MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pAA-EA11

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018666	GCCA	2	8	1349	1356	25 %	0 %	25 %	50 %	407484806
2	NC_018666	CCTT	2	8	1800	1807	0 %	50 %	0 %	50 %	407484807
3	NC_018666	GCCA	2	8	3473	3480	25 %	0 %	25 %	50 %	407484808
4	NC_018666	CAGC	2	8	4626	4633	25 %	0 %	25 %	50 %	407484808
5	NC_018666	GAAG	2	8	6976	6983	50 %	0 %	50 %	0 %	407484810
6	NC_018666	AATA	2	8	7026	7033	75 %	25 %	0 %	0 %	407484810
7	NC_018666	GTCA	2	8	7794	7801	25 %	25 %	25 %	25 %	407484811
8	NC_018666	GGAA	2	8	8029	8036	50 %	0 %	50 %	0 %	407484811
9	NC_018666	CTGA	2	8	8541	8548	25 %	25 %	25 %	25 %	407484812
10	NC_018666	GTTC	2	8	8907	8914	0 %	50 %	25 %	25 %	407484812
11	NC_018666	GCAT	2	8	8990	8997	25 %	25 %	25 %	25 %	407484812
12	NC_018666	CGAA	2	8	9173	9180	50 %	0 %	25 %	25 %	407484812
13	NC_018666	GCCA	2	8	10188	10195	25 %	0 %	25 %	50 %	407484813
14	NC_018666	CCTT	2	8	10639	10646	0 %	50 %	0 %	50 %	407484814
15	NC_018666	TGAT	2	8	10737	10744	25 %	50 %	25 %	0 %	407484815
16	NC_018666	AATG	2	8	10759	10766	50 %	25 %	25 %	0 %	407484815
17	NC_018666	TTCT	2	8	12579	12586	0 %	75 %	0 %	25 %	407484818
18	NC_018666	TAAA	2	8	12737	12744	75 %	25 %	0 %	0 %	407484818
19	NC_018666	TAAT	2	8	12886	12893	50 %	50 %	0 %	0 %	407484818
20	NC_018666	ACTG	2	8	13550	13557	25 %	25 %	25 %	25 %	407484819
21	NC_018666	GATT	2	8	13703	13710	25 %	50 %	25 %	0 %	407484819
22	NC_018666	CAGT	2	8	14763	14770	25 %	25 %	25 %	25 %	407484822
23	NC_018666	GCGA	2	8	16968	16975	25 %	0 %	50 %	25 %	407484824
24	NC_018666	CTAA	2	8	18466	18473	50 %	25 %	0 %	25 %	407484827
25	NC_018666	TTCT	2	8	18493	18500	0 %	75 %	0 %	25 %	407484827
26	NC_018666	TACA	2	8	19078	19085	50 %	25 %	0 %	25 %	407484829
27	NC_018666	ACTG	2	8	19151	19158	25 %	25 %	25 %	25 %	407484829
28	NC_018666	TTTC	2	8	19264	19271	0 %	75 %	0 %	25 %	407484829
29	NC_018666	GCCA	2	8	19523	19530	25 %	0 %	25 %	50 %	407484829
30	NC_018666	CGCC	2	8	20074	20081	0 %	0 %	25 %	75 %	407484829
31	NC_018666	AATG	2	8	20203	20210	50 %	25 %	25 %	0 %	407484829
32	NC_018666	ACTT	2	8	20415	20422	25 %	50 %	0 %	25 %	407484829
33	NC_018666	CATA	2	8	20459	20466	50 %	25 %	0 %	25 %	407484829
34	NC_018666	TAAT	2	8	21322	21329	50 %	50 %	0 %	0 %	407484829
35	NC_018666	ATTT	2	8	21825	21832	25 %	75 %	0 %	0 %	407484830
36	NC_018666	ACGA	2	8	21895	21902	50 %	0 %	25 %	25 %	407484830
37	NC_018666	ATTT	2	8	23224	23231	25 %	75 %	0 %	0 %	407484832
38	NC_018666	TCGA	2	8	23288	23295	25 %	25 %	25 %	25 %	407484832
39	NC_018666	TCAC	2	8	24264	24271	25 %	25 %	0 %	50 %	407484833
40	NC_018666	GCTG	2	8	25341	25348	0 %	25 %	50 %	25 %	407484834
41	NC_018666	TAAC	2	8	25855	25862	50 %	25 %	0 %	25 %	407484835
42	NC_018666	ATTT	2	8	25975	25982	25 %	75 %	0 %	0 %	407484835
43	NC_018666	CTTT	2	8	26601	26608	0 %	75 %	0 %	25 %	407484836
44	NC_018666	TGTT	2	8	27779	27786	0 %	75 %	25 %	0 %	407484838
45	NC_018666	TCAG	2	8	28094	28101	25 %	25 %	25 %	25 %	407484838
46	NC_018666	GCTG	2	8	28978	28985	0 %	25 %	50 %	25 %	407484839
47	NC_018666	GCGA	2	8	29115	29122	25 %	0 %	50 %	25 %	407484839
48	NC_018666	CACT	2	8	29230	29237	25 %	25 %	0 %	50 %	407484839
49	NC_018666	GAGC	2	8	30602	30609	25 %	0 %	50 %	25 %	407484842
50	NC_018666	CGAA	2	8	30764	30771	50 %	0 %	25 %	25 %	407484843
51	NC_018666	TTAT	2	8	31263	31270	25 %	75 %	0 %	0 %	407484844
52	NC_018666	TGGG	2	8	32753	32760	0 %	25 %	75 %	0 %	407484845
53	NC_018666	TCAT	2	8	32763	32770	25 %	50 %	0 %	25 %	407484845
54	NC_018666	AGTC	2	8	33391	33398	25 %	25 %	25 %	25 %	407484845
55	NC_018666	CGTC	2	8	33803	33810	0 %	25 %	25 %	50 %	407484846
56	NC_018666	CCAG	2	8	33896	33903	25 %	0 %	25 %	50 %	407484846
57	NC_018666	GGCG	2	8	34169	34176	0 %	0 %	75 %	25 %	407484846
58	NC_018666	CGCA	2	8	34186	34193	25 %	0 %	25 %	50 %	407484846
59	NC_018666	TCCA	2	8	34228	34235	25 %	25 %	0 %	50 %	407484846
60	NC_018666	CACT	2	8	34347	34354	25 %	25 %	0 %	50 %	407484846
61	NC_018666	CTGT	2	8	37271	37278	0 %	50 %	25 %	25 %	407484851
62	NC_018666	GTCG	2	8	37367	37374	0 %	25 %	50 %	25 %	407484851
63	NC_018666	GGTA	2	8	37411	37418	25 %	25 %	50 %	0 %	407484851
64	NC_018666	GAGC	2	8	37807	37814	25 %	0 %	50 %	25 %	407484853
65	NC_018666	AGAA	2	8	37817	37824	75 %	0 %	25 %	0 %	407484853
66	NC_018666	TCTG	2	8	38324	38331	0 %	50 %	25 %	25 %	407484854
67	NC_018666	TGCA	2	8	38810	38817	25 %	25 %	25 %	25 %	407484855
68	NC_018666	GCTG	2	8	38997	39004	0 %	25 %	50 %	25 %	407484855
69	NC_018666	TCCA	2	8	40161	40168	25 %	25 %	0 %	50 %	407484856
70	NC_018666	TGCC	2	8	40538	40545	0 %	25 %	25 %	50 %	407484857
71	NC_018666	GCCG	2	8	40916	40923	0 %	0 %	50 %	50 %	407484857
72	NC_018666	CTGG	2	8	41032	41039	0 %	25 %	50 %	25 %	407484858
73	NC_018666	CGCC	2	8	41396	41403	0 %	0 %	25 %	75 %	407484859
74	NC_018666	CCGG	2	8	41741	41748	0 %	0 %	50 %	50 %	407484859
75	NC_018666	CCTG	2	8	41763	41770	0 %	25 %	25 %	50 %	407484859
76	NC_018666	ATCC	2	8	42285	42292	25 %	25 %	0 %	50 %	407484859
77	NC_018666	TGCA	2	8	42424	42431	25 %	25 %	25 %	25 %	407484859
78	NC_018666	TTAT	2	8	42995	43002	25 %	75 %	0 %	0 %	407484860
79	NC_018666	GGCA	2	8	44344	44351	25 %	0 %	50 %	25 %	407484863
80	NC_018666	CAGC	2	8	45007	45014	25 %	0 %	25 %	50 %	407484864
81	NC_018666	AGGC	2	8	45015	45022	25 %	0 %	50 %	25 %	407484864
82	NC_018666	CCAC	2	8	45164	45171	25 %	0 %	0 %	75 %	407484864
83	NC_018666	CAGC	2	8	46106	46113	25 %	0 %	25 %	50 %	407484866
84	NC_018666	TCCG	2	8	46731	46738	0 %	25 %	25 %	50 %	407484866
85	NC_018666	CAGG	2	8	48584	48591	25 %	0 %	50 %	25 %	407484866
86	NC_018666	GCCC	2	8	48604	48611	0 %	0 %	25 %	75 %	407484866
87	NC_018666	TCGC	2	8	48711	48718	0 %	25 %	25 %	50 %	407484866
88	NC_018666	CCGG	2	8	48740	48747	0 %	0 %	50 %	50 %	407484866
89	NC_018666	CCAG	2	8	48944	48951	25 %	0 %	25 %	50 %	407484866
90	NC_018666	GCGA	2	8	49445	49452	25 %	0 %	50 %	25 %	407484866
91	NC_018666	TGCG	2	8	49952	49959	0 %	25 %	50 %	25 %	407484867
92	NC_018666	AAAT	2	8	53550	53557	75 %	25 %	0 %	0 %	407484871
93	NC_018666	AATA	2	8	55096	55103	75 %	25 %	0 %	0 %	407484872
94	NC_018666	GACT	2	8	55142	55149	25 %	25 %	25 %	25 %	407484872
95	NC_018666	GCCT	2	8	56012	56019	0 %	25 %	25 %	50 %	407484873
96	NC_018666	AACT	2	8	56538	56545	50 %	25 %	0 %	25 %	407484873
97	NC_018666	GAAA	2	8	56717	56724	75 %	0 %	25 %	0 %	407484873
98	NC_018666	ATGG	2	8	56865	56872	25 %	25 %	50 %	0 %	407484873
99	NC_018666	CCAG	2	8	57701	57708	25 %	0 %	25 %	50 %	407484873
100	NC_018666	AAAC	2	8	58680	58687	75 %	0 %	0 %	25 %	407484873
101	NC_018666	TCCT	2	8	58909	58916	0 %	50 %	0 %	50 %	407484873
102	NC_018666	AATG	2	8	58995	59002	50 %	25 %	25 %	0 %	407484873
103	NC_018666	ATTT	2	8	59090	59097	25 %	75 %	0 %	0 %	407484873
104	NC_018666	GTGG	2	8	59167	59174	0 %	25 %	75 %	0 %	407484873
105	NC_018666	TTAT	2	8	60058	60065	25 %	75 %	0 %	0 %	407484874
106	NC_018666	GCAG	2	8	62155	62162	25 %	0 %	50 %	25 %	407484877
107	NC_018666	GTCT	2	8	62573	62580	0 %	50 %	25 %	25 %	407484877
108	NC_018666	GAAA	2	8	62583	62590	75 %	0 %	25 %	0 %	407484877
109	NC_018666	CGGT	2	8	63040	63047	0 %	25 %	50 %	25 %	407484878
110	NC_018666	TGAT	2	8	63439	63446	25 %	50 %	25 %	0 %	407484878
111	NC_018666	TCTG	2	8	63685	63692	0 %	50 %	25 %	25 %	407484878
112	NC_018666	TAAA	2	8	64964	64971	75 %	25 %	0 %	0 %	407484879
113	NC_018666	CAAT	2	8	65852	65859	50 %	25 %	0 %	25 %	407484879
114	NC_018666	ACTC	2	8	66096	66103	25 %	25 %	0 %	50 %	407484879
115	NC_018666	ATTC	2	8	66850	66857	25 %	50 %	0 %	25 %	407484881
116	NC_018666	CTAG	2	8	67320	67327	25 %	25 %	25 %	25 %	407484881
117	NC_018666	TCTT	2	8	67365	67372	0 %	75 %	0 %	25 %	407484881
118	NC_018666	AGTT	2	8	67716	67723	25 %	50 %	25 %	0 %	407484882
119	NC_018666	TTTC	2	8	67805	67812	0 %	75 %	0 %	25 %	407484882
120	NC_018666	ATAA	2	8	67982	67989	75 %	25 %	0 %	0 %	407484882
121	NC_018666	ATTA	2	8	68382	68389	50 %	50 %	0 %	0 %	407484882
122	NC_018666	ATAA	2	8	68501	68508	75 %	25 %	0 %	0 %	407484882
123	NC_018666	CTGT	2	8	68515	68522	0 %	50 %	25 %	25 %	407484882
124	NC_018666	ATTG	2	8	68537	68544	25 %	50 %	25 %	0 %	407484882
125	NC_018666	GAAA	2	8	68666	68673	75 %	0 %	25 %	0 %	407484882
126	NC_018666	TTTC	2	8	69004	69011	0 %	75 %	0 %	25 %	407484883
127	NC_018666	CAGA	2	8	69100	69107	50 %	0 %	25 %	25 %	407484883
128	NC_018666	AAGA	2	8	69272	69279	75 %	0 %	25 %	0 %	407484883
129	NC_018666	GAAA	2	8	69623	69630	75 %	0 %	25 %	0 %	407484883

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.