MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pAA-EA11

Total Repeats: 211

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018666	GTTT	2	8	488	495	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018666	GCCA	2	8	1349	1356	25 %	0 %	25 %	50 %	407484806
3	NC_018666	CCTT	2	8	1800	1807	0 %	50 %	0 %	50 %	407484807
4	NC_018666	GTAT	2	8	2247	2254	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018666	TGTC	2	8	2287	2294	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018666	TGAT	2	8	2518	2525	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018666	CCAC	2	8	2755	2762	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_018666	ATAC	2	8	2935	2942	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_018666	GCCA	2	8	3473	3480	25 %	0 %	25 %	50 %	407484808
10	NC_018666	CAGC	2	8	4626	4633	25 %	0 %	25 %	50 %	407484808
11	NC_018666	GCCA	2	8	4842	4849	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018666	CCTG	2	8	4905	4912	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018666	CTTG	2	8	4955	4962	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018666	CGAC	2	8	5043	5050	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018666	CAGA	2	8	5335	5342	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018666	GCCC	2	8	5367	5374	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_018666	GTAA	2	8	5392	5399	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018666	CCAC	2	8	5406	5413	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_018666	TCTT	2	8	5648	5655	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018666	ATAA	2	8	6694	6701	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018666	GAAG	2	8	6976	6983	50 %	0 %	50 %	0 %	407484810
22	NC_018666	AATA	2	8	7026	7033	75 %	25 %	0 %	0 %	407484810
23	NC_018666	GTCA	2	8	7794	7801	25 %	25 %	25 %	25 %	407484811
24	NC_018666	GGAA	2	8	8029	8036	50 %	0 %	50 %	0 %	407484811
25	NC_018666	TGAT	2	8	8171	8178	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018666	GCCA	2	8	8388	8395	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018666	CTGA	2	8	8541	8548	25 %	25 %	25 %	25 %	407484812
28	NC_018666	GTTC	2	8	8907	8914	0 %	50 %	25 %	25 %	407484812
29	NC_018666	GCAT	2	8	8990	8997	25 %	25 %	25 %	25 %	407484812
30	NC_018666	CGAA	2	8	9173	9180	50 %	0 %	25 %	25 %	407484812
31	NC_018666	GAAA	2	8	9429	9436	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018666	GCCA	2	8	10188	10195	25 %	0 %	25 %	50 %	407484813
33	NC_018666	CCTT	2	8	10639	10646	0 %	50 %	0 %	50 %	407484814
34	NC_018666	TGAT	2	8	10737	10744	25 %	50 %	25 %	0 %	407484815
35	NC_018666	AATG	2	8	10759	10766	50 %	25 %	25 %	0 %	407484815
36	NC_018666	GCAT	2	8	10913	10920	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018666	TTGA	2	8	11155	11162	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018666	TTCT	2	8	12579	12586	0 %	75 %	0 %	25 %	407484818
39	NC_018666	TAAA	2	8	12737	12744	75 %	25 %	0 %	0 %	407484818
40	NC_018666	TAAT	2	8	12886	12893	50 %	50 %	0 %	0 %	407484818
41	NC_018666	ACTG	2	8	13550	13557	25 %	25 %	25 %	25 %	407484819
42	NC_018666	GATT	2	8	13703	13710	25 %	50 %	25 %	0 %	407484819
43	NC_018666	CAGT	2	8	14763	14770	25 %	25 %	25 %	25 %	407484822
44	NC_018666	CAGC	2	8	15272	15279	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018666	GGAT	2	8	15564	15571	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018666	GTCA	2	8	15731	15738	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018666	GCCG	2	8	15835	15842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018666	GCGA	2	8	16968	16975	25 %	0 %	50 %	25 %	407484824
49	NC_018666	AAAT	2	8	17355	17362	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018666	CAAT	2	8	17993	18000	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018666	CTAA	2	8	18466	18473	50 %	25 %	0 %	25 %	407484827
52	NC_018666	TTCT	2	8	18493	18500	0 %	75 %	0 %	25 %	407484827
53	NC_018666	TAAT	2	8	18594	18601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018666	ATAA	2	8	18615	18622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018666	TACA	2	8	19078	19085	50 %	25 %	0 %	25 %	407484829
56	NC_018666	ACTG	2	8	19151	19158	25 %	25 %	25 %	25 %	407484829
57	NC_018666	TTTC	2	8	19264	19271	0 %	75 %	0 %	25 %	407484829
58	NC_018666	GCCA	2	8	19523	19530	25 %	0 %	25 %	50 %	407484829
59	NC_018666	CGCC	2	8	20074	20081	0 %	0 %	25 %	75 %	407484829
60	NC_018666	AATG	2	8	20203	20210	50 %	25 %	25 %	0 %	407484829
61	NC_018666	ACTT	2	8	20415	20422	25 %	50 %	0 %	25 %	407484829
62	NC_018666	CATA	2	8	20459	20466	50 %	25 %	0 %	25 %	407484829
63	NC_018666	TAAT	2	8	21322	21329	50 %	50 %	0 %	0 %	407484829
64	NC_018666	ATGT	2	8	21536	21543	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018666	ATTT	2	8	21825	21832	25 %	75 %	0 %	0 %	407484830
66	NC_018666	ACGA	2	8	21895	21902	50 %	0 %	25 %	25 %	407484830
67	NC_018666	GCTG	2	8	23083	23090	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018666	TAAT	2	8	23213	23220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018666	ATTT	2	8	23224	23231	25 %	75 %	0 %	0 %	407484832
70	NC_018666	TCGA	2	8	23288	23295	25 %	25 %	25 %	25 %	407484832
71	NC_018666	TCAC	2	8	24264	24271	25 %	25 %	0 %	50 %	407484833
72	NC_018666	GCTG	2	8	25341	25348	0 %	25 %	50 %	25 %	407484834
73	NC_018666	TAAC	2	8	25855	25862	50 %	25 %	0 %	25 %	407484835
74	NC_018666	ATTT	2	8	25975	25982	25 %	75 %	0 %	0 %	407484835
75	NC_018666	CTTT	2	8	26601	26608	0 %	75 %	0 %	25 %	407484836
76	NC_018666	TGTA	2	8	27094	27101	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018666	TGTT	2	8	27703	27710	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018666	TGTT	2	8	27779	27786	0 %	75 %	25 %	0 %	407484838
79	NC_018666	TCAG	2	8	28094	28101	25 %	25 %	25 %	25 %	407484838
80	NC_018666	GCTG	2	8	28978	28985	0 %	25 %	50 %	25 %	407484839
81	NC_018666	GCGA	2	8	29115	29122	25 %	0 %	50 %	25 %	407484839
82	NC_018666	CACT	2	8	29230	29237	25 %	25 %	0 %	50 %	407484839
83	NC_018666	TTAT	2	8	30038	30045	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018666	GAAA	2	8	30360	30367	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018666	GAGC	2	8	30602	30609	25 %	0 %	50 %	25 %	407484842
86	NC_018666	CGAA	2	8	30764	30771	50 %	0 %	25 %	25 %	407484843
87	NC_018666	TTAT	2	8	31263	31270	25 %	75 %	0 %	0 %	407484844
88	NC_018666	CGAC	2	8	31538	31545	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018666	AAAC	2	8	31895	31902	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_018666	AGAC	2	8	31974	31981	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_018666	ATGA	2	8	32168	32175	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018666	TCAG	2	8	32391	32398	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_018666	CAGG	2	8	32447	32454	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_018666	TGGG	2	8	32753	32760	0 %	25 %	75 %	0 %	407484845
95	NC_018666	TCAT	2	8	32763	32770	25 %	50 %	0 %	25 %	407484845
96	NC_018666	AGTC	2	8	33391	33398	25 %	25 %	25 %	25 %	407484845
97	NC_018666	AGTG	2	8	33543	33550	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018666	CGTC	2	8	33803	33810	0 %	25 %	25 %	50 %	407484846
99	NC_018666	CCAG	2	8	33896	33903	25 %	0 %	25 %	50 %	407484846
100	NC_018666	GGCG	2	8	34169	34176	0 %	0 %	75 %	25 %	407484846
101	NC_018666	CGCA	2	8	34186	34193	25 %	0 %	25 %	50 %	407484846
102	NC_018666	TCCA	2	8	34228	34235	25 %	25 %	0 %	50 %	407484846
103	NC_018666	CACT	2	8	34347	34354	25 %	25 %	0 %	50 %	407484846
104	NC_018666	TTTG	2	8	34602	34609	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018666	AAGG	2	8	34757	34764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018666	TGAT	2	8	36191	36198	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018666	CCAG	2	8	36367	36374	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_018666	GAGG	2	8	36468	36475	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018666	TCTG	2	8	36589	36596	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_018666	AATG	2	8	36632	36639	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018666	CTGT	2	8	37271	37278	0 %	50 %	25 %	25 %	407484851
112	NC_018666	GTCG	2	8	37367	37374	0 %	25 %	50 %	25 %	407484851
113	NC_018666	GGTA	2	8	37411	37418	25 %	25 %	50 %	0 %	407484851
114	NC_018666	GAGC	2	8	37807	37814	25 %	0 %	50 %	25 %	407484853
115	NC_018666	AGAA	2	8	37817	37824	75 %	0 %	25 %	0 %	407484853
116	NC_018666	GCCA	2	8	38008	38015	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_018666	TCTG	2	8	38324	38331	0 %	50 %	25 %	25 %	407484854
118	NC_018666	CGGG	2	8	38527	38534	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_018666	TGCA	2	8	38810	38817	25 %	25 %	25 %	25 %	407484855
120	NC_018666	GCTG	2	8	38997	39004	0 %	25 %	50 %	25 %	407484855
121	NC_018666	ATAA	2	8	39773	39780	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018666	AAAT	2	8	39820	39827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018666	TCCA	2	8	40161	40168	25 %	25 %	0 %	50 %	407484856
124	NC_018666	TGCC	2	8	40538	40545	0 %	25 %	25 %	50 %	407484857
125	NC_018666	GCCG	2	8	40916	40923	0 %	0 %	50 %	50 %	407484857
126	NC_018666	CTGG	2	8	41032	41039	0 %	25 %	50 %	25 %	407484858
127	NC_018666	CGCC	2	8	41396	41403	0 %	0 %	25 %	75 %	407484859
128	NC_018666	CCGG	2	8	41741	41748	0 %	0 %	50 %	50 %	407484859
129	NC_018666	CCTG	2	8	41763	41770	0 %	25 %	25 %	50 %	407484859
130	NC_018666	ATCC	2	8	42285	42292	25 %	25 %	0 %	50 %	407484859
131	NC_018666	TGCA	2	8	42424	42431	25 %	25 %	25 %	25 %	407484859
132	NC_018666	TTAT	2	8	42995	43002	25 %	75 %	0 %	0 %	407484860
133	NC_018666	TTTC	2	8	43184	43191	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_018666	GGCA	2	8	44344	44351	25 %	0 %	50 %	25 %	407484863
135	NC_018666	CAGC	2	8	45007	45014	25 %	0 %	25 %	50 %	407484864
136	NC_018666	AGGC	2	8	45015	45022	25 %	0 %	50 %	25 %	407484864
137	NC_018666	CCAC	2	8	45164	45171	25 %	0 %	0 %	75 %	407484864
138	NC_018666	CAGC	2	8	46106	46113	25 %	0 %	25 %	50 %	407484866
139	NC_018666	TCCG	2	8	46731	46738	0 %	25 %	25 %	50 %	407484866
140	NC_018666	CAGG	2	8	48584	48591	25 %	0 %	50 %	25 %	407484866
141	NC_018666	GCCC	2	8	48604	48611	0 %	0 %	25 %	75 %	407484866
142	NC_018666	TCGC	2	8	48711	48718	0 %	25 %	25 %	50 %	407484866
143	NC_018666	CCGG	2	8	48740	48747	0 %	0 %	50 %	50 %	407484866
144	NC_018666	CCAG	2	8	48944	48951	25 %	0 %	25 %	50 %	407484866
145	NC_018666	GCGA	2	8	49445	49452	25 %	0 %	50 %	25 %	407484866
146	NC_018666	TGCG	2	8	49952	49959	0 %	25 %	50 %	25 %	407484867
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.