MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pAA-EA11

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018666	GTTT	2	8	488	495	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018666	GTAT	2	8	2247	2254	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018666	TGTC	2	8	2287	2294	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018666	TGAT	2	8	2518	2525	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018666	CCAC	2	8	2755	2762	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_018666	ATAC	2	8	2935	2942	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018666	GCCA	2	8	4842	4849	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018666	CCTG	2	8	4905	4912	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018666	CTTG	2	8	4955	4962	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018666	CGAC	2	8	5043	5050	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018666	CAGA	2	8	5335	5342	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018666	GCCC	2	8	5367	5374	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_018666	GTAA	2	8	5392	5399	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018666	CCAC	2	8	5406	5413	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
15	NC_018666	TCTT	2	8	5648	5655	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018666	ATAA	2	8	6694	6701	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018666	TGAT	2	8	8171	8178	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018666	GCCA	2	8	8388	8395	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018666	GAAA	2	8	9429	9436	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018666	GCAT	2	8	10913	10920	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018666	TTGA	2	8	11155	11162	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018666	CAGC	2	8	15272	15279	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018666	GGAT	2	8	15564	15571	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018666	GTCA	2	8	15731	15738	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018666	GCCG	2	8	15835	15842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018666	AAAT	2	8	17355	17362	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018666	CAAT	2	8	17993	18000	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_018666	TAAT	2	8	18594	18601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018666	ATAA	2	8	18615	18622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018666	ATGT	2	8	21536	21543	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018666	GCTG	2	8	23083	23090	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018666	TAAT	2	8	23213	23220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018666	TGTA	2	8	27094	27101	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018666	TGTT	2	8	27703	27710	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018666	TTAT	2	8	30038	30045	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018666	GAAA	2	8	30360	30367	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018666	CGAC	2	8	31538	31545	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018666	AAAC	2	8	31895	31902	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018666	AGAC	2	8	31974	31981	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018666	ATGA	2	8	32168	32175	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018666	TCAG	2	8	32391	32398	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018666	CAGG	2	8	32447	32454	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018666	AGTG	2	8	33543	33550	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018666	TTTG	2	8	34602	34609	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018666	AAGG	2	8	34757	34764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018666	TGAT	2	8	36191	36198	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018666	CCAG	2	8	36367	36374	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018666	GAGG	2	8	36468	36475	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018666	TCTG	2	8	36589	36596	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018666	AATG	2	8	36632	36639	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018666	GCCA	2	8	38008	38015	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018666	CGGG	2	8	38527	38534	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018666	ATAA	2	8	39773	39780	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018666	AAAT	2	8	39820	39827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018666	TTTC	2	8	43184	43191	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018666	ACTC	2	8	50253	50260	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018666	GCTG	2	8	50669	50676	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018666	TGGC	2	8	50802	50809	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018666	TATT	2	8	51412	51419	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018666	TAAT	2	8	51570	51577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018666	ATTT	2	8	52077	52084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018666	AAAT	2	8	52294	52301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018666	AGAA	2	8	54569	54576	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018666	TCCA	2	8	55615	55622	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018666	TAAT	2	8	55632	55639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018666	AATG	2	8	59928	59935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018666	CATT	2	8	59992	59999	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018666	GAAG	2	8	64525	64532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018666	AGGA	2	8	64606	64613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018666	CTTT	2	8	64776	64783	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018666	ATTT	2	8	64867	64874	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018666	TCAG	2	8	70153	70160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_018666	AGTC	2	8	70295	70302	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018666	CTTT	2	8	71599	71606	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018666	TAGT	2	8	71778	71785	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018666	AGGC	2	8	72306	72313	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018666	ATTA	2	8	72689	72696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018666	TTGG	2	8	72848	72855	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018666	AGCC	2	8	72979	72986	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_018666	CAGC	2	8	73177	73184	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_018666	ATAA	2	8	73283	73290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018666	TGAT	2	8	74032	74039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.