MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pAA-EA11

Total Repeats: 947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018666	CAC	2	6	28	33	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_018666	TTC	2	6	106	111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018666	GCT	2	6	121	126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018666	TCA	2	6	161	166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018666	AAT	2	6	231	236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018666	GCT	2	6	271	276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018666	TTG	2	6	469	474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018666	TTC	2	6	505	510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018666	TTC	2	6	635	640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018666	TTC	2	6	725	730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018666	CAG	2	6	847	852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484806
12	NC_018666	TGA	2	6	891	896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484806
13	NC_018666	TGC	2	6	977	982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484806
14	NC_018666	CTC	2	6	1045	1050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484806
15	NC_018666	CTC	2	6	1096	1101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484806
16	NC_018666	GGT	2	6	1150	1155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484806
17	NC_018666	TGC	2	6	1262	1267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484806
18	NC_018666	ATG	2	6	1298	1303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484806
19	NC_018666	CCA	2	6	1311	1316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484806
20	NC_018666	TCA	2	6	1329	1334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484806
21	NC_018666	TGC	2	6	1394	1399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484806
22	NC_018666	ATG	2	6	1421	1426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484806
23	NC_018666	GTG	2	6	1427	1432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484806
24	NC_018666	TGC	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484806
25	NC_018666	GCA	2	6	1554	1559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484806
26	NC_018666	ATG	2	6	1736	1741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484806
27	NC_018666	ATG	2	6	1769	1774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484807
28	NC_018666	ATT	3	9	1819	1827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484807
29	NC_018666	TAT	2	6	1879	1884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018666	ATA	2	6	1888	1893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018666	TAT	2	6	1974	1979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018666	CCT	2	6	1985	1990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_018666	AGG	2	6	1994	1999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018666	GGC	2	6	2000	2005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018666	ATT	2	6	2037	2042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018666	GGT	2	6	2157	2162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018666	TAT	2	6	2307	2312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018666	CAA	2	6	2323	2328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018666	GTT	2	6	2343	2348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018666	ATA	2	6	2441	2446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018666	ACC	2	6	2591	2596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_018666	ATC	2	6	2660	2665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018666	ATA	2	6	2681	2686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018666	GGA	2	6	2706	2711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018666	TCG	2	6	2735	2740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018666	ATG	2	6	3081	3086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018666	CTC	2	6	3163	3168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_018666	GCC	2	6	3303	3308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484808
49	NC_018666	CTT	2	6	3319	3324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484808
50	NC_018666	CCA	2	6	3333	3338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484808
51	NC_018666	CGC	2	6	3354	3359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484808
52	NC_018666	ACC	3	9	3429	3437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484808
53	NC_018666	TCA	2	6	3438	3443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484808
54	NC_018666	GTT	2	6	3585	3590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484808
55	NC_018666	GCG	2	6	3647	3652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484808
56	NC_018666	CTC	2	6	3826	3831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484808
57	NC_018666	ATC	2	6	3880	3885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484808
58	NC_018666	CCG	2	6	3936	3941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484808
59	NC_018666	ACC	2	6	3975	3980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484808
60	NC_018666	ATG	2	6	4043	4048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484808
61	NC_018666	ATA	2	6	4053	4058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484808
62	NC_018666	GCG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484808
63	NC_018666	GCC	2	6	4097	4102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484808
64	NC_018666	CAG	2	6	4147	4152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484808
65	NC_018666	GCG	2	6	4180	4185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484808
66	NC_018666	TCA	2	6	4194	4199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484808
67	NC_018666	GAT	2	6	4206	4211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484808
68	NC_018666	GTG	2	6	4309	4314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484808
69	NC_018666	TGA	2	6	4600	4605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484808
70	NC_018666	CGC	2	6	4618	4623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484808
71	NC_018666	GCA	2	6	4656	4661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484808
72	NC_018666	ACT	2	6	4825	4830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018666	GAG	2	6	4927	4932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018666	GCT	2	6	5003	5008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018666	TCC	2	6	5074	5079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_018666	GTG	2	6	5107	5112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018666	TTC	2	6	5151	5156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018666	ATC	2	6	5182	5187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018666	TTG	2	6	5296	5301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018666	AAC	2	6	5582	5587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018666	TGC	2	6	5669	5674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018666	GAT	2	6	5697	5702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018666	CAG	2	6	5794	5799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018666	CAT	2	6	5803	5808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484809
85	NC_018666	CTC	2	6	5829	5834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484809
86	NC_018666	GCG	2	6	5877	5882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484809
87	NC_018666	GGT	2	6	5931	5936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484809
88	NC_018666	ATT	2	6	6231	6236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018666	TTC	2	6	6254	6259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018666	TAT	2	6	6344	6349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018666	GCC	2	6	6359	6364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_018666	GGC	2	6	6394	6399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018666	TGT	3	9	6469	6477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018666	CAG	2	6	6498	6503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018666	GAT	2	6	6578	6583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018666	TAA	2	6	6757	6762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018666	AGA	2	6	7052	7057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484810
98	NC_018666	AGC	2	6	7093	7098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484810
99	NC_018666	TGA	2	6	7127	7132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484810
100	NC_018666	AAT	2	6	7188	7193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484810
101	NC_018666	ATG	2	6	7247	7252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484810
102	NC_018666	ACA	2	6	7301	7306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407484810
103	NC_018666	CTT	2	6	7344	7349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484810
104	NC_018666	TAT	2	6	7407	7412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484810
105	NC_018666	AGC	2	6	7512	7517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484810
106	NC_018666	CAT	2	6	7583	7588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484810
107	NC_018666	ATT	2	6	7679	7684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018666	ATG	2	6	7955	7960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484811
109	NC_018666	GTT	2	6	8002	8007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484811
110	NC_018666	GAA	2	6	8014	8019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484811
111	NC_018666	TGC	2	6	8050	8055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484811
112	NC_018666	GTT	2	6	8066	8071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484811
113	NC_018666	CCA	2	6	8147	8152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484811
114	NC_018666	TGA	2	6	8248	8253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018666	TCA	2	6	8303	8308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018666	TCA	2	6	8328	8333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018666	ACT	2	6	8364	8369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018666	CTG	2	6	8428	8433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484812
119	NC_018666	TGT	2	6	8434	8439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484812
120	NC_018666	TTG	2	6	8465	8470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484812
121	NC_018666	TAC	2	6	8485	8490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484812
122	NC_018666	CAA	2	6	8509	8514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407484812
123	NC_018666	ACC	2	6	8644	8649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484812
124	NC_018666	AGC	2	6	8683	8688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484812
125	NC_018666	TCA	2	6	8795	8800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484812
126	NC_018666	CTG	2	6	9064	9069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484812
127	NC_018666	TTG	2	6	9152	9157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484812
128	NC_018666	GCA	2	6	9326	9331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018666	ATG	2	6	9412	9417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018666	TCT	2	6	9419	9424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018666	CTA	2	6	9443	9448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018666	TTC	2	6	9474	9479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018666	TTC	2	6	9564	9569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018666	CAG	2	6	9686	9691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484813
135	NC_018666	TGA	2	6	9730	9735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484813
136	NC_018666	TGC	2	6	9816	9821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484813
137	NC_018666	CTC	2	6	9884	9889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484813
138	NC_018666	CTC	2	6	9935	9940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484813
139	NC_018666	GGT	2	6	9989	9994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484813
140	NC_018666	TGC	2	6	10101	10106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484813
141	NC_018666	ATG	2	6	10137	10142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484813
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156	NC_018666	TTA	2	6	10929	10934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018666	ATA	2	6	10958	10963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018666	ATA	2	6	11037	11042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_018666	ATG	2	6	11058	11063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_018666	CAT	2	6	11382	11387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_018666	TCA	3	9	11563	11571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484816
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263	NC_018666	GTT	2	6	18424	18429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484827
264	NC_018666	TGT	2	6	18430	18435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484827
265	NC_018666	AGA	2	6	18460	18465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484827
266	NC_018666	ATT	2	6	18579	18584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_018666	TAT	2	6	18585	18590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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380	NC_018666	GAA	2	6	27319	27324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
381	NC_018666	AAT	2	6	27428	27433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484837
382	NC_018666	GAC	2	6	27547	27552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484837
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389	NC_018666	TCT	2	6	27984	27989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484838
390	NC_018666	CAA	2	6	28350	28355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407484838
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393	NC_018666	TTA	2	6	28929	28934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484839
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500	NC_018666	CCA	2	6	39048	39053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484855

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