	2	10	52161	52170	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_018666	AAGAG	2	10	55456	55465	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018666	ATTTT	2	10	64700	64709	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018666	TAATA	2	10	64907	64916	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018666	TGATT	2	10	70102	70111	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.